MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 chromosome

Total Repeats: 143549

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_019678	TCC	2	6	1114991	1114996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427734459
18502	NC_019678	T	6	6	1115027	1115032	0 %	100 %	0 %	0 %	427734459
18503	NC_019678	ATA	2	6	1115037	1115042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427734459
18504	NC_019678	ACTTA	2	10	1115062	1115071	40 %	40 %	0 %	20 %	427734459
18505	NC_019678	TAA	3	9	1115167	1115175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427734459
18506	NC_019678	CT	3	6	1115212	1115217	0 %	50 %	0 %	50 %	427734459
18507	NC_019678	A	6	6	1115297	1115302	100 %	0 %	0 %	0 %	427734459
18508	NC_019678	CAT	2	6	1115328	1115333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427734459
18509	NC_019678	TCA	2	6	1115334	1115339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427734459
18510	NC_019678	ATA	2	6	1115340	1115345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427734459
18511	NC_019678	T	6	6	1115355	1115360	0 %	100 %	0 %	0 %	427734459
18512	NC_019678	TC	3	6	1115408	1115413	0 %	50 %	0 %	50 %	427734459
18513	NC_019678	GAT	2	6	1115427	1115432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427734459
18514	NC_019678	TGGC	2	8	1115436	1115443	0 %	25 %	50 %	25 %	427734459
18515	NC_019678	AAT	2	6	1116277	1116282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427734460
18516	NC_019678	AGC	2	6	1116458	1116463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427734460
18517	NC_019678	CTA	2	6	1116579	1116584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427734460
18518	NC_019678	T	6	6	1116586	1116591	0 %	100 %	0 %	0 %	427734460
18519	NC_019678	TCCTT	2	10	1116672	1116681	0 %	60 %	0 %	40 %	427734460
18520	NC_019678	CTC	2	6	1116691	1116696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427734460
18521	NC_019678	CAT	2	6	1116751	1116756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427734460
18522	NC_019678	ATT	2	6	1117013	1117018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427734461
18523	NC_019678	TTC	2	6	1117038	1117043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427734461
18524	NC_019678	ACC	2	6	1117086	1117091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427734461
18525	NC_019678	AATT	2	8	1117134	1117141	50 %	50 %	0 %	0 %	427734461
18526	NC_019678	TAA	2	6	1117157	1117162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427734461
18527	NC_019678	CTG	2	6	1117163	1117168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427734461
18528	NC_019678	TGC	2	6	1117184	1117189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427734461
18529	NC_019678	GAT	2	6	1117194	1117199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427734461
18530	NC_019678	GTT	2	6	1117235	1117240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427734461
18531	NC_019678	TGC	2	6	1117245	1117250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427734461
18532	NC_019678	TGC	2	6	1117310	1117315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427734461
18533	NC_019678	TGAGT	2	10	1117316	1117325	20 %	40 %	40 %	0 %	427734461
18534	NC_019678	TAGG	2	8	1117345	1117352	25 %	25 %	50 %	0 %	427734461
18535	NC_019678	GAAA	2	8	1117528	1117535	75 %	0 %	25 %	0 %	427734461
18536	NC_019678	TTG	2	6	1117561	1117566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427734461
18537	NC_019678	TTG	2	6	1117578	1117583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427734461
18538	NC_019678	TAA	2	6	1117585	1117590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427734461
18539	NC_019678	AAG	2	6	1117624	1117629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427734461
18540	NC_019678	GAT	2	6	1117667	1117672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427734461
18541	NC_019678	TTC	2	6	1117701	1117706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427734461
18542	NC_019678	T	6	6	1117712	1117717	0 %	100 %	0 %	0 %	427734461
18543	NC_019678	GTG	2	6	1117728	1117733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427734461
18544	NC_019678	GTA	2	6	1117734	1117739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427734461
18545	NC_019678	AGT	2	6	1117759	1117764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427734461
18546	NC_019678	TTG	2	6	1117830	1117835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427734461
18547	NC_019678	AATT	2	8	1117842	1117849	50 %	50 %	0 %	0 %	427734461
18548	NC_019678	CAT	2	6	1118050	1118055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427734462
18549	NC_019678	GGAATT	2	12	1118065	1118076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427734462
18550	NC_019678	AATC	2	8	1118079	1118086	50 %	25 %	0 %	25 %	427734462
18551	NC_019678	GAT	2	6	1118137	1118142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427734462
18552	NC_019678	TTTG	2	8	1118155	1118162	0 %	75 %	25 %	0 %	427734462
18553	NC_019678	TAG	2	6	1118176	1118181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427734462
18554	NC_019678	TCT	2	6	1118207	1118212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427734462
18555	NC_019678	GAG	2	6	1118242	1118247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427734462
18556	NC_019678	TAT	2	6	1118250	1118255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427734462
18557	NC_019678	TGCT	2	8	1118279	1118286	0 %	50 %	25 %	25 %	427734462
18558	NC_019678	CCA	2	6	1118310	1118315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427734462
18559	NC_019678	TCT	2	6	1118354	1118359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427734462
18560	NC_019678	TTA	2	6	1118435	1118440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427734462
18561	NC_019678	CAT	2	6	1118478	1118483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427734462
18562	NC_019678	TAA	2	6	1118497	1118502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427734462
18563	NC_019678	A	7	7	1118555	1118561	100 %	0 %	0 %	0 %	427734462
18564	NC_019678	TGA	2	6	1118598	1118603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427734462
18565	NC_019678	CTT	2	6	1118641	1118646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427734462
18566	NC_019678	ACC	2	6	1118656	1118661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427734462
18567	NC_019678	TC	3	6	1118699	1118704	0 %	50 %	0 %	50 %	427734462
18568	NC_019678	TCT	2	6	1118804	1118809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427734462
18569	NC_019678	TCA	2	6	1118864	1118869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427734462
18570	NC_019678	CCAAA	2	10	1118886	1118895	60 %	0 %	0 %	40 %	427734462
18571	NC_019678	TTCCC	2	10	1118932	1118941	0 %	40 %	0 %	60 %	427734462
18572	NC_019678	CAAAT	2	10	1118962	1118971	60 %	20 %	0 %	20 %	427734462
18573	NC_019678	TAC	2	6	1119051	1119056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427734462
18574	NC_019678	TCA	2	6	1119068	1119073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427734462
18575	NC_019678	AAC	2	6	1119116	1119121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427734462
18576	NC_019678	GTT	2	6	1119128	1119133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427734462
18577	NC_019678	TTA	2	6	1119164	1119169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427734462
18578	NC_019678	CGAAA	2	10	1119186	1119195	60 %	0 %	20 %	20 %	427734462
18579	NC_019678	GCG	2	6	1119200	1119205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427734462
18580	NC_019678	TACT	3	12	1119254	1119265	25 %	50 %	0 %	25 %	427734462
18581	NC_019678	CTG	2	6	1119274	1119279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427734462
18582	NC_019678	CAC	2	6	1119298	1119303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427734462
18583	NC_019678	A	6	6	1119473	1119478	100 %	0 %	0 %	0 %	427734462
18584	NC_019678	A	6	6	1119490	1119495	100 %	0 %	0 %	0 %	427734462
18585	NC_019678	TCC	2	6	1119496	1119501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427734462
18586	NC_019678	CTG	2	6	1119522	1119527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427734462
18587	NC_019678	ATC	2	6	1119535	1119540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427734462
18588	NC_019678	TAG	2	6	1119543	1119548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427734462
18589	NC_019678	A	6	6	1119564	1119569	100 %	0 %	0 %	0 %	427734462
18590	NC_019678	CTC	2	6	1119593	1119598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427734462
18591	NC_019678	ACA	2	6	1119632	1119637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427734462
18592	NC_019678	CCAG	2	8	1119645	1119652	25 %	0 %	25 %	50 %	427734462
18593	NC_019678	CTG	2	6	1119675	1119680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427734462
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18596	NC_019678	TGC	2	6	1119749	1119754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427734462
18597	NC_019678	CTCA	2	8	1119832	1119839	25 %	25 %	0 %	50 %	427734462
18598	NC_019678	ATTA	2	8	1119862	1119869	50 %	50 %	0 %	0 %	427734462
18599	NC_019678	ATT	2	6	1120012	1120017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427734462
18600	NC_019678	ACC	2	6	1120040	1120045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427734462
18601	NC_019678	T	6	6	1120071	1120076	0 %	100 %	0 %	0 %	427734462
18602	NC_019678	AATCGG	2	12	1120090	1120101	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	427734462
18603	NC_019678	CATACT	2	12	1120185	1120196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427734462
18604	NC_019678	ATT	2	6	1120255	1120260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427734462
18605	NC_019678	GAT	2	6	1120321	1120326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427734462
18606	NC_019678	TTA	2	6	1120796	1120801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427734463
18607	NC_019678	A	7	7	1120821	1120827	100 %	0 %	0 %	0 %	427734463
18608	NC_019678	ATT	2	6	1120866	1120871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427734463
18609	NC_019678	CGGTAG	2	12	1120940	1120951	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	427734463
18610	NC_019678	ACT	2	6	1121077	1121082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427734463
18611	NC_019678	GTG	2	6	1121083	1121088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427734463
18612	NC_019678	TCA	2	6	1121175	1121180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427734463
18613	NC_019678	CTT	2	6	1121186	1121191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427734463
18614	NC_019678	T	7	7	1121202	1121208	0 %	100 %	0 %	0 %	427734463
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