MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899b

Total Repeats: 7982

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_020061	CGA	2	6	525110	525115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222932
7502	NC_020061	AAGCA	2	10	525132	525141	60 %	0 %	20 %	20 %	440222932
7503	NC_020061	GCG	2	6	525142	525147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222932
7504	NC_020061	GCC	2	6	525152	525157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222932
7505	NC_020061	GCC	2	6	525245	525250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222932
7506	NC_020061	TTCGG	2	10	525333	525342	0 %	40 %	40 %	20 %	440222932
7507	NC_020061	GCA	2	6	525408	525413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222932
7508	NC_020061	GCCG	2	8	525458	525465	0 %	0 %	50 %	50 %	440222932
7509	NC_020061	CG	3	6	525570	525575	0 %	0 %	50 %	50 %	440222932
7510	NC_020061	GAT	2	6	525599	525604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222932
7511	NC_020061	CGA	2	6	525607	525612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222932
7512	NC_020061	GGC	2	6	525665	525670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222932
7513	NC_020061	CAT	2	6	525731	525736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222932
7514	NC_020061	CAG	2	6	525758	525763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222932
7515	NC_020061	TC	5	10	525775	525784	0 %	50 %	0 %	50 %	440222932
7516	NC_020061	GCG	2	6	525805	525810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222933
7517	NC_020061	GC	3	6	525843	525848	0 %	0 %	50 %	50 %	440222933
7518	NC_020061	GGC	2	6	525849	525854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222933
7519	NC_020061	GAG	2	6	525861	525866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222933
7520	NC_020061	AGC	3	9	525871	525879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222933
7521	NC_020061	GC	4	8	525878	525885	0 %	0 %	50 %	50 %	440222933
7522	NC_020061	TGA	2	6	525908	525913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222933
7523	NC_020061	GCC	2	6	525918	525923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222933
7524	NC_020061	CG	3	6	525938	525943	0 %	0 %	50 %	50 %	440222933
7525	NC_020061	CTT	2	6	525948	525953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222933
7526	NC_020061	GCG	2	6	526034	526039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222934
7527	NC_020061	GC	3	6	526041	526046	0 %	0 %	50 %	50 %	440222934
7528	NC_020061	TGC	2	6	526129	526134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222934
7529	NC_020061	TCG	2	6	526148	526153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222934
7530	NC_020061	TCG	2	6	526253	526258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222934
7531	NC_020061	TTC	2	6	526277	526282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222934
7532	NC_020061	TCG	2	6	526569	526574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222935
7533	NC_020061	GCTGT	2	10	526595	526604	0 %	40 %	40 %	20 %	440222935
7534	NC_020061	CGG	2	6	526605	526610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222935
7535	NC_020061	TGC	2	6	526683	526688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222935
7536	NC_020061	GAG	2	6	526691	526696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222935
7537	NC_020061	GAT	2	6	526735	526740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222935
7538	NC_020061	CCGA	2	8	526743	526750	25 %	0 %	25 %	50 %	440222935
7539	NC_020061	TGA	2	6	526974	526979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222935
7540	NC_020061	AAG	2	6	527018	527023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222935
7541	NC_020061	GGC	2	6	527042	527047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222935
7542	NC_020061	CGA	2	6	527104	527109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222935
7543	NC_020061	GC	4	8	527159	527166	0 %	0 %	50 %	50 %	440222935
7544	NC_020061	CGG	2	6	527271	527276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222935
7545	NC_020061	AGG	2	6	527316	527321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222935
7546	NC_020061	CGCC	2	8	527338	527345	0 %	0 %	25 %	75 %	440222935
7547	NC_020061	CGA	2	6	527404	527409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222935
7548	NC_020061	TCC	2	6	527427	527432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440222935
7549	NC_020061	GAC	2	6	527444	527449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222935
7550	NC_020061	GGC	2	6	527534	527539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222935
7551	NC_020061	CGA	2	6	527550	527555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222935
7552	NC_020061	ACG	2	6	527561	527566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222935
7553	NC_020061	CTGG	2	8	527611	527618	0 %	25 %	50 %	25 %	440222935
7554	NC_020061	CGCC	2	8	527668	527675	0 %	0 %	25 %	75 %	440222935
7555	NC_020061	AGA	2	6	527697	527702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222935
7556	NC_020061	CGG	2	6	527722	527727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222935
7557	NC_020061	GAC	2	6	527770	527775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222935
7558	NC_020061	GAT	2	6	527776	527781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222935
7559	NC_020061	GGC	2	6	527785	527790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222935
7560	NC_020061	GC	3	6	527789	527794	0 %	0 %	50 %	50 %	440222935
7561	NC_020061	CGT	2	6	527821	527826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222935
7562	NC_020061	CGG	2	6	527827	527832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222935
7563	NC_020061	GCC	2	6	527849	527854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222935
7564	NC_020061	GAAG	2	8	527866	527873	50 %	0 %	50 %	0 %	440222935
7565	NC_020061	TC	3	6	527881	527886	0 %	50 %	0 %	50 %	440222935
7566	NC_020061	TCA	2	6	527897	527902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222935
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7568	NC_020061	CGA	2	6	527962	527967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222935
7569	NC_020061	GTC	2	6	527980	527985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222935
7570	NC_020061	GCG	2	6	528011	528016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222935
7571	NC_020061	TCG	2	6	528378	528383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222935
7572	NC_020061	TCG	2	6	528393	528398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222935
7573	NC_020061	CGGC	2	8	528444	528451	0 %	0 %	50 %	50 %	440222935
7574	NC_020061	GAA	2	6	528469	528474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222935
7575	NC_020061	GCTC	2	8	528480	528487	0 %	25 %	25 %	50 %	440222935
7576	NC_020061	GACGC	2	10	528521	528530	20 %	0 %	40 %	40 %	440222935
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7579	NC_020061	CCA	2	6	528624	528629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222935
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7581	NC_020061	GCC	2	6	528753	528758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222935
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7583	NC_020061	ACG	2	6	528818	528823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222935
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7585	NC_020061	CGCA	2	8	528901	528908	25 %	0 %	25 %	50 %	440222935
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7588	NC_020061	CCG	2	6	529008	529013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222935
7589	NC_020061	AGG	2	6	529047	529052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222935
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7591	NC_020061	GTC	2	6	529103	529108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222935
7592	NC_020061	GAA	2	6	529138	529143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222935
7593	NC_020061	GGA	2	6	529150	529155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222935
7594	NC_020061	GC	3	6	529163	529168	0 %	0 %	50 %	50 %	440222935
7595	NC_020061	CGATG	2	10	529219	529228	20 %	20 %	40 %	20 %	440222935
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7599	NC_020061	GAG	2	6	529439	529444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222935
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7601	NC_020061	CGG	2	6	529491	529496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222935
7602	NC_020061	ATCG	2	8	529529	529536	25 %	25 %	25 %	25 %	440222935
7603	NC_020061	CGC	2	6	529654	529659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222935
7604	NC_020061	GCA	2	6	529759	529764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222935
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7606	NC_020061	CTG	2	6	529922	529927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222936
7607	NC_020061	CGAG	2	8	529988	529995	25 %	0 %	50 %	25 %	440222936
7608	NC_020061	GAC	2	6	530044	530049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222936
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7611	NC_020061	CGC	2	6	530141	530146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222936
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7616	NC_020061	ATC	2	6	530438	530443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222937
7617	NC_020061	TCGG	2	8	530447	530454	0 %	25 %	50 %	25 %	440222937
7618	NC_020061	TGT	2	6	530487	530492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222937
7619	NC_020061	GCA	2	6	530564	530569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222937
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7621	NC_020061	TGC	2	6	530620	530625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222937
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7981	NC_020061	CGAA	2	8	549431	549438	50 %	0 %	25 %	25 %	440222956
7982	NC_020061	CAT	2	6	549459	549464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222956

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