MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899b

Total Repeats: 7982

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_020061	AGA	2	6	378302	378307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222797
5502	NC_020061	CGA	2	6	378750	378755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222798
5503	NC_020061	CCT	2	6	378786	378791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440222798
5504	NC_020061	TTG	2	6	378797	378802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222798
5505	NC_020061	CGA	2	6	378807	378812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222798
5506	NC_020061	CCA	2	6	378888	378893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222798
5507	NC_020061	GCC	2	6	378968	378973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222798
5508	NC_020061	CCG	2	6	379017	379022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222798
5509	NC_020061	GAT	3	9	379045	379053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222798
5510	NC_020061	CGA	2	6	379101	379106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222798
5511	NC_020061	CCG	2	6	379131	379136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222798
5512	NC_020061	TCT	2	6	379163	379168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222798
5513	NC_020061	GCG	2	6	379169	379174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222798
5514	NC_020061	AGG	2	6	379182	379187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222798
5515	NC_020061	CTT	2	6	379207	379212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222798
5516	NC_020061	ACC	2	6	379283	379288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222798
5517	NC_020061	GAT	2	6	379291	379296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222798
5518	NC_020061	GAG	2	6	379318	379323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222798
5519	NC_020061	CCGA	2	8	379352	379359	25 %	0 %	25 %	50 %	440222798
5520	NC_020061	AGC	2	6	379363	379368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222798
5521	NC_020061	GCC	2	6	379391	379396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222798
5522	NC_020061	TTG	2	6	379433	379438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222798
5523	NC_020061	TCG	2	6	379445	379450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222798
5524	NC_020061	CAG	2	6	379459	379464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222798
5525	NC_020061	GGC	3	9	379489	379497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222798
5526	NC_020061	GGC	2	6	379513	379518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222798
5527	NC_020061	CCA	2	6	379527	379532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222798
5528	NC_020061	CGC	2	6	379545	379550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222798
5529	NC_020061	GCC	2	6	379562	379567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222798
5530	NC_020061	AGA	3	9	379619	379627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222798
5531	NC_020061	CGAC	2	8	379703	379710	25 %	0 %	25 %	50 %	440222799
5532	NC_020061	GCCT	2	8	379722	379729	0 %	25 %	25 %	50 %	440222799
5533	NC_020061	CTT	2	6	379803	379808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222799
5534	NC_020061	CTT	3	9	379818	379826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222799
5535	NC_020061	ATG	2	6	379834	379839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222799
5536	NC_020061	CAC	2	6	379887	379892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222799
5537	NC_020061	GCC	2	6	379923	379928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222799
5538	NC_020061	CGATCT	2	12	379964	379975	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	440222799
5539	NC_020061	GCC	2	6	380011	380016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222799
5540	NC_020061	TCA	2	6	380041	380046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222799
5541	NC_020061	CGA	2	6	380063	380068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222799
5542	NC_020061	TCGGCA	2	12	380086	380097	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	440222799
5543	NC_020061	ACC	3	9	380227	380235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222799
5544	NC_020061	CCT	2	6	380255	380260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440222799
5545	NC_020061	CTT	2	6	380273	380278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222799
5546	NC_020061	TCG	2	6	380290	380295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222799
5547	NC_020061	CGC	2	6	380447	380452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222800
5548	NC_020061	AAT	2	6	380453	380458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440222800
5549	NC_020061	ATG	2	6	380569	380574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222800
5550	NC_020061	GAT	2	6	380627	380632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222800
5551	NC_020061	ACCGA	2	10	380668	380677	40 %	0 %	20 %	40 %	440222800
5552	NC_020061	ATC	2	6	380710	380715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222800
5553	NC_020061	TCC	2	6	380752	380757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440222800
5554	NC_020061	ACG	2	6	380788	380793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222800
5555	NC_020061	CGA	2	6	380846	380851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222800
5556	NC_020061	ACCGGA	2	12	380860	380871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222800
5557	NC_020061	GTCC	2	8	380911	380918	0 %	25 %	25 %	50 %	440222800
5558	NC_020061	TGAGG	2	10	380952	380961	20 %	20 %	60 %	0 %	440222800
5559	NC_020061	TCG	2	6	380992	380997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222800
5560	NC_020061	AAT	2	6	380998	381003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440222800
5561	NC_020061	GCTC	2	8	381017	381024	0 %	25 %	25 %	50 %	440222800
5562	NC_020061	CCG	3	9	381026	381034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222800
5563	NC_020061	GAT	2	6	381039	381044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222800
5564	NC_020061	GTC	2	6	381079	381084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222800
5565	NC_020061	CGA	2	6	381179	381184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222800
5566	NC_020061	GAA	2	6	381324	381329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222801
5567	NC_020061	GCG	2	6	381355	381360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222801
5568	NC_020061	GAG	2	6	381377	381382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222801
5569	NC_020061	GC	3	6	381446	381451	0 %	0 %	50 %	50 %	440222801
5570	NC_020061	TCG	2	6	381465	381470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222801
5571	NC_020061	TCC	2	6	381497	381502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440222801
5572	NC_020061	GCG	2	6	381525	381530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222801
5573	NC_020061	TGG	2	6	381613	381618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222801
5574	NC_020061	CAG	2	6	381653	381658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222801
5575	NC_020061	GC	3	6	382038	382043	0 %	0 %	50 %	50 %	440222801
5576	NC_020061	CGA	2	6	382232	382237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222801
5577	NC_020061	CGC	2	6	382265	382270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222801
5578	NC_020061	GCC	2	6	382283	382288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222801
5579	NC_020061	GTC	2	6	382334	382339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222801
5580	NC_020061	CGA	2	6	382429	382434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222801
5581	NC_020061	AGA	2	6	382476	382481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222802
5582	NC_020061	CAT	2	6	382527	382532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222802
5583	NC_020061	GCC	2	6	382609	382614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222802
5584	NC_020061	GTT	2	6	382660	382665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222802
5585	NC_020061	CCT	2	6	382777	382782	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440222802
5586	NC_020061	GCCA	2	8	382798	382805	25 %	0 %	25 %	50 %	440222802
5587	NC_020061	GTCCA	2	10	382828	382837	20 %	20 %	20 %	40 %	440222802
5588	NC_020061	GCA	2	6	382950	382955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222802
5589	NC_020061	GCC	2	6	383026	383031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222802
5590	NC_020061	CCG	2	6	383180	383185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222802
5591	NC_020061	AGC	2	6	383253	383258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222802
5592	NC_020061	TTC	2	6	383305	383310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222802
5593	NC_020061	CGA	2	6	383344	383349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222802
5594	NC_020061	TCA	2	6	383358	383363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222802
5595	NC_020061	CG	3	6	383397	383402	0 %	0 %	50 %	50 %	440222802
5596	NC_020061	GCC	2	6	383435	383440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222802
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5598	NC_020061	GCA	2	6	383544	383549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222802
5599	NC_020061	GCA	2	6	383573	383578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222802
5600	NC_020061	AG	3	6	383602	383607	50 %	0 %	50 %	0 %	440222802
5601	NC_020061	CTC	2	6	383611	383616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440222802
5602	NC_020061	TTCC	2	8	383831	383838	0 %	50 %	0 %	50 %	440222803
5603	NC_020061	CCT	2	6	383848	383853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440222803
5604	NC_020061	CT	3	6	383852	383857	0 %	50 %	0 %	50 %	440222803
5605	NC_020061	CGG	4	12	383889	383900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222803
5606	NC_020061	GCC	2	6	383934	383939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222803
5607	NC_020061	AGC	3	9	383955	383963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222803
5608	NC_020061	GGCC	2	8	383966	383973	0 %	0 %	50 %	50 %	440222803
5609	NC_020061	AGC	2	6	384013	384018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222803
5610	NC_020061	CG	3	6	384044	384049	0 %	0 %	50 %	50 %	440222803
5611	NC_020061	GCA	2	6	384069	384074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222803
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5615	NC_020061	GCC	2	6	384230	384235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222803
5616	NC_020061	CATT	2	8	384253	384260	25 %	50 %	0 %	25 %	440222803
5617	NC_020061	GAG	2	6	384305	384310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222803
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5620	NC_020061	GGA	2	6	384420	384425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222803
5621	NC_020061	CGA	2	6	384489	384494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222803
5622	NC_020061	CTT	2	6	384530	384535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222803
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5624	NC_020061	CGC	2	6	384654	384659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222803
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5727	NC_020061	CGAT	2	8	392156	392163	25 %	25 %	25 %	25 %	440222812
5728	NC_020061	CGT	2	6	392234	392239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222812
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5732	NC_020061	GCT	2	6	392956	392961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222813
5733	NC_020061	TCA	2	6	393097	393102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222813
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5737	NC_020061	TCG	2	6	393370	393375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222813
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5739	NC_020061	T	6	6	393385	393390	0 %	100 %	0 %	0 %	440222813
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5741	NC_020061	GGC	2	6	393450	393455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222813
5742	NC_020061	TGT	2	6	393457	393462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222813
5743	NC_020061	CTTCA	2	10	393497	393506	20 %	40 %	0 %	40 %	440222813
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5983	NC_020061	TGC	2	6	410838	410843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222829
5984	NC_020061	GGA	2	6	410880	410885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222829
5985	NC_020061	ATC	2	6	410887	410892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222829
5986	NC_020061	AGG	2	6	410895	410900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222829
5987	NC_020061	CTT	2	6	410945	410950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222829
5988	NC_020061	TGG	2	6	411107	411112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222829
5989	NC_020061	ACC	2	6	411331	411336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222829
5990	NC_020061	GTA	2	6	411382	411387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222829
5991	NC_020061	CGT	2	6	411465	411470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222829
5992	NC_020061	ATC	2	6	411496	411501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222829
5993	NC_020061	GAC	3	9	411783	411791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222830
5994	NC_020061	T	6	6	411812	411817	0 %	100 %	0 %	0 %	440222830
5995	NC_020061	CGAG	2	8	411845	411852	25 %	0 %	50 %	25 %	440222830
5996	NC_020061	ACG	2	6	411883	411888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222830
5997	NC_020061	TCTTT	2	10	411977	411986	0 %	80 %	0 %	20 %	440222830
5998	NC_020061	TCT	3	9	412111	412119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222830
5999	NC_020061	TGC	2	6	412127	412132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222830
6000	NC_020061	GCC	2	6	412137	412142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222830

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