MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-1 chromosome

Total Repeats: 45672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27002	NC_018609	AGG	2	6	1369449	1369454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407452058
27003	NC_018609	ATT	2	6	1369458	1369463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407452058
27004	NC_018609	CTT	2	6	1369490	1369495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407452058
27005	NC_018609	ACA	2	6	1369537	1369542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407452058
27006	NC_018609	AGA	2	6	1369776	1369781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407452058
27007	NC_018609	GATT	2	8	1369803	1369810	25 %	50 %	25 %	0 %	407452058
27008	NC_018609	AGA	2	6	1369835	1369840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407452058
27009	NC_018609	AAAG	2	8	1369929	1369936	75 %	0 %	25 %	0 %	407452058
27010	NC_018609	AGA	2	6	1369989	1369994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407452058
27011	NC_018609	ATT	2	6	1370018	1370023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407452058
27012	NC_018609	ATG	2	6	1370033	1370038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407452058
27013	NC_018609	CAA	2	6	1370073	1370078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407452058
27014	NC_018609	TTA	2	6	1370141	1370146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407452058
27015	NC_018609	GTAGA	2	10	1370225	1370234	40 %	20 %	40 %	0 %	407452058
27016	NC_018609	TGG	2	6	1370244	1370249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407452058
27017	NC_018609	TTA	2	6	1370339	1370344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407452058
27018	NC_018609	ATTGGT	2	12	1370455	1370466	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	407452058
27019	NC_018609	GAT	2	6	1370523	1370528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407452058
27020	NC_018609	AAT	2	6	1370536	1370541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407452058
27021	NC_018609	TTC	2	6	1370563	1370568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407452058
27022	NC_018609	ATA	2	6	1370582	1370587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407452058
27023	NC_018609	TTG	2	6	1370651	1370656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407452058
27024	NC_018609	AGG	2	6	1370775	1370780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407452058
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27026	NC_018609	AAGT	2	8	1370822	1370829	50 %	25 %	25 %	0 %	407452058
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27029	NC_018609	GGT	2	6	1371042	1371047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407452058
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27033	NC_018609	TAAA	2	8	1371251	1371258	75 %	25 %	0 %	0 %	407452059
27034	NC_018609	AGT	2	6	1371276	1371281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407452059
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27036	NC_018609	GAT	2	6	1371583	1371588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407452059
27037	NC_018609	ACT	2	6	1371604	1371609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407452059
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27039	NC_018609	GCTTCT	2	12	1371745	1371756	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	407452059
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27043	NC_018609	TGG	2	6	1371962	1371967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407452059
27044	NC_018609	T	6	6	1372027	1372032	0 %	100 %	0 %	0 %	407452060
27045	NC_018609	TAAA	2	8	1372034	1372041	75 %	25 %	0 %	0 %	407452060
27046	NC_018609	TAT	2	6	1372042	1372047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407452060
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27051	NC_018609	GAA	2	6	1372381	1372386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407452060
27052	NC_018609	ATG	2	6	1372469	1372474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407452060
27053	NC_018609	CTG	2	6	1372718	1372723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407452060
27054	NC_018609	AGCTAA	2	12	1372731	1372742	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407452060
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27059	NC_018609	TAG	2	6	1372859	1372864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407452060
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27064	NC_018609	AGCTA	2	10	1373077	1373086	40 %	20 %	20 %	20 %	407452061
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27087	NC_018609	TGAAGA	2	12	1374612	1374623	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407452064
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27091	NC_018609	AG	3	6	1374766	1374771	50 %	0 %	50 %	0 %	407452065
27092	NC_018609	TA	3	6	1374806	1374811	50 %	50 %	0 %	0 %	407452065
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27098	NC_018609	TGG	2	6	1375062	1375067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407452065
27099	NC_018609	A	6	6	1375089	1375094	100 %	0 %	0 %	0 %	407452065
27100	NC_018609	TTA	2	6	1375156	1375161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407452065
27101	NC_018609	TAC	2	6	1375177	1375182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407452065
27102	NC_018609	TCT	2	6	1375267	1375272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407452065
27103	NC_018609	TAA	2	6	1375333	1375338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407452065
27104	NC_018609	A	6	6	1375350	1375355	100 %	0 %	0 %	0 %	407452065
27105	NC_018609	A	6	6	1375402	1375407	100 %	0 %	0 %	0 %	407452065
27106	NC_018609	GCT	2	6	1375484	1375489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407452065
27107	NC_018609	TAG	2	6	1375497	1375502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407452065
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27111	NC_018609	GAT	2	6	1375634	1375639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407452065
27112	NC_018609	AACTTG	2	12	1375686	1375697	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407452065
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