MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 chromosome

Total Repeats: 143549

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_019678	GCTC	2	8	234471	234478	0 %	25 %	25 %	50 %	427733797
4003	NC_019678	GAA	2	6	234601	234606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733797
4004	NC_019678	TTGC	2	8	234627	234634	0 %	50 %	25 %	25 %	427733797
4005	NC_019678	AGC	2	6	234655	234660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733797
4006	NC_019678	ATT	2	6	234714	234719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733797
4007	NC_019678	CAG	2	6	234742	234747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733797
4008	NC_019678	AGCAA	2	10	234803	234812	60 %	0 %	20 %	20 %	427733797
4009	NC_019678	GGTA	2	8	234917	234924	25 %	25 %	50 %	0 %	427733797
4010	NC_019678	TGAAG	2	10	234935	234944	40 %	20 %	40 %	0 %	427733797
4011	NC_019678	AAATCA	2	12	235508	235519	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	427733798
4012	NC_019678	AGA	2	6	235566	235571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733798
4013	NC_019678	ATG	2	6	235592	235597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733798
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4015	NC_019678	GAA	2	6	235723	235728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733798
4016	NC_019678	TAA	2	6	235734	235739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733798
4017	NC_019678	AAAT	2	8	235785	235792	75 %	25 %	0 %	0 %	427733798
4018	NC_019678	TTG	2	6	235837	235842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733798
4019	NC_019678	A	6	6	235898	235903	100 %	0 %	0 %	0 %	427733798
4020	NC_019678	TAT	2	6	235958	235963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733798
4021	NC_019678	CAG	2	6	235999	236004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733798
4022	NC_019678	AT	3	6	236035	236040	50 %	50 %	0 %	0 %	427733798
4023	NC_019678	T	6	6	236056	236061	0 %	100 %	0 %	0 %	427733798
4024	NC_019678	TGG	2	6	236089	236094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427733798
4025	NC_019678	TAC	2	6	236162	236167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733798
4026	NC_019678	AGT	2	6	236223	236228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733798
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4028	NC_019678	CAA	2	6	236348	236353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733798
4029	NC_019678	ATC	2	6	236407	236412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733798
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4032	NC_019678	GAA	2	6	236609	236614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733798
4033	NC_019678	TTG	2	6	236712	236717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733798
4034	NC_019678	TAA	2	6	236844	236849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733798
4035	NC_019678	GTT	2	6	236853	236858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733798
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4038	NC_019678	GTT	2	6	236956	236961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733798
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4042	NC_019678	ACAG	2	8	237129	237136	50 %	0 %	25 %	25 %	427733798
4043	NC_019678	ATG	2	6	237245	237250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733798
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4045	NC_019678	CAC	2	6	237276	237281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427733798
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4050	NC_019678	TGGC	2	8	237453	237460	0 %	25 %	50 %	25 %	427733798
4051	NC_019678	TGA	2	6	237528	237533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733798
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4054	NC_019678	AC	3	6	237667	237672	50 %	0 %	0 %	50 %	427733798
4055	NC_019678	TGC	2	6	237693	237698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733798
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4057	NC_019678	GAA	2	6	237790	237795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733798
4058	NC_019678	CTG	2	6	237800	237805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733798
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4063	NC_019678	AATT	2	8	237894	237901	50 %	50 %	0 %	0 %	427733798
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4089	NC_019678	AG	3	6	239479	239484	50 %	0 %	50 %	0 %	427733802
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4099	NC_019678	TCCTA	2	10	239786	239795	20 %	40 %	0 %	40 %	427733803
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4103	NC_019678	A	7	7	239933	239939	100 %	0 %	0 %	0 %	427733803
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4110	NC_019678	TA	3	6	240404	240409	50 %	50 %	0 %	0 %	427733804
4111	NC_019678	AAT	2	6	240546	240551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733804
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4114	NC_019678	A	6	6	240893	240898	100 %	0 %	0 %	0 %	427733804
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4123	NC_019678	ATTT	2	8	241269	241276	25 %	75 %	0 %	0 %	427733804
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4250	NC_019678	GCT	2	6	249551	249556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733813
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4364	NC_019678	GCT	2	6	258737	258742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733822
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