MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-1 chromosome

Total Repeats: 45672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14502	NC_018609	ACCA	2	8	733453	733460	50 %	0 %	0 %	50 %	407451470
14503	NC_018609	GCT	2	6	733491	733496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407451470
14504	NC_018609	TCT	2	6	733523	733528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407451470
14505	NC_018609	CCGTA	2	10	733543	733552	20 %	20 %	20 %	40 %	407451470
14506	NC_018609	AC	3	6	733558	733563	50 %	0 %	0 %	50 %	407451470
14507	NC_018609	TCA	2	6	733567	733572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451470
14508	NC_018609	AATC	2	8	733573	733580	50 %	25 %	0 %	25 %	407451470
14509	NC_018609	TCAT	2	8	733599	733606	25 %	50 %	0 %	25 %	407451470
14510	NC_018609	TTA	2	6	733636	733641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407451470
14511	NC_018609	TCT	2	6	733656	733661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407451470
14512	NC_018609	ATC	2	6	733671	733676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451470
14513	NC_018609	GAA	2	6	733749	733754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407451470
14514	NC_018609	ATTGT	2	10	733764	733773	20 %	60 %	20 %	0 %	407451470
14515	NC_018609	CCT	2	6	733905	733910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407451470
14516	NC_018609	ATA	2	6	733986	733991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407451470
14517	NC_018609	GCA	3	9	733992	734000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407451470
14518	NC_018609	CCT	2	6	734082	734087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407451470
14519	NC_018609	CTT	2	6	734188	734193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407451470
14520	NC_018609	TAGT	2	8	734215	734222	25 %	50 %	25 %	0 %	407451470
14521	NC_018609	TAG	2	6	734224	734229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407451470
14522	NC_018609	TCT	2	6	734256	734261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407451470
14523	NC_018609	GCT	2	6	734281	734286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407451470
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14526	NC_018609	TCT	2	6	734372	734377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407451470
14527	NC_018609	TCT	2	6	734515	734520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407451470
14528	NC_018609	TTTCT	2	10	734545	734554	0 %	80 %	0 %	20 %	407451470
14529	NC_018609	ATA	2	6	734558	734563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407451470
14530	NC_018609	TAA	2	6	734568	734573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407451470
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14533	NC_018609	CTT	2	6	734705	734710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407451470
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14537	NC_018609	TGTA	2	8	734851	734858	25 %	50 %	25 %	0 %	407451470
14538	NC_018609	TTA	2	6	734967	734972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407451470
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14540	NC_018609	TAAA	2	8	734989	734996	75 %	25 %	0 %	0 %	407451470
14541	NC_018609	CTG	2	6	735008	735013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407451470
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14543	NC_018609	TCT	2	6	735108	735113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407451470
14544	NC_018609	TAAAT	2	10	735129	735138	60 %	40 %	0 %	0 %	407451470
14545	NC_018609	GAG	2	6	735139	735144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407451470
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14547	NC_018609	GCT	2	6	735309	735314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407451470
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14552	NC_018609	GATTG	2	10	735459	735468	20 %	40 %	40 %	0 %	407451471
14553	NC_018609	TCT	2	6	735480	735485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407451471
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14555	NC_018609	ATT	3	9	735725	735733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407451471
14556	NC_018609	ATA	2	6	735747	735752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407451471
14557	NC_018609	ATT	2	6	735800	735805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407451471
14558	NC_018609	TCAT	2	8	735828	735835	25 %	50 %	0 %	25 %	407451471
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14570	NC_018609	T	6	6	736096	736101	0 %	100 %	0 %	0 %	407451472
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14575	NC_018609	CATCTA	2	12	736236	736247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451472
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14581	NC_018609	AAC	2	6	736521	736526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407451472
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14589	NC_018609	CTT	2	6	736861	736866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407451472
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14593	NC_018609	TGG	2	6	737047	737052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407451472
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14600	NC_018609	TAA	2	6	737698	737703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407451473
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14604	NC_018609	A	7	7	737933	737939	100 %	0 %	0 %	0 %	407451474
14605	NC_018609	TTGG	2	8	738037	738044	0 %	50 %	50 %	0 %	407451474
14606	NC_018609	GAT	2	6	738059	738064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407451474
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14609	NC_018609	T	6	6	738339	738344	0 %	100 %	0 %	0 %	407451475
14610	NC_018609	ACG	2	6	738345	738350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407451475
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14612	NC_018609	TTA	2	6	738543	738548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407451475
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14618	NC_018609	CT	3	6	738933	738938	0 %	50 %	0 %	50 %	407451476
14619	NC_018609	GA	3	6	738951	738956	50 %	0 %	50 %	0 %	407451476
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14992	NC_018609	ACT	2	6	758720	758725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451492
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