MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 chromosome

Total Repeats: 143549

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3502	NC_019678	GAA	2	6	207473	207478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733772
3503	NC_019678	TAA	2	6	207493	207498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733772
3504	NC_019678	AT	3	6	207532	207537	50 %	50 %	0 %	0 %	427733772
3505	NC_019678	AAT	2	6	207629	207634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733772
3506	NC_019678	GAT	2	6	207659	207664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733772
3507	NC_019678	A	6	6	207720	207725	100 %	0 %	0 %	0 %	427733772
3508	NC_019678	ATT	2	6	207734	207739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733772
3509	NC_019678	AAGATA	2	12	207834	207845	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	427733772
3510	NC_019678	T	6	6	207904	207909	0 %	100 %	0 %	0 %	427733772
3511	NC_019678	TTG	2	6	207925	207930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733772
3512	NC_019678	AGA	2	6	207943	207948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733772
3513	NC_019678	GTT	2	6	207992	207997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733772
3514	NC_019678	AAT	2	6	208183	208188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733773
3515	NC_019678	ATT	2	6	208195	208200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733773
3516	NC_019678	TATCT	2	10	208212	208221	20 %	60 %	0 %	20 %	427733773
3517	NC_019678	GAAA	2	8	208344	208351	75 %	0 %	25 %	0 %	427733773
3518	NC_019678	A	6	6	208349	208354	100 %	0 %	0 %	0 %	427733773
3519	NC_019678	ACT	2	6	208374	208379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733773
3520	NC_019678	A	6	6	208381	208386	100 %	0 %	0 %	0 %	427733773
3521	NC_019678	CAAAG	2	10	208390	208399	60 %	0 %	20 %	20 %	427733773
3522	NC_019678	CTTTAT	2	12	208421	208432	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	427733773
3523	NC_019678	A	6	6	208447	208452	100 %	0 %	0 %	0 %	427733773
3524	NC_019678	TAG	2	6	208460	208465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733773
3525	NC_019678	GCT	2	6	208519	208524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733773
3526	NC_019678	GAA	2	6	208535	208540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733773
3527	NC_019678	ATCA	2	8	208553	208560	50 %	25 %	0 %	25 %	427733773
3528	NC_019678	TGC	2	6	208623	208628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733773
3529	NC_019678	AAAT	2	8	208656	208663	75 %	25 %	0 %	0 %	427733773
3530	NC_019678	AGT	3	9	208668	208676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733773
3531	NC_019678	GTTC	2	8	208717	208724	0 %	50 %	25 %	25 %	427733773
3532	NC_019678	AGA	2	6	208815	208820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733773
3533	NC_019678	A	7	7	208869	208875	100 %	0 %	0 %	0 %	427733773
3534	NC_019678	AGC	2	6	208878	208883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733773
3535	NC_019678	AAG	2	6	208916	208921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733773
3536	NC_019678	GCT	3	9	208942	208950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733773
3537	NC_019678	AGC	2	6	208977	208982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733773
3538	NC_019678	GAT	2	6	209008	209013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733773
3539	NC_019678	TGC	2	6	209037	209042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733773
3540	NC_019678	AAG	2	6	209052	209057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733773
3541	NC_019678	AGC	2	6	209070	209075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733773
3542	NC_019678	GCT	2	6	209131	209136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733773
3543	NC_019678	CAG	2	6	209165	209170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733773
3544	NC_019678	TTA	2	6	209180	209185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733773
3545	NC_019678	CCG	2	6	209214	209219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427733773
3546	NC_019678	A	6	6	209251	209256	100 %	0 %	0 %	0 %	427733773
3547	NC_019678	GCA	2	6	209257	209262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733773
3548	NC_019678	ATA	2	6	209297	209302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733773
3549	NC_019678	TA	3	6	209356	209361	50 %	50 %	0 %	0 %	427733773
3550	NC_019678	GAA	2	6	209443	209448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733773
3551	NC_019678	AAC	2	6	209506	209511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733773
3552	NC_019678	A	7	7	209544	209550	100 %	0 %	0 %	0 %	427733773
3553	NC_019678	GCA	2	6	209611	209616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733773
3554	NC_019678	ATT	2	6	209620	209625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733773
3555	NC_019678	TTC	2	6	209635	209640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733773
3556	NC_019678	TTA	2	6	209644	209649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733773
3557	NC_019678	TAT	2	6	209660	209665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733773
3558	NC_019678	GCT	2	6	209682	209687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733773
3559	NC_019678	TCAA	2	8	209693	209700	50 %	25 %	0 %	25 %	427733773
3560	NC_019678	TGG	2	6	209742	209747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427733773
3561	NC_019678	ATT	2	6	209770	209775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733773
3562	NC_019678	TATC	2	8	209790	209797	25 %	50 %	0 %	25 %	427733773
3563	NC_019678	CGT	2	6	209904	209909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733773
3564	NC_019678	A	6	6	209968	209973	100 %	0 %	0 %	0 %	427733773
3565	NC_019678	TAGATG	2	12	210116	210127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733773
3566	NC_019678	AGTT	2	8	210209	210216	25 %	50 %	25 %	0 %	427733773
3567	NC_019678	AGA	2	6	210351	210356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733773
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3569	NC_019678	TCA	2	6	210418	210423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733773
3570	NC_019678	TGA	2	6	210468	210473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733773
3571	NC_019678	GTC	2	6	210494	210499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733773
3572	NC_019678	TGG	2	6	210512	210517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427733773
3573	NC_019678	GAT	2	6	210564	210569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733773
3574	NC_019678	TGA	2	6	210591	210596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733773
3575	NC_019678	GAT	2	6	210604	210609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733773
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3578	NC_019678	GTA	2	6	210755	210760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733773
3579	NC_019678	GAT	2	6	210769	210774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733773
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3583	NC_019678	GCT	2	6	210913	210918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733773
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3585	NC_019678	ATGG	2	8	210957	210964	25 %	25 %	50 %	0 %	427733773
3586	NC_019678	GCT	2	6	210976	210981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733773
3587	NC_019678	TTG	2	6	211035	211040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733773
3588	NC_019678	TG	3	6	211039	211044	0 %	50 %	50 %	0 %	427733773
3589	NC_019678	AGA	2	6	211053	211058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733773
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3591	NC_019678	ATC	2	6	211614	211619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733774
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3593	NC_019678	GAA	3	9	211705	211713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733774
3594	NC_019678	GAA	2	6	211759	211764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733774
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3596	NC_019678	CAT	2	6	211822	211827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733774
3597	NC_019678	ACC	2	6	211845	211850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427733774
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3599	NC_019678	ATT	2	6	211942	211947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733774
3600	NC_019678	CAT	2	6	211952	211957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733774
3601	NC_019678	ATG	2	6	211967	211972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733774
3602	NC_019678	TGA	2	6	211992	211997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733774
3603	NC_019678	GTT	2	6	212062	212067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733774
3604	NC_019678	AGA	2	6	212115	212120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733774
3605	NC_019678	CA	3	6	212121	212126	50 %	0 %	0 %	50 %	427733774
3606	NC_019678	A	6	6	212145	212150	100 %	0 %	0 %	0 %	427733774
3607	NC_019678	AAT	2	6	212170	212175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733774
3608	NC_019678	AAG	2	6	212281	212286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733775
3609	NC_019678	CTT	2	6	212354	212359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733775
3610	NC_019678	CAAG	2	8	212436	212443	50 %	0 %	25 %	25 %	427733775
3611	NC_019678	GAT	2	6	212482	212487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733775
3612	NC_019678	GAT	2	6	212524	212529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733775
3613	NC_019678	AG	3	6	212635	212640	50 %	0 %	50 %	0 %	427733775
3614	NC_019678	AGC	2	6	212766	212771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733775
3615	NC_019678	AAG	2	6	212774	212779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733775
3616	NC_019678	GCC	2	6	212824	212829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427733775
3617	NC_019678	TGT	2	6	212919	212924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733775
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3619	NC_019678	ATA	2	6	213017	213022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733775
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3621	NC_019678	TAT	2	6	213132	213137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733775
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