MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899a

Total Repeats: 3772

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020060	CGC	2	6	63446	63451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228629
1002	NC_020060	TCA	2	6	63553	63558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228630
1003	NC_020060	CAG	2	6	63585	63590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228630
1004	NC_020060	GGC	2	6	63630	63635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228630
1005	NC_020060	CCG	2	6	63642	63647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228630
1006	NC_020060	TGG	2	6	63678	63683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440228630
1007	NC_020060	CTG	2	6	63705	63710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228630
1008	NC_020060	GTG	2	6	63726	63731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440228630
1009	NC_020060	GGGC	2	8	63748	63755	0 %	0 %	75 %	25 %	440228630
1010	NC_020060	CGA	2	6	63790	63795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228630
1011	NC_020060	TGG	2	6	63874	63879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440228630
1012	NC_020060	GCC	2	6	63891	63896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228630
1013	NC_020060	CACC	2	8	63914	63921	25 %	0 %	0 %	75 %	440228630
1014	NC_020060	CGA	2	6	63967	63972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228630
1015	NC_020060	CGG	2	6	64102	64107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228630
1016	NC_020060	GTG	2	6	64153	64158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440228630
1017	NC_020060	CGG	2	6	64247	64252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228630
1018	NC_020060	AGC	2	6	64255	64260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228630
1019	NC_020060	GCC	2	6	64299	64304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228630
1020	NC_020060	CGA	2	6	64349	64354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228630
1021	NC_020060	AGC	2	6	64569	64574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228631
1022	NC_020060	TGG	2	6	64586	64591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440228631
1023	NC_020060	CGG	2	6	64599	64604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228631
1024	NC_020060	CCG	2	6	64639	64644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228631
1025	NC_020060	CGAG	2	8	64783	64790	25 %	0 %	50 %	25 %	440228631
1026	NC_020060	CGA	2	6	64824	64829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228631
1027	NC_020060	G	6	6	64864	64869	0 %	0 %	100 %	0 %	440228631
1028	NC_020060	TC	3	6	64873	64878	0 %	50 %	0 %	50 %	440228631
1029	NC_020060	CCGCG	2	10	64880	64889	0 %	0 %	40 %	60 %	440228631
1030	NC_020060	ACG	2	6	64957	64962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228631
1031	NC_020060	CAC	2	6	64974	64979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440228631
1032	NC_020060	CAA	2	6	65192	65197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440228632
1033	NC_020060	AGC	2	6	65198	65203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228632
1034	NC_020060	TCT	2	6	65229	65234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440228632
1035	NC_020060	GCG	2	6	65238	65243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228632
1036	NC_020060	GCG	2	6	65317	65322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228632
1037	NC_020060	CAG	2	6	65367	65372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228632
1038	NC_020060	CAG	2	6	65424	65429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228632
1039	NC_020060	CGT	2	6	65438	65443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228632
1040	NC_020060	TCG	2	6	65446	65451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228632
1041	NC_020060	ATC	2	6	65472	65477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228632
1042	NC_020060	CGG	2	6	65479	65484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228632
1043	NC_020060	GAT	2	6	65490	65495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228632
1044	NC_020060	CGA	2	6	65584	65589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228632
1045	NC_020060	ACCA	2	8	65600	65607	50 %	0 %	0 %	50 %	440228632
1046	NC_020060	GA	3	6	65632	65637	50 %	0 %	50 %	0 %	440228632
1047	NC_020060	CGC	2	6	65642	65647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228632
1048	NC_020060	CCA	2	6	65722	65727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440228632
1049	NC_020060	GGC	2	6	65888	65893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228632
1050	NC_020060	TGC	2	6	66527	66532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228633
1051	NC_020060	TGA	2	6	66541	66546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228633
1052	NC_020060	ATC	2	6	66551	66556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228633
1053	NC_020060	AGC	3	9	66627	66635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228633
1054	NC_020060	CGT	3	9	66658	66666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228633
1055	NC_020060	CGA	2	6	66679	66684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228633
1056	NC_020060	TGC	2	6	66753	66758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228633
1057	NC_020060	GAC	2	6	67043	67048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228633
1058	NC_020060	CGC	2	6	67057	67062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228633
1059	NC_020060	GAA	2	6	67087	67092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440228633
1060	NC_020060	GCCTCG	2	12	67107	67118	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	440228633
1061	NC_020060	GAT	2	6	67178	67183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228633
1062	NC_020060	ACC	2	6	67205	67210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440228633
1063	NC_020060	AGGT	2	8	67224	67231	25 %	25 %	50 %	0 %	440228633
1064	NC_020060	TCA	2	6	67368	67373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228633
1065	NC_020060	CCT	2	6	67405	67410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440228633
1066	NC_020060	CCG	2	6	67417	67422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228633
1067	NC_020060	GCG	2	6	67442	67447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228633
1068	NC_020060	GCCC	2	8	67511	67518	0 %	0 %	25 %	75 %	440228633
1069	NC_020060	TTC	2	6	67572	67577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440228633
1070	NC_020060	GCA	2	6	67632	67637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228633
1071	NC_020060	ATC	2	6	67644	67649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228633
1072	NC_020060	GCA	2	6	67654	67659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228633
1073	NC_020060	TCT	2	6	67675	67680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440228633
1074	NC_020060	TCA	2	6	67699	67704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228633
1075	NC_020060	GTC	2	6	67706	67711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228633
1076	NC_020060	CG	3	6	68252	68257	0 %	0 %	50 %	50 %	440228634
1077	NC_020060	ACGC	2	8	68271	68278	25 %	0 %	25 %	50 %	440228634
1078	NC_020060	CCA	2	6	68376	68381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440228634
1079	NC_020060	GCAAA	2	10	68389	68398	60 %	0 %	20 %	20 %	440228634
1080	NC_020060	CCA	2	6	68427	68432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440228634
1081	NC_020060	ATCG	2	8	68535	68542	25 %	25 %	25 %	25 %	440228634
1082	NC_020060	A	6	6	68610	68615	100 %	0 %	0 %	0 %	440228634
1083	NC_020060	CGA	2	6	68624	68629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228634
1084	NC_020060	CCA	2	6	68667	68672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440228634
1085	NC_020060	ATG	2	6	68704	68709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228634
1086	NC_020060	GCCG	2	8	68752	68759	0 %	0 %	50 %	50 %	440228634
1087	NC_020060	CTG	2	6	68767	68772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228635
1088	NC_020060	C	6	6	68794	68799	0 %	0 %	0 %	100 %	440228635
1089	NC_020060	GCC	2	6	68851	68856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228635
1090	NC_020060	TCCC	2	8	68880	68887	0 %	25 %	0 %	75 %	440228635
1091	NC_020060	ATG	2	6	69045	69050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228635
1092	NC_020060	CCG	2	6	69051	69056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228635
1093	NC_020060	CAATC	2	10	69073	69082	40 %	20 %	0 %	40 %	440228635
1094	NC_020060	TGG	2	6	69093	69098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440228635
1095	NC_020060	GGA	2	6	69136	69141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440228635
1096	NC_020060	TCGA	2	8	69219	69226	25 %	25 %	25 %	25 %	440228635
1097	NC_020060	TGA	2	6	69277	69282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228635
1098	NC_020060	CGT	2	6	69503	69508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228635
1099	NC_020060	GCA	2	6	69527	69532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228635
1100	NC_020060	GAA	2	6	69566	69571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440228635
1101	NC_020060	CCG	2	6	69574	69579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228635
1102	NC_020060	GT	4	8	69612	69619	0 %	50 %	50 %	0 %	440228635
1103	NC_020060	ACAA	2	8	69648	69655	75 %	0 %	0 %	25 %	440228635
1104	NC_020060	CGT	2	6	69674	69679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228635
1105	NC_020060	GTGC	2	8	69696	69703	0 %	25 %	50 %	25 %	440228635
1106	NC_020060	CAGC	2	8	69721	69728	25 %	0 %	25 %	50 %	440228635
1107	NC_020060	GC	3	6	69750	69755	0 %	0 %	50 %	50 %	440228635
1108	NC_020060	GCG	2	6	69759	69764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228635
1109	NC_020060	GAA	2	6	69836	69841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440228636
1110	NC_020060	GC	3	6	69862	69867	0 %	0 %	50 %	50 %	440228636
1111	NC_020060	CG	3	6	69880	69885	0 %	0 %	50 %	50 %	440228636
1112	NC_020060	GCA	2	6	69889	69894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228636
1113	NC_020060	TTC	2	6	69899	69904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440228636
1114	NC_020060	CAG	2	6	69932	69937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228636
1115	NC_020060	AGC	2	6	69960	69965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228636
1116	NC_020060	GGCA	2	8	70005	70012	25 %	0 %	50 %	25 %	440228636
1117	NC_020060	A	6	6	70032	70037	100 %	0 %	0 %	0 %	440228636
1118	NC_020060	CGA	2	6	70104	70109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228636
1119	NC_020060	GGC	2	6	70157	70162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228636
1120	NC_020060	CCG	2	6	70189	70194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228636
1121	NC_020060	CGC	2	6	70214	70219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228636
1122	NC_020060	TCA	2	6	70312	70317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228636
1123	NC_020060	TCT	2	6	70335	70340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440228636
1124	NC_020060	CCG	2	6	70341	70346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228636
1125	NC_020060	GAT	2	6	70400	70405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228636
1126	NC_020060	GCC	2	6	70460	70465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228636
1127	NC_020060	GCCG	2	8	70559	70566	0 %	0 %	50 %	50 %	440228636
1128	NC_020060	AGA	2	6	70578	70583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440228636
1129	NC_020060	ATCC	2	8	70589	70596	25 %	25 %	0 %	50 %	440228636
1130	NC_020060	ACG	2	6	70782	70787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228637
1131	NC_020060	TC	3	6	70852	70857	0 %	50 %	0 %	50 %	440228637
1132	NC_020060	AAGC	2	8	70884	70891	50 %	0 %	25 %	25 %	440228637
1133	NC_020060	TCGGC	2	10	70894	70903	0 %	20 %	40 %	40 %	440228637
1134	NC_020060	ATG	2	6	71067	71072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228637
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1140	NC_020060	CGA	2	6	71266	71271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228637
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1143	NC_020060	CGG	2	6	71533	71538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228637
1144	NC_020060	CGA	2	6	71551	71556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228637
1145	NC_020060	GC	3	6	71698	71703	0 %	0 %	50 %	50 %	440228637
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1147	NC_020060	GCC	2	6	71803	71808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228637
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1150	NC_020060	GC	3	6	71961	71966	0 %	0 %	50 %	50 %	440228637
1151	NC_020060	GCG	2	6	72011	72016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228637
1152	NC_020060	CGG	2	6	72038	72043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228637
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1154	NC_020060	TGC	2	6	72108	72113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228637
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1156	NC_020060	CA	3	6	72174	72179	50 %	0 %	0 %	50 %	440228638
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1160	NC_020060	GATC	2	8	72258	72265	25 %	25 %	25 %	25 %	440228638
1161	NC_020060	TC	3	6	72279	72284	0 %	50 %	0 %	50 %	440228638
1162	NC_020060	ATCG	2	8	72286	72293	25 %	25 %	25 %	25 %	440228638
1163	NC_020060	CTG	3	9	72412	72420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228638
1164	NC_020060	TCT	3	9	72464	72472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440228638
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1173	NC_020060	CGTC	2	8	72989	72996	0 %	25 %	25 %	50 %	440228639
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1237	NC_020060	CAA	2	6	76560	76565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440228644
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1241	NC_020060	CTG	2	6	76755	76760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228644
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1244	NC_020060	ATC	2	6	76897	76902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228644
1245	NC_020060	GGC	2	6	76940	76945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228644
1246	NC_020060	TAT	2	6	77364	77369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440228645
1247	NC_020060	GATCAG	2	12	77377	77388	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	440228645
1248	NC_020060	GCAAG	2	10	77395	77404	40 %	0 %	40 %	20 %	440228645
1249	NC_020060	GCGA	2	8	77431	77438	25 %	0 %	50 %	25 %	440228645
1250	NC_020060	CGC	2	6	77448	77453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228645
1251	NC_020060	GAT	2	6	77478	77483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228645
1252	NC_020060	T	6	6	77519	77524	0 %	100 %	0 %	0 %	440228645
1253	NC_020060	GTC	2	6	77629	77634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228645
1254	NC_020060	AAG	2	6	77686	77691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440228645
1255	NC_020060	TCA	2	6	77720	77725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228645
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1257	NC_020060	TCA	2	6	77826	77831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228645
1258	NC_020060	GAA	2	6	77836	77841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440228645
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1260	NC_020060	ATC	2	6	77912	77917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228645
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1263	NC_020060	TGA	2	6	78138	78143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228645
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1372	NC_020060	TCGA	2	8	84516	84523	25 %	25 %	25 %	25 %	440228650
1373	NC_020060	CCA	2	6	84579	84584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440228650
1374	NC_020060	CAT	2	6	84716	84721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228650
1375	NC_020060	ACGC	2	8	84836	84843	25 %	0 %	25 %	50 %	440228650
1376	NC_020060	TCG	2	6	84871	84876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228650
1377	NC_020060	CG	3	6	84913	84918	0 %	0 %	50 %	50 %	440228650
1378	NC_020060	ATA	2	6	84924	84929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440228650
1379	NC_020060	ACC	2	6	84947	84952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440228650
1380	NC_020060	GCGGTT	2	12	85141	85152	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	440228651
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1382	NC_020060	CGT	2	6	85194	85199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228651
1383	NC_020060	GCA	2	6	85274	85279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228651
1384	NC_020060	CGA	2	6	85293	85298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228651
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1390	NC_020060	CGCT	2	8	85547	85554	0 %	25 %	25 %	50 %	440228651
1391	NC_020060	A	6	6	85559	85564	100 %	0 %	0 %	0 %	440228651
1392	NC_020060	GC	3	6	85580	85585	0 %	0 %	50 %	50 %	440228651
1393	NC_020060	AT	3	6	85610	85615	50 %	50 %	0 %	0 %	440228651
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1398	NC_020060	TCA	2	6	85934	85939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228651
1399	NC_020060	ACC	2	6	86029	86034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440228651
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1404	NC_020060	CGC	2	6	86119	86124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228651
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1406	NC_020060	GCCA	2	8	86202	86209	25 %	0 %	25 %	50 %	440228651
1407	NC_020060	CGGCG	2	10	86280	86289	0 %	0 %	60 %	40 %	440228651
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1410	NC_020060	A	6	6	86591	86596	100 %	0 %	0 %	0 %	440228652
1411	NC_020060	CGC	2	6	86674	86679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228652
1412	NC_020060	TTTG	2	8	86727	86734	0 %	75 %	25 %	0 %	440228652
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1414	NC_020060	AAT	2	6	86802	86807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440228652
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1418	NC_020060	TAC	2	6	86936	86941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228652
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1491	NC_020060	CGAT	2	8	94406	94413	25 %	25 %	25 %	25 %	440228658
1492	NC_020060	GAT	2	6	94453	94458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228658
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1495	NC_020060	TCC	2	6	94496	94501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440228658
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1499	NC_020060	CGC	2	6	94828	94833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228658
1500	NC_020060	AAAG	2	8	94870	94877	75 %	0 %	25 %	0 %	440228658

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