MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 chromosome

Total Repeats: 143549

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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79502	NC_019678	TAC	2	6	4851213	4851218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427737340
79503	NC_019678	TAT	2	6	4851236	4851241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427737340
79504	NC_019678	TTTAA	2	10	4851259	4851268	40 %	60 %	0 %	0 %	427737340
79505	NC_019678	ATT	2	6	4851309	4851314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427737340
79506	NC_019678	GTT	2	6	4851395	4851400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427737340
79507	NC_019678	CTT	2	6	4851467	4851472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427737340
79508	NC_019678	T	6	6	4851471	4851476	0 %	100 %	0 %	0 %	427737340
79509	NC_019678	TA	3	6	4851555	4851560	50 %	50 %	0 %	0 %	427737340
79510	NC_019678	TATAAG	2	12	4851611	4851622	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	427737340
79511	NC_019678	CAT	2	6	4851687	4851692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427737340
79512	NC_019678	AGC	2	6	4852084	4852089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427737341
79513	NC_019678	CCT	2	6	4852103	4852108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427737341
79514	NC_019678	A	6	6	4852170	4852175	100 %	0 %	0 %	0 %	427737341
79515	NC_019678	ATG	2	6	4852187	4852192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427737341
79516	NC_019678	AGCC	2	8	4852196	4852203	25 %	0 %	25 %	50 %	427737341
79517	NC_019678	TGG	2	6	4852222	4852227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427737341
79518	NC_019678	CAAC	2	8	4852254	4852261	50 %	0 %	0 %	50 %	427737341
79519	NC_019678	AAC	3	9	4852259	4852267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427737341
79520	NC_019678	AGCG	2	8	4852290	4852297	25 %	0 %	50 %	25 %	427737341
79521	NC_019678	GCTC	2	8	4852319	4852326	0 %	25 %	25 %	50 %	427737341
79522	NC_019678	CTTTT	2	10	4852333	4852342	0 %	80 %	0 %	20 %	427737341
79523	NC_019678	CAG	2	6	4852365	4852370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427737341
79524	NC_019678	ACC	2	6	4852381	4852386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427737341
79525	NC_019678	GCTTG	2	10	4852619	4852628	0 %	40 %	40 %	20 %	427737342
79526	NC_019678	GCT	2	6	4852654	4852659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427737342
79527	NC_019678	ATC	2	6	4852717	4852722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427737342
79528	NC_019678	TGCAAA	2	12	4852738	4852749	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	427737342
79529	NC_019678	T	7	7	4852771	4852777	0 %	100 %	0 %	0 %	427737342
79530	NC_019678	T	7	7	4852779	4852785	0 %	100 %	0 %	0 %	427737342
79531	NC_019678	GGC	2	6	4852790	4852795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427737342
79532	NC_019678	CCA	2	6	4852816	4852821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427737342
79533	NC_019678	GCTAG	2	10	4852825	4852834	20 %	20 %	40 %	20 %	427737342
79534	NC_019678	CTG	2	6	4852859	4852864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427737342
79535	NC_019678	AATA	2	8	4852930	4852937	75 %	25 %	0 %	0 %	427737342
79536	NC_019678	CATGG	2	10	4852947	4852956	20 %	20 %	40 %	20 %	427737342
79537	NC_019678	CAAC	2	8	4852992	4852999	50 %	0 %	0 %	50 %	427737342
79538	NC_019678	CAG	2	6	4853000	4853005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427737342
79539	NC_019678	CAG	2	6	4853015	4853020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427737342
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79555	NC_019678	CTTT	2	8	4854515	4854522	0 %	75 %	0 %	25 %	427737344
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79557	NC_019678	T	6	6	4854537	4854542	0 %	100 %	0 %	0 %	427737344
79558	NC_019678	CTAC	2	8	4854599	4854606	25 %	25 %	0 %	50 %	427737344
79559	NC_019678	AGAT	2	8	4854624	4854631	50 %	25 %	25 %	0 %	427737344
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