MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 chromosome

Total Repeats: 143549

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_019678	T	6	6	909187	909192	0 %	100 %	0 %	0 %	427734310
15003	NC_019678	CTT	2	6	909429	909434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427734310
15004	NC_019678	TCCG	2	8	909446	909453	0 %	25 %	25 %	50 %	427734310
15005	NC_019678	AAGC	2	8	909481	909488	50 %	0 %	25 %	25 %	427734310
15006	NC_019678	CTG	2	6	909500	909505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427734310
15007	NC_019678	GAT	2	6	909514	909519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427734310
15008	NC_019678	TGA	2	6	909549	909554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427734310
15009	NC_019678	ATT	2	6	909565	909570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427734310
15010	NC_019678	CAA	2	6	909671	909676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427734310
15011	NC_019678	CTT	2	6	909687	909692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427734310
15012	NC_019678	GAC	2	6	909700	909705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427734310
15013	NC_019678	AGC	2	6	909801	909806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427734310
15014	NC_019678	GA	3	6	909807	909812	50 %	0 %	50 %	0 %	427734310
15015	NC_019678	ACCAG	2	10	909891	909900	40 %	0 %	20 %	40 %	427734310
15016	NC_019678	GAA	2	6	909904	909909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427734310
15017	NC_019678	CCAA	2	8	909938	909945	50 %	0 %	0 %	50 %	427734310
15018	NC_019678	GTT	2	6	909991	909996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427734310
15019	NC_019678	TTC	2	6	910020	910025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427734310
15020	NC_019678	GTA	2	6	910063	910068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427734310
15021	NC_019678	GAT	2	6	910135	910140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427734310
15022	NC_019678	AGGCA	2	10	910178	910187	40 %	0 %	40 %	20 %	427734310
15023	NC_019678	AGA	2	6	910203	910208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427734310
15024	NC_019678	GGTA	2	8	910311	910318	25 %	25 %	50 %	0 %	427734310
15025	NC_019678	ATT	2	6	910362	910367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427734310
15026	NC_019678	CCA	2	6	910489	910494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427734310
15027	NC_019678	TGG	2	6	910505	910510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427734310
15028	NC_019678	TAA	2	6	910575	910580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427734310
15029	NC_019678	ATT	2	6	910585	910590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427734310
15030	NC_019678	TGCT	2	8	910705	910712	0 %	50 %	25 %	25 %	427734310
15031	NC_019678	GAA	2	6	910777	910782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427734310
15032	NC_019678	AAG	2	6	910814	910819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427734310
15033	NC_019678	TA	3	6	910847	910852	50 %	50 %	0 %	0 %	427734310
15034	NC_019678	TTG	2	6	911113	911118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427734310
15035	NC_019678	CGA	2	6	911130	911135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427734310
15036	NC_019678	ACG	2	6	911282	911287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427734310
15037	NC_019678	TCG	2	6	911334	911339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427734310
15038	NC_019678	ACC	2	6	911343	911348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427734310
15039	NC_019678	GAA	2	6	911386	911391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427734310
15040	NC_019678	AAT	2	6	911606	911611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427734311
15041	NC_019678	GGT	2	6	911692	911697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427734311
15042	NC_019678	ATGG	2	8	911750	911757	25 %	25 %	50 %	0 %	427734311
15043	NC_019678	AG	3	6	911820	911825	50 %	0 %	50 %	0 %	427734311
15044	NC_019678	TA	3	6	911903	911908	50 %	50 %	0 %	0 %	427734311
15045	NC_019678	AGCT	2	8	911910	911917	25 %	25 %	25 %	25 %	427734311
15046	NC_019678	CTG	2	6	911972	911977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427734311
15047	NC_019678	AGA	2	6	912079	912084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427734311
15048	NC_019678	TGC	2	6	912168	912173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427734311
15049	NC_019678	TAAC	2	8	912228	912235	50 %	25 %	0 %	25 %	427734311
15050	NC_019678	A	6	6	912246	912251	100 %	0 %	0 %	0 %	427734311
15051	NC_019678	ATGG	2	8	912316	912323	25 %	25 %	50 %	0 %	427734311
15052	NC_019678	TCC	2	6	912346	912351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427734311
15053	NC_019678	GGT	2	6	912380	912385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427734311
15054	NC_019678	ATT	2	6	912479	912484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427734311
15055	NC_019678	TGC	2	6	912504	912509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427734311
15056	NC_019678	AAG	2	6	912510	912515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427734311
15057	NC_019678	GTC	2	6	912540	912545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427734311
15058	NC_019678	ATT	2	6	912599	912604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427734311
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15060	NC_019678	GAA	2	6	912663	912668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427734311
15061	NC_019678	ATT	2	6	912736	912741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427734311
15062	NC_019678	AATC	2	8	912754	912761	50 %	25 %	0 %	25 %	427734311
15063	NC_019678	ATTA	2	8	912763	912770	50 %	50 %	0 %	0 %	427734311
15064	NC_019678	GCG	2	6	912797	912802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427734311
15065	NC_019678	AATT	2	8	912807	912814	50 %	50 %	0 %	0 %	427734311
15066	NC_019678	GAA	2	6	912848	912853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427734311
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15070	NC_019678	ATT	2	6	913143	913148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427734311
15071	NC_019678	CAG	2	6	913152	913157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427734311
15072	NC_019678	AGCA	2	8	913168	913175	50 %	0 %	25 %	25 %	427734311
15073	NC_019678	GAACAA	2	12	913226	913237	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	427734311
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15079	NC_019678	AGTT	2	8	913463	913470	25 %	50 %	25 %	0 %	427734311
15080	NC_019678	A	6	6	913671	913676	100 %	0 %	0 %	0 %	427734312
15081	NC_019678	AAG	2	6	913703	913708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427734312
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15086	NC_019678	GA	3	6	913923	913928	50 %	0 %	50 %	0 %	427734312
15087	NC_019678	GGT	2	6	913999	914004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427734312
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15092	NC_019678	ATT	2	6	914135	914140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427734312
15093	NC_019678	CAT	2	6	914191	914196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427734312
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15099	NC_019678	ACTG	2	8	914309	914316	25 %	25 %	25 %	25 %	427734312
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15103	NC_019678	GAA	2	6	914471	914476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427734312
15104	NC_019678	GTTC	2	8	914519	914526	0 %	50 %	25 %	25 %	427734312
15105	NC_019678	TGG	2	6	914598	914603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427734312
15106	NC_019678	TAT	2	6	914623	914628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427734312
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15108	NC_019678	TTTG	2	8	914803	914810	0 %	75 %	25 %	0 %	427734312
15109	NC_019678	AAT	2	6	914906	914911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427734312
15110	NC_019678	ATT	2	6	914935	914940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427734312
15111	NC_019678	A	6	6	915054	915059	100 %	0 %	0 %	0 %	427734312
15112	NC_019678	TAC	4	12	915076	915087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427734312
15113	NC_019678	TA	3	6	915129	915134	50 %	50 %	0 %	0 %	427734312
15114	NC_019678	CCT	2	6	915140	915145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427734312
15115	NC_019678	AAT	2	6	915283	915288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427734312
15116	NC_019678	GCC	2	6	915314	915319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427734312
15117	NC_019678	TAC	2	6	915361	915366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427734312
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15240	NC_019678	AGA	2	6	920853	920858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427734314
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15243	NC_019678	TTCC	2	8	922032	922039	0 %	50 %	0 %	50 %	427734315
15244	NC_019678	TTG	2	6	922045	922050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427734315
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15357	NC_019678	TCC	2	6	927643	927648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427734318
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