MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 chromosome

Total Repeats: 143549

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_019678	CAAG	2	8	1177013	1177020	50 %	0 %	25 %	25 %	427734500
19502	NC_019678	ATT	2	6	1177309	1177314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427734501
19503	NC_019678	AGC	2	6	1177371	1177376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427734501
19504	NC_019678	GCA	2	6	1177409	1177414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427734501
19505	NC_019678	CAAG	2	8	1177457	1177464	50 %	0 %	25 %	25 %	427734501
19506	NC_019678	T	8	8	1177480	1177487	0 %	100 %	0 %	0 %	427734501
19507	NC_019678	CTG	2	6	1177545	1177550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427734501
19508	NC_019678	CTCAT	2	10	1177577	1177586	20 %	40 %	0 %	40 %	427734501
19509	NC_019678	GTT	2	6	1177589	1177594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427734501
19510	NC_019678	ATT	2	6	1177600	1177605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427734501
19511	NC_019678	AGC	2	6	1177693	1177698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427734501
19512	NC_019678	ATT	2	6	1177921	1177926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427734502
19513	NC_019678	CAA	2	6	1177990	1177995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427734502
19514	NC_019678	ACC	2	6	1178024	1178029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427734502
19515	NC_019678	TCG	2	6	1178076	1178081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427734502
19516	NC_019678	TAA	2	6	1178180	1178185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427734502
19517	NC_019678	AATT	2	8	1178285	1178292	50 %	50 %	0 %	0 %	427734502
19518	NC_019678	CTT	2	6	1178404	1178409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427734502
19519	NC_019678	TGA	2	6	1178415	1178420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427734502
19520	NC_019678	AAAT	2	8	1178483	1178490	75 %	25 %	0 %	0 %	427734502
19521	NC_019678	A	6	6	1178546	1178551	100 %	0 %	0 %	0 %	427734502
19522	NC_019678	TCT	2	6	1178706	1178711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427734502
19523	NC_019678	AAT	2	6	1178718	1178723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427734502
19524	NC_019678	TGC	2	6	1178738	1178743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427734502
19525	NC_019678	TTCT	2	8	1178788	1178795	0 %	75 %	0 %	25 %	427734502
19526	NC_019678	TCCAA	2	10	1178894	1178903	40 %	20 %	0 %	40 %	427734502
19527	NC_019678	TGAAA	2	10	1178916	1178925	60 %	20 %	20 %	0 %	427734502
19528	NC_019678	TAA	2	6	1178962	1178967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427734502
19529	NC_019678	ATT	2	6	1178984	1178989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427734502
19530	NC_019678	CAG	2	6	1179023	1179028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427734502
19531	NC_019678	AAT	2	6	1179047	1179052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427734502
19532	NC_019678	CTTTGG	2	12	1179059	1179070	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	427734502
19533	NC_019678	TG	3	6	1179088	1179093	0 %	50 %	50 %	0 %	427734502
19534	NC_019678	GTA	2	6	1179167	1179172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427734502
19535	NC_019678	AAT	2	6	1179265	1179270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427734502
19536	NC_019678	CTC	2	6	1179346	1179351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427734502
19537	NC_019678	TCT	2	6	1179363	1179368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427734502
19538	NC_019678	ATT	2	6	1179401	1179406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427734502
19539	NC_019678	CAA	2	6	1179427	1179432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427734502
19540	NC_019678	TAT	2	6	1179532	1179537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427734502
19541	NC_019678	CAG	2	6	1180109	1180114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427734503
19542	NC_019678	GCT	2	6	1180132	1180137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427734503
19543	NC_019678	CTT	2	6	1180225	1180230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427734503
19544	NC_019678	TGGT	2	8	1180291	1180298	0 %	50 %	50 %	0 %	427734503
19545	NC_019678	GAA	2	6	1180318	1180323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427734503
19546	NC_019678	GAA	2	6	1180327	1180332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427734503
19547	NC_019678	CAT	3	9	1180333	1180341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427734503
19548	NC_019678	ACT	2	6	1180423	1180428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427734503
19549	NC_019678	TGGT	2	8	1180453	1180460	0 %	50 %	50 %	0 %	427734503
19550	NC_019678	TTAT	2	8	1180510	1180517	25 %	75 %	0 %	0 %	427734503
19551	NC_019678	GCTTAC	2	12	1180580	1180591	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	427734503
19552	NC_019678	AGT	2	6	1180599	1180604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427734503
19553	NC_019678	AGA	2	6	1180701	1180706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427734503
19554	NC_019678	A	6	6	1180712	1180717	100 %	0 %	0 %	0 %	427734503
19555	NC_019678	GTT	2	6	1180725	1180730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427734503
19556	NC_019678	ACT	2	6	1180876	1180881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427734504
19557	NC_019678	GCT	2	6	1180884	1180889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427734504
19558	NC_019678	CTAA	2	8	1180941	1180948	50 %	25 %	0 %	25 %	427734504
19559	NC_019678	TCA	2	6	1180950	1180955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427734504
19560	NC_019678	GAT	2	6	1181012	1181017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427734504
19561	NC_019678	CTG	2	6	1181065	1181070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427734504
19562	NC_019678	AGC	3	9	1181102	1181110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427734504
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19564	NC_019678	ACA	2	6	1181142	1181147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427734504
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19566	NC_019678	A	6	6	1181180	1181185	100 %	0 %	0 %	0 %	427734504
19567	NC_019678	TCTT	2	8	1181189	1181196	0 %	75 %	0 %	25 %	427734504
19568	NC_019678	CGT	2	6	1181203	1181208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427734504
19569	NC_019678	GACT	2	8	1181230	1181237	25 %	25 %	25 %	25 %	427734504
19570	NC_019678	ACCA	2	8	1181252	1181259	50 %	0 %	0 %	50 %	427734504
19571	NC_019678	TAA	2	6	1181287	1181292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427734504
19572	NC_019678	A	6	6	1181660	1181665	100 %	0 %	0 %	0 %	427734505
19573	NC_019678	GCTAAA	2	12	1181666	1181677	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	427734505
19574	NC_019678	GTAA	2	8	1181678	1181685	50 %	25 %	25 %	0 %	427734505
19575	NC_019678	A	6	6	1181690	1181695	100 %	0 %	0 %	0 %	427734505
19576	NC_019678	AAT	2	6	1181741	1181746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427734505
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19582	NC_019678	AT	3	6	1182196	1182201	50 %	50 %	0 %	0 %	427734505
19583	NC_019678	GAA	2	6	1182263	1182268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427734505
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19585	NC_019678	ATT	2	6	1182410	1182415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427734505
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19587	NC_019678	AAG	2	6	1182525	1182530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427734505
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19589	NC_019678	ATG	2	6	1182612	1182617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427734505
19590	NC_019678	ACA	2	6	1182651	1182656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427734505
19591	NC_019678	TCAG	2	8	1182766	1182773	25 %	25 %	25 %	25 %	427734505
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19601	NC_019678	TCT	2	6	1183091	1183096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427734505
19602	NC_019678	CTG	2	6	1183138	1183143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427734505
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19604	NC_019678	ACGCG	2	10	1183199	1183208	20 %	0 %	40 %	40 %	427734505
19605	NC_019678	TGAG	2	8	1183461	1183468	25 %	25 %	50 %	0 %	427734505
19606	NC_019678	GTA	2	6	1183469	1183474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427734505
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19611	NC_019678	TCTT	2	8	1183618	1183625	0 %	75 %	0 %	25 %	427734505
19612	NC_019678	AAAAC	2	10	1183925	1183934	80 %	0 %	0 %	20 %	427734506
19613	NC_019678	TTA	2	6	1183965	1183970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427734506
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