MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899b

Total Repeats: 7982

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_020061	CTG	2	6	447647	447652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222856
6502	NC_020061	GCGAC	2	10	447681	447690	20 %	0 %	40 %	40 %	440222856
6503	NC_020061	ACC	2	6	447714	447719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222856
6504	NC_020061	GCT	2	6	447751	447756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222856
6505	NC_020061	CAGC	2	8	447782	447789	25 %	0 %	25 %	50 %	440222856
6506	NC_020061	CGG	2	6	447951	447956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222856
6507	NC_020061	CTC	2	6	449041	449046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440222857
6508	NC_020061	GAG	2	6	449115	449120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222857
6509	NC_020061	TCA	2	6	449408	449413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222858
6510	NC_020061	AT	3	6	451667	451672	50 %	50 %	0 %	0 %	440222859
6511	NC_020061	GAAA	2	8	451691	451698	75 %	0 %	25 %	0 %	440222859
6512	NC_020061	AGG	2	6	451717	451722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222859
6513	NC_020061	GAT	2	6	451775	451780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222859
6514	NC_020061	CAA	2	6	451925	451930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440222859
6515	NC_020061	ACGC	2	8	452024	452031	25 %	0 %	25 %	50 %	440222859
6516	NC_020061	TGA	2	6	452095	452100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222859
6517	NC_020061	AGGG	2	8	452126	452133	25 %	0 %	75 %	0 %	440222859
6518	NC_020061	GCA	2	6	452268	452273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222859
6519	NC_020061	TGA	2	6	452299	452304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222859
6520	NC_020061	CGC	2	6	452345	452350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222859
6521	NC_020061	ATCA	2	8	452422	452429	50 %	25 %	0 %	25 %	440222859
6522	NC_020061	CGA	2	6	452460	452465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222859
6523	NC_020061	GCT	2	6	452486	452491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222859
6524	NC_020061	GCG	2	6	452499	452504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222859
6525	NC_020061	CTT	2	6	452511	452516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222859
6526	NC_020061	GAA	2	6	452549	452554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222859
6527	NC_020061	GGCTT	2	10	452578	452587	0 %	40 %	40 %	20 %	440222859
6528	NC_020061	GC	3	6	452591	452596	0 %	0 %	50 %	50 %	440222859
6529	NC_020061	TCA	2	6	452626	452631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222859
6530	NC_020061	TGGC	2	8	452671	452678	0 %	25 %	50 %	25 %	440222859
6531	NC_020061	CAGC	2	8	453530	453537	25 %	0 %	25 %	50 %	440222860
6532	NC_020061	GCT	2	6	453606	453611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222860
6533	NC_020061	CAC	2	6	453625	453630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222860
6534	NC_020061	GAA	2	6	453706	453711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222860
6535	NC_020061	CAA	2	6	453712	453717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440222860
6536	NC_020061	CGG	2	6	453731	453736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222860
6537	NC_020061	CCT	2	6	453786	453791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440222860
6538	NC_020061	GAT	2	6	453896	453901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222861
6539	NC_020061	CGA	2	6	453986	453991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222861
6540	NC_020061	CTC	2	6	454004	454009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440222861
6541	NC_020061	TGC	2	6	454059	454064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222861
6542	NC_020061	GGC	2	6	454107	454112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222861
6543	NC_020061	GAA	2	6	454150	454155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222861
6544	NC_020061	CAGG	2	8	454211	454218	25 %	0 %	50 %	25 %	440222861
6545	NC_020061	CGG	2	6	454257	454262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222861
6546	NC_020061	GTG	2	6	454316	454321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222861
6547	NC_020061	GT	3	6	455442	455447	0 %	50 %	50 %	0 %	440222862
6548	NC_020061	GTC	2	6	455564	455569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222862
6549	NC_020061	GAGC	2	8	455587	455594	25 %	0 %	50 %	25 %	440222862
6550	NC_020061	GCT	2	6	455627	455632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222862
6551	NC_020061	ATC	2	6	455661	455666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222862
6552	NC_020061	CGAC	2	8	455732	455739	25 %	0 %	25 %	50 %	440222862
6553	NC_020061	TGATGT	2	12	455786	455797	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	440222862
6554	NC_020061	ATT	2	6	455920	455925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440222862
6555	NC_020061	TTG	2	6	457449	457454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222863
6556	NC_020061	CCA	3	9	457462	457470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222863
6557	NC_020061	CT	3	6	457489	457494	0 %	50 %	0 %	50 %	440222863
6558	NC_020061	CG	3	6	457560	457565	0 %	0 %	50 %	50 %	440222863
6559	NC_020061	AGC	2	6	457617	457622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222863
6560	NC_020061	GCC	2	6	457631	457636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222863
6561	NC_020061	AACC	2	8	457655	457662	50 %	0 %	0 %	50 %	440222863
6562	NC_020061	GCT	2	6	457697	457702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222863
6563	NC_020061	GGC	2	6	457778	457783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222863
6564	NC_020061	GC	3	6	457790	457795	0 %	0 %	50 %	50 %	440222863
6565	NC_020061	CAG	2	6	457951	457956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222863
6566	NC_020061	TCGC	2	8	457984	457991	0 %	25 %	25 %	50 %	440222863
6567	NC_020061	GTTC	3	12	458006	458017	0 %	50 %	25 %	25 %	440222863
6568	NC_020061	TTC	2	6	458145	458150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222863
6569	NC_020061	AT	3	6	458160	458165	50 %	50 %	0 %	0 %	440222863
6570	NC_020061	TGG	2	6	458199	458204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222863
6571	NC_020061	GAT	2	6	458230	458235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222863
6572	NC_020061	GC	3	6	458236	458241	0 %	0 %	50 %	50 %	440222863
6573	NC_020061	CA	3	6	458264	458269	50 %	0 %	0 %	50 %	440222863
6574	NC_020061	ACG	2	6	458318	458323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222863
6575	NC_020061	TGC	2	6	458359	458364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222863
6576	NC_020061	GAT	2	6	459241	459246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222864
6577	NC_020061	TGG	2	6	459248	459253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222864
6578	NC_020061	TCAG	2	8	459281	459288	25 %	25 %	25 %	25 %	440222864
6579	NC_020061	CATTA	2	10	459325	459334	40 %	40 %	0 %	20 %	440222864
6580	NC_020061	CAA	2	6	459414	459419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440222864
6581	NC_020061	GCA	2	6	459495	459500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222864
6582	NC_020061	CTT	2	6	459640	459645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222864
6583	NC_020061	TGGGT	2	10	459648	459657	0 %	40 %	60 %	0 %	440222864
6584	NC_020061	TTCC	2	8	459701	459708	0 %	50 %	0 %	50 %	440222864
6585	NC_020061	CGT	2	6	459712	459717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222864
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6587	NC_020061	GA	3	6	459875	459880	50 %	0 %	50 %	0 %	440222864
6588	NC_020061	TCTTA	2	10	460066	460075	20 %	60 %	0 %	20 %	440222864
6589	NC_020061	AGC	2	6	460092	460097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222864
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6591	NC_020061	GAT	2	6	460237	460242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222864
6592	NC_020061	GAA	2	6	460374	460379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222865
6593	NC_020061	CGATCT	2	12	460421	460432	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	440222865
6594	NC_020061	CAG	2	6	460515	460520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222865
6595	NC_020061	CGGCA	2	10	460562	460571	20 %	0 %	40 %	40 %	440222865
6596	NC_020061	CTC	2	6	460610	460615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440222865
6597	NC_020061	CAG	2	6	460626	460631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222865
6598	NC_020061	TGC	2	6	460717	460722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222866
6599	NC_020061	GTC	2	6	460726	460731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222866
6600	NC_020061	AGA	2	6	460751	460756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222866
6601	NC_020061	GC	3	6	460770	460775	0 %	0 %	50 %	50 %	440222866
6602	NC_020061	GAA	2	6	460829	460834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222866
6603	NC_020061	GC	3	6	460844	460849	0 %	0 %	50 %	50 %	440222866
6604	NC_020061	TTG	2	6	460941	460946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222866
6605	NC_020061	GAA	2	6	460950	460955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222866
6606	NC_020061	AAT	2	6	461012	461017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440222866
6607	NC_020061	CAGG	2	8	461089	461096	25 %	0 %	50 %	25 %	440222867
6608	NC_020061	TCT	2	6	461105	461110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222867
6609	NC_020061	CGCC	2	8	461132	461139	0 %	0 %	25 %	75 %	440222867
6610	NC_020061	GAC	3	9	461165	461173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222867
6611	NC_020061	CGG	2	6	461252	461257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222867
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6613	NC_020061	GGC	2	6	461468	461473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222868
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6617	NC_020061	CGA	2	6	461716	461721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222868
6618	NC_020061	GA	3	6	461789	461794	50 %	0 %	50 %	0 %	440222868
6619	NC_020061	GC	4	8	461941	461948	0 %	0 %	50 %	50 %	440222868
6620	NC_020061	CGC	2	6	462114	462119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222869
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6984	NC_020061	CGAT	2	8	488359	488366	25 %	25 %	25 %	25 %	440222894
6985	NC_020061	CGT	2	6	488437	488442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222894
6986	NC_020061	CGA	2	6	488756	488761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222895
6987	NC_020061	GGT	3	9	488778	488786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222895
6988	NC_020061	GGAT	2	8	488790	488797	25 %	25 %	50 %	0 %	440222895
6989	NC_020061	GGC	2	6	488826	488831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222895
6990	NC_020061	CCTT	2	8	488833	488840	0 %	50 %	0 %	50 %	440222895
6991	NC_020061	GAC	2	6	488948	488953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222895
6992	NC_020061	GCG	2	6	489001	489006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222895
6993	NC_020061	GC	3	6	489298	489303	0 %	0 %	50 %	50 %	440222896
6994	NC_020061	CTC	2	6	489319	489324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440222896
6995	NC_020061	GATG	2	8	489349	489356	25 %	25 %	50 %	0 %	440222896
6996	NC_020061	TCGT	2	8	489406	489413	0 %	50 %	25 %	25 %	440222896
6997	NC_020061	TCG	2	6	489418	489423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222896
6998	NC_020061	GAT	2	6	489426	489431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222896
6999	NC_020061	AGG	2	6	489434	489439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222896
7000	NC_020061	CAG	2	6	489466	489471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222896

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