MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 chromosome

Total Repeats: 143549

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_019678	AGCA	2	8	1025508	1025515	50 %	0 %	25 %	25 %	427734389
17003	NC_019678	TAA	2	6	1025538	1025543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427734389
17004	NC_019678	ACTA	2	8	1025550	1025557	50 %	25 %	0 %	25 %	427734389
17005	NC_019678	CCA	2	6	1025617	1025622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427734389
17006	NC_019678	TTC	2	6	1025647	1025652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427734389
17007	NC_019678	TGT	2	6	1025687	1025692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427734389
17008	NC_019678	AGC	2	6	1025710	1025715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427734389
17009	NC_019678	TAT	2	6	1025735	1025740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427734389
17010	NC_019678	CTT	2	6	1025746	1025751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427734389
17011	NC_019678	TAA	2	6	1025898	1025903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427734389
17012	NC_019678	A	6	6	1025902	1025907	100 %	0 %	0 %	0 %	427734389
17013	NC_019678	A	6	6	1025914	1025919	100 %	0 %	0 %	0 %	427734389
17014	NC_019678	ATT	2	6	1025989	1025994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427734389
17015	NC_019678	GGC	2	6	1026028	1026033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427734389
17016	NC_019678	TCCGAA	2	12	1026043	1026054	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	427734389
17017	NC_019678	TGGC	2	8	1026061	1026068	0 %	25 %	50 %	25 %	427734389
17018	NC_019678	A	7	7	1026370	1026376	100 %	0 %	0 %	0 %	427734390
17019	NC_019678	TCT	2	6	1026380	1026385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427734390
17020	NC_019678	AGC	2	6	1026421	1026426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427734390
17021	NC_019678	TA	3	6	1026433	1026438	50 %	50 %	0 %	0 %	427734390
17022	NC_019678	CTCAA	2	10	1026534	1026543	40 %	20 %	0 %	40 %	427734390
17023	NC_019678	CAAAA	2	10	1026557	1026566	80 %	0 %	0 %	20 %	427734390
17024	NC_019678	GGA	2	6	1026602	1026607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427734390
17025	NC_019678	AAG	2	6	1026627	1026632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427734390
17026	NC_019678	T	7	7	1026643	1026649	0 %	100 %	0 %	0 %	427734390
17027	NC_019678	ATTA	2	8	1026686	1026693	50 %	50 %	0 %	0 %	427734390
17028	NC_019678	CAG	3	9	1026720	1026728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427734390
17029	NC_019678	TAA	2	6	1026763	1026768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427734390
17030	NC_019678	CTG	2	6	1026819	1026824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427734390
17031	NC_019678	A	8	8	1026896	1026903	100 %	0 %	0 %	0 %	427734390
17032	NC_019678	TGC	2	6	1026910	1026915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427734390
17033	NC_019678	GAA	2	6	1026964	1026969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427734390
17034	NC_019678	TAT	2	6	1026977	1026982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427734390
17035	NC_019678	ATTA	2	8	1027049	1027056	50 %	50 %	0 %	0 %	427734390
17036	NC_019678	TA	3	6	1027176	1027181	50 %	50 %	0 %	0 %	427734390
17037	NC_019678	AAG	2	6	1027188	1027193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427734390
17038	NC_019678	TGG	2	6	1027201	1027206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427734390
17039	NC_019678	TAA	2	6	1027210	1027215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427734390
17040	NC_019678	AAAACA	2	12	1027216	1027227	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	427734390
17041	NC_019678	TAA	2	6	1027257	1027262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427734390
17042	NC_019678	ATT	2	6	1027270	1027275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427734390
17043	NC_019678	AGA	2	6	1027287	1027292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427734390
17044	NC_019678	TTG	3	9	1027568	1027576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427734391
17045	NC_019678	GATTTT	2	12	1027581	1027592	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	427734391
17046	NC_019678	A	7	7	1027600	1027606	100 %	0 %	0 %	0 %	427734391
17047	NC_019678	AAGA	2	8	1027700	1027707	75 %	0 %	25 %	0 %	427734391
17048	NC_019678	ATA	2	6	1027710	1027715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427734391
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17050	NC_019678	CTT	3	9	1027911	1027919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427734392
17051	NC_019678	TTAA	2	8	1027937	1027944	50 %	50 %	0 %	0 %	427734392
17052	NC_019678	ATC	2	6	1027990	1027995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427734392
17053	NC_019678	GCA	2	6	1028099	1028104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427734392
17054	NC_019678	TTC	2	6	1028115	1028120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427734392
17055	NC_019678	TCA	2	6	1028129	1028134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427734392
17056	NC_019678	TCT	2	6	1028135	1028140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427734392
17057	NC_019678	ATG	3	9	1028144	1028152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427734392
17058	NC_019678	CCA	2	6	1028219	1028224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427734392
17059	NC_019678	GTG	2	6	1028317	1028322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427734392
17060	NC_019678	TAAA	2	8	1028334	1028341	75 %	25 %	0 %	0 %	427734392
17061	NC_019678	GCT	2	6	1028429	1028434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427734392
17062	NC_019678	TGC	2	6	1028440	1028445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427734392
17063	NC_019678	GCT	2	6	1028567	1028572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427734392
17064	NC_019678	CTAA	2	8	1028597	1028604	50 %	25 %	0 %	25 %	427734392
17065	NC_019678	TTCT	2	8	1028649	1028656	0 %	75 %	0 %	25 %	427734392
17066	NC_019678	GTC	2	6	1028677	1028682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427734392
17067	NC_019678	GCA	2	6	1028789	1028794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427734392
17068	NC_019678	ACACC	2	10	1028802	1028811	40 %	0 %	0 %	60 %	427734392
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17070	NC_019678	CTA	2	6	1028943	1028948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427734392
17071	NC_019678	TAG	4	12	1029030	1029041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427734392
17072	NC_019678	AGT	2	6	1029082	1029087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427734392
17073	NC_019678	GCA	2	6	1029122	1029127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427734392
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17085	NC_019678	CAA	2	6	1029642	1029647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427734392
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17100	NC_019678	AAG	2	6	1030374	1030379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427734392
17101	NC_019678	TCA	2	6	1030939	1030944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427734393
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17103	NC_019678	A	7	7	1031254	1031260	100 %	0 %	0 %	0 %	427734393
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17106	NC_019678	T	6	6	1031341	1031346	0 %	100 %	0 %	0 %	427734393
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