MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-1 chromosome

Total Repeats: 45672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_018609	TTA	2	6	663038	663043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407451399
13002	NC_018609	T	6	6	663046	663051	0 %	100 %	0 %	0 %	407451399
13003	NC_018609	ATAAAT	2	12	663062	663073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407451399
13004	NC_018609	TTA	2	6	663116	663121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407451399
13005	NC_018609	ATG	2	6	663142	663147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407451399
13006	NC_018609	TTAA	2	8	663170	663177	50 %	50 %	0 %	0 %	407451399
13007	NC_018609	AACC	2	8	663268	663275	50 %	0 %	0 %	50 %	407451399
13008	NC_018609	A	6	6	663323	663328	100 %	0 %	0 %	0 %	407451399
13009	NC_018609	AAT	2	6	663336	663341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407451399
13010	NC_018609	TGA	2	6	663348	663353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407451399
13011	NC_018609	T	9	9	663354	663362	0 %	100 %	0 %	0 %	407451399
13012	NC_018609	ATAA	2	8	663409	663416	75 %	25 %	0 %	0 %	407451399
13013	NC_018609	ATA	2	6	663419	663424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407451399
13014	NC_018609	CTA	2	6	663468	663473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451399
13015	NC_018609	ATC	2	6	663475	663480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451399
13016	NC_018609	CCA	2	6	663495	663500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407451399
13017	NC_018609	ATGC	2	8	663546	663553	25 %	25 %	25 %	25 %	407451399
13018	NC_018609	A	7	7	663590	663596	100 %	0 %	0 %	0 %	407451399
13019	NC_018609	AAC	2	6	663705	663710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407451400
13020	NC_018609	T	6	6	663723	663728	0 %	100 %	0 %	0 %	407451400
13021	NC_018609	CTG	2	6	663748	663753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407451400
13022	NC_018609	T	6	6	663766	663771	0 %	100 %	0 %	0 %	407451400
13023	NC_018609	CTT	2	6	663778	663783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407451400
13024	NC_018609	TCA	2	6	663801	663806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451400
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13026	NC_018609	ATTAA	2	10	663861	663870	60 %	40 %	0 %	0 %	407451400
13027	NC_018609	CTGTT	2	10	663929	663938	0 %	60 %	20 %	20 %	407451400
13028	NC_018609	T	6	6	664043	664048	0 %	100 %	0 %	0 %	407451400
13029	NC_018609	AT	3	6	664069	664074	50 %	50 %	0 %	0 %	407451400
13030	NC_018609	TGA	2	6	664075	664080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407451400
13031	NC_018609	TTC	2	6	664148	664153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407451400
13032	NC_018609	ATGA	2	8	664351	664358	50 %	25 %	25 %	0 %	407451400
13033	NC_018609	CA	3	6	664411	664416	50 %	0 %	0 %	50 %	407451400
13034	NC_018609	T	6	6	664450	664455	0 %	100 %	0 %	0 %	407451400
13035	NC_018609	AATA	2	8	664556	664563	75 %	25 %	0 %	0 %	407451400
13036	NC_018609	CTC	2	6	664827	664832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407451401
13037	NC_018609	A	6	6	664854	664859	100 %	0 %	0 %	0 %	407451401
13038	NC_018609	CAATC	2	10	664901	664910	40 %	20 %	0 %	40 %	407451401
13039	NC_018609	CTC	2	6	664929	664934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407451401
13040	NC_018609	CCT	2	6	665069	665074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407451401
13041	NC_018609	T	6	6	665113	665118	0 %	100 %	0 %	0 %	407451401
13042	NC_018609	TAAAA	2	10	665127	665136	80 %	20 %	0 %	0 %	407451401
13043	NC_018609	ATC	2	6	665214	665219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451401
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13052	NC_018609	CT	3	6	665510	665515	0 %	50 %	0 %	50 %	407451402
13053	NC_018609	GAA	2	6	665521	665526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407451402
13054	NC_018609	TAA	2	6	665553	665558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407451402
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13056	NC_018609	TAC	2	6	665595	665600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451402
13057	NC_018609	T	6	6	665613	665618	0 %	100 %	0 %	0 %	407451402
13058	NC_018609	ATT	2	6	665682	665687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407451403
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13060	NC_018609	TCA	2	6	665716	665721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451403
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13064	NC_018609	T	6	6	666071	666076	0 %	100 %	0 %	0 %	407451403
13065	NC_018609	TGA	2	6	666082	666087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407451403
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13069	NC_018609	TCTA	2	8	666452	666459	25 %	50 %	0 %	25 %	407451404
13070	NC_018609	TGA	2	6	666489	666494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407451404
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13072	NC_018609	CTTTT	2	10	666754	666763	0 %	80 %	0 %	20 %	407451404
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13091	NC_018609	TGTTT	2	10	667543	667552	0 %	80 %	20 %	0 %	407451404
13092	NC_018609	AAT	2	6	667559	667564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407451404
13093	NC_018609	CTT	2	6	667576	667581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407451404
13094	NC_018609	ATA	2	6	667653	667658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407451404
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13102	NC_018609	T	6	6	668066	668071	0 %	100 %	0 %	0 %	407451405
13103	NC_018609	TA	3	6	668121	668126	50 %	50 %	0 %	0 %	407451405
13104	NC_018609	CTTT	2	8	668161	668168	0 %	75 %	0 %	25 %	407451405
13105	NC_018609	AT	3	6	668206	668211	50 %	50 %	0 %	0 %	407451405
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13107	NC_018609	T	7	7	668239	668245	0 %	100 %	0 %	0 %	407451405
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13109	NC_018609	AT	3	6	668370	668375	50 %	50 %	0 %	0 %	407451405
13110	NC_018609	T	6	6	668375	668380	0 %	100 %	0 %	0 %	407451405
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13114	NC_018609	TAGGT	2	10	668550	668559	20 %	40 %	40 %	0 %	407451405
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13239	NC_018609	TA	3	6	675334	675339	50 %	50 %	0 %	0 %	407451412
13240	NC_018609	TCTT	2	8	675394	675401	0 %	75 %	0 %	25 %	407451412
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