MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899b

Total Repeats: 7982

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_020061	CAT	2	6	70342	70347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222526
1003	NC_020061	GTA	2	6	70357	70362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222526
1004	NC_020061	CAGC	2	8	70392	70399	25 %	0 %	25 %	50 %	440222526
1005	NC_020061	TGG	2	6	70905	70910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222527
1006	NC_020061	GCC	2	6	70937	70942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222527
1007	NC_020061	TTC	2	6	70981	70986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222527
1008	NC_020061	GCA	2	6	71001	71006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222527
1009	NC_020061	GGCC	2	8	71016	71023	0 %	0 %	50 %	50 %	440222527
1010	NC_020061	TCG	2	6	71027	71032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222527
1011	NC_020061	CAG	2	6	71074	71079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222527
1012	NC_020061	CGC	2	6	71083	71088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222527
1013	NC_020061	CGC	2	6	71100	71105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222527
1014	NC_020061	CG	4	8	71192	71199	0 %	0 %	50 %	50 %	440222527
1015	NC_020061	ATCGA	2	10	71261	71270	40 %	20 %	20 %	20 %	440222527
1016	NC_020061	GC	3	6	71322	71327	0 %	0 %	50 %	50 %	440222527
1017	NC_020061	GC	3	6	71333	71338	0 %	0 %	50 %	50 %	440222527
1018	NC_020061	AGT	2	6	71349	71354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222527
1019	NC_020061	TCG	2	6	71363	71368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222527
1020	NC_020061	GC	3	6	71451	71456	0 %	0 %	50 %	50 %	440222527
1021	NC_020061	GCT	2	6	71496	71501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222527
1022	NC_020061	TCG	2	6	71531	71536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222527
1023	NC_020061	CAG	2	6	71545	71550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222527
1024	NC_020061	GCC	2	6	71659	71664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222527
1025	NC_020061	TCG	2	6	71687	71692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222527
1026	NC_020061	CTG	2	6	71728	71733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222527
1027	NC_020061	GC	3	6	71736	71741	0 %	0 %	50 %	50 %	440222527
1028	NC_020061	GCT	2	6	71761	71766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222528
1029	NC_020061	GC	3	6	71782	71787	0 %	0 %	50 %	50 %	440222528
1030	NC_020061	GCG	2	6	71876	71881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222528
1031	NC_020061	GGCG	2	8	71906	71913	0 %	0 %	75 %	25 %	440222528
1032	NC_020061	CCA	2	6	71936	71941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222528
1033	NC_020061	GC	5	10	71952	71961	0 %	0 %	50 %	50 %	440222528
1034	NC_020061	TTC	2	6	71970	71975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222528
1035	NC_020061	CATC	2	8	71981	71988	25 %	25 %	0 %	50 %	440222528
1036	NC_020061	GCC	2	6	72051	72056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222528
1037	NC_020061	GTC	2	6	72057	72062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222528
1038	NC_020061	GCA	2	6	72074	72079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222528
1039	NC_020061	GCC	2	6	72082	72087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222528
1040	NC_020061	GC	4	8	72089	72096	0 %	0 %	50 %	50 %	440222528
1041	NC_020061	TCG	2	6	72097	72102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222528
1042	NC_020061	TTGC	2	8	72111	72118	0 %	50 %	25 %	25 %	440222528
1043	NC_020061	CAGCG	2	10	72126	72135	20 %	0 %	40 %	40 %	440222528
1044	NC_020061	CGG	2	6	72233	72238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222528
1045	NC_020061	C	6	6	72327	72332	0 %	0 %	0 %	100 %	440222528
1046	NC_020061	CACAA	2	10	72391	72400	60 %	0 %	0 %	40 %	440222528
1047	NC_020061	CGG	2	6	72401	72406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222528
1048	NC_020061	GTC	2	6	72408	72413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222528
1049	NC_020061	CGG	2	6	72419	72424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222528
1050	NC_020061	GGCC	2	8	72435	72442	0 %	0 %	50 %	50 %	440222528
1051	NC_020061	CG	3	6	72648	72653	0 %	0 %	50 %	50 %	440222528
1052	NC_020061	GCG	2	6	72662	72667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222528
1053	NC_020061	TAC	2	6	72678	72683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222528
1054	NC_020061	CACGC	2	10	72692	72701	20 %	0 %	20 %	60 %	440222528
1055	NC_020061	GCC	2	6	72709	72714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222528
1056	NC_020061	TGC	2	6	72728	72733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222528
1057	NC_020061	GGT	2	6	72753	72758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222528
1058	NC_020061	GCA	2	6	72788	72793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222528
1059	NC_020061	ACGCC	2	10	72881	72890	20 %	0 %	20 %	60 %	440222528
1060	NC_020061	CGC	2	6	72911	72916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222528
1061	NC_020061	GGA	2	6	72995	73000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222528
1062	NC_020061	GCA	2	6	73027	73032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222528
1063	NC_020061	GAA	2	6	73037	73042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222528
1064	NC_020061	GCC	2	6	73069	73074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222528
1065	NC_020061	TGC	2	6	73135	73140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222528
1066	NC_020061	GACG	2	8	73215	73222	25 %	0 %	50 %	25 %	440222528
1067	NC_020061	CGC	3	9	73229	73237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222528
1068	NC_020061	CAG	2	6	73254	73259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222528
1069	NC_020061	GCGT	2	8	73496	73503	0 %	25 %	50 %	25 %	440222529
1070	NC_020061	TCC	2	6	73577	73582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440222529
1071	NC_020061	CGA	2	6	73602	73607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222529
1072	NC_020061	GC	3	6	73612	73617	0 %	0 %	50 %	50 %	440222529
1073	NC_020061	GCC	2	6	73658	73663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222529
1074	NC_020061	GTC	2	6	73720	73725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222529
1075	NC_020061	ACC	2	6	73727	73732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222529
1076	NC_020061	TCC	2	6	73799	73804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440222529
1077	NC_020061	CG	3	6	73837	73842	0 %	0 %	50 %	50 %	440222529
1078	NC_020061	CGG	2	6	73947	73952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222529
1079	NC_020061	CTGC	2	8	73956	73963	0 %	25 %	25 %	50 %	440222529
1080	NC_020061	CGT	3	9	74115	74123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222529
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1082	NC_020061	CAT	2	6	74164	74169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222529
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1084	NC_020061	CGA	2	6	74184	74189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222529
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1086	NC_020061	GTAGC	2	10	74273	74282	20 %	20 %	40 %	20 %	440222529
1087	NC_020061	CGC	2	6	74287	74292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222529
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1092	NC_020061	CCG	2	6	74426	74431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222529
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1095	NC_020061	GGT	2	6	74742	74747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222530
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1098	NC_020061	GCA	2	6	74856	74861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222530
1099	NC_020061	GCA	2	6	74880	74885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222530
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1102	NC_020061	CCT	2	6	75069	75074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440222530
1103	NC_020061	CGA	2	6	75075	75080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222530
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1105	NC_020061	AGC	3	9	75161	75169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222530
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1107	NC_020061	GC	3	6	75256	75261	0 %	0 %	50 %	50 %	440222530
1108	NC_020061	GC	6	12	75267	75278	0 %	0 %	50 %	50 %	440222530
1109	NC_020061	GCG	2	6	75320	75325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222530
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1111	NC_020061	GCA	2	6	75381	75386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222530
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1113	NC_020061	GC	3	6	75618	75623	0 %	0 %	50 %	50 %	440222530
1114	NC_020061	AACGCA	2	12	75710	75721	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	440222530
1115	NC_020061	TCA	2	6	75738	75743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222530
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1117	NC_020061	CG	3	6	75796	75801	0 %	0 %	50 %	50 %	440222530
1118	NC_020061	GCA	2	6	75804	75809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222530
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1122	NC_020061	CGG	2	6	75956	75961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222531
1123	NC_020061	CG	3	6	75976	75981	0 %	0 %	50 %	50 %	440222531
1124	NC_020061	CCA	2	6	75994	75999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222531
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1126	NC_020061	TGA	2	6	76058	76063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222531
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1251	NC_020061	ATC	2	6	84568	84573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222539
1252	NC_020061	GCC	2	6	84614	84619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222539
1253	NC_020061	TGGTG	2	10	84636	84645	0 %	40 %	60 %	0 %	440222539
1254	NC_020061	A	6	6	84750	84755	100 %	0 %	0 %	0 %	440222539
1255	NC_020061	ACG	2	6	84779	84784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222539
1256	NC_020061	GCA	2	6	84846	84851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222539
1257	NC_020061	ATG	2	6	84890	84895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222539
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1260	NC_020061	CTT	2	6	85086	85091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222539
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1264	NC_020061	AAC	2	6	86087	86092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440222540
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1268	NC_020061	GCA	2	6	86289	86294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222540
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1270	NC_020061	GGC	2	6	86340	86345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222540
1271	NC_020061	CTGC	2	8	86455	86462	0 %	25 %	25 %	50 %	440222540
1272	NC_020061	CTGC	2	8	86479	86486	0 %	25 %	25 %	50 %	440222540
1273	NC_020061	GGC	2	6	86501	86506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222540
1274	NC_020061	AAGG	2	8	86558	86565	50 %	0 %	50 %	0 %	440222540
1275	NC_020061	CCTG	2	8	86572	86579	0 %	25 %	25 %	50 %	440222540
1276	NC_020061	CGGCTA	2	12	86662	86673	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	440222540
1277	NC_020061	AAGA	2	8	86738	86745	75 %	0 %	25 %	0 %	440222540
1278	NC_020061	CGTCT	2	10	86746	86755	0 %	40 %	20 %	40 %	440222540
1279	NC_020061	CGC	2	6	86756	86761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222540
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1282	NC_020061	GC	3	6	86988	86993	0 %	0 %	50 %	50 %	440222540
1283	NC_020061	CG	3	6	87011	87016	0 %	0 %	50 %	50 %	440222540
1284	NC_020061	ACC	2	6	87069	87074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222540
1285	NC_020061	ATC	2	6	87105	87110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222540
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1290	NC_020061	TGC	2	6	87304	87309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222540
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1319	NC_020061	ATCG	2	8	89693	89700	25 %	25 %	25 %	25 %	440222543
1320	NC_020061	TACG	2	8	89729	89736	25 %	25 %	25 %	25 %	440222543
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1333	NC_020061	AC	3	6	90639	90644	50 %	0 %	0 %	50 %	440222544
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1362	NC_020061	GCG	2	6	94365	94370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222549
1363	NC_020061	GGCC	2	8	94415	94422	0 %	0 %	50 %	50 %	440222549
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1370	NC_020061	C	6	6	94644	94649	0 %	0 %	0 %	100 %	440222549
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1373	NC_020061	CGGCG	2	10	94674	94683	0 %	0 %	60 %	40 %	440222549
1374	NC_020061	T	6	6	94691	94696	0 %	100 %	0 %	0 %	440222549
1375	NC_020061	GAT	2	6	94749	94754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222549
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1377	NC_020061	CCT	2	6	94883	94888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440222549
1378	NC_020061	GA	3	6	94902	94907	50 %	0 %	50 %	0 %	440222549
1379	NC_020061	CGT	3	9	94916	94924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222549
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1410	NC_020061	GCC	2	6	97187	97192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222551
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1481	NC_020061	GCA	2	6	102312	102317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222557
1482	NC_020061	TGCGA	2	10	103374	103383	20 %	20 %	40 %	20 %	440222558
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1490	NC_020061	A	7	7	103864	103870	100 %	0 %	0 %	0 %	440222558
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1492	NC_020061	GCAA	2	8	103915	103922	50 %	0 %	25 %	25 %	440222558
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1497	NC_020061	CAA	2	6	104204	104209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440222559
1498	NC_020061	TCG	2	6	104212	104217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222559
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1500	NC_020061	ACG	2	6	104335	104340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222559

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