MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899b

Total Repeats: 7982

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_020061	CAG	2	6	307203	307208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222743
4502	NC_020061	GATC	2	8	307214	307221	25 %	25 %	25 %	25 %	440222743
4503	NC_020061	GTGTC	2	10	307238	307247	0 %	40 %	40 %	20 %	440222743
4504	NC_020061	GTCC	2	8	307269	307276	0 %	25 %	25 %	50 %	440222743
4505	NC_020061	GAACC	2	10	307331	307340	40 %	0 %	20 %	40 %	440222743
4506	NC_020061	CGC	2	6	307357	307362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222743
4507	NC_020061	TCCAT	2	10	307384	307393	20 %	40 %	0 %	40 %	440222743
4508	NC_020061	CG	3	6	307399	307404	0 %	0 %	50 %	50 %	440222743
4509	NC_020061	CCG	2	6	307485	307490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222743
4510	NC_020061	CCG	2	6	307505	307510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222743
4511	NC_020061	ATG	3	9	307742	307750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222744
4512	NC_020061	AGA	2	6	307757	307762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222744
4513	NC_020061	TCAA	2	8	307864	307871	50 %	25 %	0 %	25 %	440222744
4514	NC_020061	CAC	2	6	308051	308056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222745
4515	NC_020061	AAC	2	6	308070	308075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440222745
4516	NC_020061	GTTG	3	12	308113	308124	0 %	50 %	50 %	0 %	440222745
4517	NC_020061	CTG	2	6	308145	308150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222745
4518	NC_020061	AGG	2	6	308245	308250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222745
4519	NC_020061	GAG	2	6	308301	308306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222745
4520	NC_020061	GCC	2	6	308396	308401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222745
4521	NC_020061	GGC	2	6	308417	308422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222745
4522	NC_020061	AGC	2	6	308423	308428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222745
4523	NC_020061	T	6	6	308455	308460	0 %	100 %	0 %	0 %	440222745
4524	NC_020061	GCC	2	6	308467	308472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222745
4525	NC_020061	ACA	2	6	308532	308537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440222745
4526	NC_020061	GATGG	2	10	308544	308553	20 %	20 %	60 %	0 %	440222745
4527	NC_020061	GAT	2	6	308565	308570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222745
4528	NC_020061	AGA	2	6	308591	308596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222745
4529	NC_020061	GTG	2	6	308668	308673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222745
4530	NC_020061	TCG	2	6	308680	308685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222745
4531	NC_020061	CGC	2	6	308819	308824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222745
4532	NC_020061	GAA	2	6	308865	308870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222745
4533	NC_020061	GCG	2	6	308905	308910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222745
4534	NC_020061	AGA	2	6	308934	308939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222745
4535	NC_020061	TGA	2	6	310784	310789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222746
4536	NC_020061	CG	3	6	310928	310933	0 %	0 %	50 %	50 %	440222746
4537	NC_020061	CGA	2	6	310947	310952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222746
4538	NC_020061	GCG	2	6	310953	310958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222746
4539	NC_020061	CTTCGA	2	12	311013	311024	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	440222746
4540	NC_020061	CTGTT	2	10	311096	311105	0 %	60 %	20 %	20 %	440222746
4541	NC_020061	CGG	2	6	311195	311200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222746
4542	NC_020061	TGG	2	6	311207	311212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222746
4543	NC_020061	GCTC	2	8	311240	311247	0 %	25 %	25 %	50 %	440222746
4544	NC_020061	TTG	2	6	311281	311286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222746
4545	NC_020061	GCC	2	6	311326	311331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222746
4546	NC_020061	TTC	2	6	311338	311343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222746
4547	NC_020061	CGT	2	6	311433	311438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222746
4548	NC_020061	CAC	2	6	311467	311472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222746
4549	NC_020061	GCG	2	6	311551	311556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222746
4550	NC_020061	CAAA	2	8	311576	311583	75 %	0 %	0 %	25 %	440222746
4551	NC_020061	A	6	6	312793	312798	100 %	0 %	0 %	0 %	440222747
4552	NC_020061	CTGC	2	8	312823	312830	0 %	25 %	25 %	50 %	440222747
4553	NC_020061	GGC	2	6	312921	312926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222747
4554	NC_020061	TCGC	2	8	312970	312977	0 %	25 %	25 %	50 %	440222747
4555	NC_020061	ACC	2	6	313027	313032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222747
4556	NC_020061	TGGCT	2	10	313057	313066	0 %	40 %	40 %	20 %	440222747
4557	NC_020061	AGC	2	6	313125	313130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222747
4558	NC_020061	G	6	6	313144	313149	0 %	0 %	100 %	0 %	440222747
4559	NC_020061	TTCC	2	8	313156	313163	0 %	50 %	0 %	50 %	440222747
4560	NC_020061	CCA	2	6	313190	313195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222747
4561	NC_020061	CGG	2	6	313200	313205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222747
4562	NC_020061	TCC	2	6	313245	313250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440222747
4563	NC_020061	AAG	2	6	313381	313386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222747
4564	NC_020061	TGG	2	6	313417	313422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222747
4565	NC_020061	TCG	2	6	313537	313542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222747
4566	NC_020061	CAG	2	6	314231	314236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222748
4567	NC_020061	ACTT	2	8	314260	314267	25 %	50 %	0 %	25 %	440222748
4568	NC_020061	GAG	2	6	314326	314331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222748
4569	NC_020061	GCC	2	6	314384	314389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222748
4570	NC_020061	TGA	2	6	315498	315503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222749
4571	NC_020061	ACC	2	6	315608	315613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222749
4572	NC_020061	TGA	2	6	315660	315665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222749
4573	NC_020061	CGC	2	6	315698	315703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222749
4574	NC_020061	CCA	2	6	315725	315730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222749
4575	NC_020061	GGAT	2	8	315768	315775	25 %	25 %	50 %	0 %	440222749
4576	NC_020061	CGA	2	6	315855	315860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222749
4577	NC_020061	TCT	2	6	315885	315890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222749
4578	NC_020061	GCC	2	6	315913	315918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222749
4579	NC_020061	GGT	2	6	315925	315930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222749
4580	NC_020061	CCT	2	6	315972	315977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440222749
4581	NC_020061	CG	3	6	315990	315995	0 %	0 %	50 %	50 %	440222749
4582	NC_020061	GCA	2	6	316095	316100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222749
4583	NC_020061	CAC	2	6	316144	316149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222749
4584	NC_020061	GGC	2	6	316173	316178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222749
4585	NC_020061	GCG	2	6	316183	316188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222749
4586	NC_020061	TCG	2	6	317834	317839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222750
4587	NC_020061	CAAT	2	8	317866	317873	50 %	25 %	0 %	25 %	440222750
4588	NC_020061	ACA	2	6	317879	317884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440222750
4589	NC_020061	CGC	2	6	317918	317923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222750
4590	NC_020061	CCGC	2	8	317946	317953	0 %	0 %	25 %	75 %	440222750
4591	NC_020061	ATC	2	6	318166	318171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222750
4592	NC_020061	CG	3	6	318193	318198	0 %	0 %	50 %	50 %	440222751
4593	NC_020061	ACCG	2	8	318234	318241	25 %	0 %	25 %	50 %	440222751
4594	NC_020061	AGA	2	6	318269	318274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222751
4595	NC_020061	TGT	2	6	318315	318320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222751
4596	NC_020061	GC	3	6	318339	318344	0 %	0 %	50 %	50 %	440222751
4597	NC_020061	CT	4	8	318355	318362	0 %	50 %	0 %	50 %	440222751
4598	NC_020061	ACG	2	6	318377	318382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222751
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4600	NC_020061	CCGTCA	2	12	318430	318441	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	440222751
4601	NC_020061	CGAT	2	8	318466	318473	25 %	25 %	25 %	25 %	440222751
4602	NC_020061	CGT	2	6	318544	318549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222751
4603	NC_020061	CTGC	2	8	319353	319360	0 %	25 %	25 %	50 %	440222752
4604	NC_020061	GCC	2	6	319418	319423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222752
4605	NC_020061	TGAT	2	8	319481	319488	25 %	50 %	25 %	0 %	440222752
4606	NC_020061	GAG	2	6	319521	319526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222752
4607	NC_020061	CCAA	2	8	319609	319616	50 %	0 %	0 %	50 %	440222752
4608	NC_020061	AGC	2	6	319632	319637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222752
4609	NC_020061	ACGA	2	8	319702	319709	50 %	0 %	25 %	25 %	440222752
4610	NC_020061	CAG	2	6	319849	319854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222752
4611	NC_020061	GT	3	6	319862	319867	0 %	50 %	50 %	0 %	440222752
4612	NC_020061	GCT	2	6	319906	319911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222752
4613	NC_020061	CGCC	2	8	320016	320023	0 %	0 %	25 %	75 %	440222752
4614	NC_020061	GAG	2	6	320029	320034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222752
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4616	NC_020061	CTA	2	6	320354	320359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222752
4617	NC_020061	CTT	2	6	320381	320386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222752
4618	NC_020061	TGG	2	6	321462	321467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222753
4619	NC_020061	CGC	2	6	321482	321487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222753
4620	NC_020061	TTG	2	6	321513	321518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222753
4621	NC_020061	GCCT	2	8	321521	321528	0 %	25 %	25 %	50 %	440222753
4622	NC_020061	GT	3	6	321537	321542	0 %	50 %	50 %	0 %	440222753
4623	NC_020061	CGG	2	6	321627	321632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222753
4624	NC_020061	GTC	2	6	321659	321664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222753
4625	NC_020061	GCCT	2	8	321678	321685	0 %	25 %	25 %	50 %	440222753
4626	NC_020061	CCT	2	6	321693	321698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440222753
4627	NC_020061	TTC	2	6	321766	321771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222753
4628	NC_020061	TGATGC	2	12	321823	321834	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	440222753
4629	NC_020061	ATC	2	6	321845	321850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222753
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4631	NC_020061	TTC	2	6	322035	322040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222754
4632	NC_020061	GAT	2	6	322109	322114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222754
4633	NC_020061	GGT	2	6	322115	322120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222754
4634	NC_020061	GAC	2	6	322127	322132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222754
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4638	NC_020061	AAGCC	2	10	323162	323171	40 %	0 %	20 %	40 %	440222755
4639	NC_020061	TTC	2	6	323195	323200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222755
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4645	NC_020061	CGC	2	6	323330	323335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222755
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4650	NC_020061	TCA	2	6	323649	323654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222755
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4652	NC_020061	TTG	2	6	323819	323824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222755
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4656	NC_020061	TA	3	6	324076	324081	50 %	50 %	0 %	0 %	440222755
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4660	NC_020061	GCCT	2	8	326331	326338	0 %	25 %	25 %	50 %	440222756
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4682	NC_020061	CTG	2	6	328365	328370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222757
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4698	NC_020061	CGT	2	6	329064	329069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222758
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4700	NC_020061	CCCA	2	8	329096	329103	25 %	0 %	0 %	75 %	440222758
4701	NC_020061	CAGCG	2	10	329122	329131	20 %	0 %	40 %	40 %	440222758
4702	NC_020061	GCTCGT	2	12	329147	329158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222758
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4727	NC_020061	CGT	2	6	331527	331532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222759
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4865	NC_020061	TCG	2	6	339828	339833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222766
4866	NC_020061	TTG	3	9	339889	339897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222766
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4868	NC_020061	ATC	2	6	339954	339959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222766
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4872	NC_020061	ATC	2	6	340116	340121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222766
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4894	NC_020061	CCT	2	6	341528	341533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440222767
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4964	NC_020061	CGA	2	6	344940	344945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222770
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4980	NC_020061	CATG	2	8	346213	346220	25 %	25 %	25 %	25 %	440222772
4981	NC_020061	CAGG	2	8	346275	346282	25 %	0 %	50 %	25 %	440222772
4982	NC_020061	GAA	2	6	346307	346312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222772
4983	NC_020061	GGC	2	6	346325	346330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222772
4984	NC_020061	GAA	2	6	346343	346348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222772
4985	NC_020061	CGC	2	6	346369	346374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222772
4986	NC_020061	CGCGAT	2	12	346516	346527	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	440222772
4987	NC_020061	TCA	2	6	346539	346544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222772
4988	NC_020061	GGT	2	6	346558	346563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222772
4989	NC_020061	CG	3	6	346566	346571	0 %	0 %	50 %	50 %	440222772
4990	NC_020061	CGG	2	6	346618	346623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222772
4991	NC_020061	CGA	2	6	346629	346634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222772
4992	NC_020061	GAG	2	6	346690	346695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222772
4993	NC_020061	TGC	2	6	346738	346743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222772
4994	NC_020061	GGCCG	2	10	346754	346763	0 %	0 %	60 %	40 %	440222772
4995	NC_020061	CCT	2	6	346787	346792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440222772
4996	NC_020061	TCG	2	6	346833	346838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222772
4997	NC_020061	AT	3	6	346861	346866	50 %	50 %	0 %	0 %	440222772
4998	NC_020061	GCA	2	6	346944	346949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222772
4999	NC_020061	CTG	2	6	347041	347046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222772
5000	NC_020061	CG	3	6	347069	347074	0 %	0 %	50 %	50 %	440222772

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