MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-1 chromosome

Total Repeats: 45672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_018609	TTC	2	6	585898	585903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407451335
11502	NC_018609	TCT	2	6	586007	586012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407451335
11503	NC_018609	GGC	2	6	586020	586025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407451335
11504	NC_018609	CTA	2	6	586053	586058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451335
11505	NC_018609	TCC	2	6	586076	586081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407451335
11506	NC_018609	ACA	2	6	586085	586090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407451335
11507	NC_018609	TTC	2	6	586099	586104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407451335
11508	NC_018609	CTT	2	6	586227	586232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407451335
11509	NC_018609	CTT	2	6	586257	586262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407451335
11510	NC_018609	TCT	2	6	586295	586300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407451335
11511	NC_018609	T	6	6	586311	586316	0 %	100 %	0 %	0 %	407451335
11512	NC_018609	TCA	2	6	586331	586336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451335
11513	NC_018609	TGAT	2	8	586338	586345	25 %	50 %	25 %	0 %	407451335
11514	NC_018609	TCA	2	6	586364	586369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451335
11515	NC_018609	TCC	2	6	586391	586396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407451335
11516	NC_018609	CTT	2	6	586473	586478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407451335
11517	NC_018609	TCT	2	6	586482	586487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407451335
11518	NC_018609	CTT	2	6	586497	586502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407451335
11519	NC_018609	CTT	2	6	586521	586526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407451335
11520	NC_018609	TTC	2	6	586532	586537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407451335
11521	NC_018609	ATA	2	6	586560	586565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407451335
11522	NC_018609	TGA	2	6	586807	586812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407451336
11523	NC_018609	TC	3	6	586814	586819	0 %	50 %	0 %	50 %	407451336
11524	NC_018609	TAT	2	6	586870	586875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407451336
11525	NC_018609	TATTT	2	10	586922	586931	20 %	80 %	0 %	0 %	407451336
11526	NC_018609	TACCT	2	10	586935	586944	20 %	40 %	0 %	40 %	407451336
11527	NC_018609	GTTT	2	8	586960	586967	0 %	75 %	25 %	0 %	407451336
11528	NC_018609	GCT	2	6	586971	586976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407451336
11529	NC_018609	ACC	2	6	586985	586990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407451336
11530	NC_018609	TG	3	6	586992	586997	0 %	50 %	50 %	0 %	407451336
11531	NC_018609	TGGT	2	8	587017	587024	0 %	50 %	50 %	0 %	407451336
11532	NC_018609	ATC	2	6	587058	587063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451336
11533	NC_018609	TCT	2	6	587329	587334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407451337
11534	NC_018609	AGT	2	6	587345	587350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407451337
11535	NC_018609	CTG	2	6	587357	587362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407451337
11536	NC_018609	AAT	2	6	587383	587388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407451337
11537	NC_018609	A	6	6	587469	587474	100 %	0 %	0 %	0 %	407451337
11538	NC_018609	ATT	2	6	587498	587503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407451337
11539	NC_018609	T	6	6	587502	587507	0 %	100 %	0 %	0 %	407451337
11540	NC_018609	TTTC	2	8	587512	587519	0 %	75 %	0 %	25 %	407451337
11541	NC_018609	CAG	2	6	587606	587611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407451337
11542	NC_018609	TAC	3	9	587612	587620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451337
11543	NC_018609	ATA	3	9	587631	587639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407451337
11544	NC_018609	TCC	2	6	587648	587653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407451337
11545	NC_018609	A	6	6	587654	587659	100 %	0 %	0 %	0 %	407451337
11546	NC_018609	TC	3	6	587663	587668	0 %	50 %	0 %	50 %	407451337
11547	NC_018609	AAC	2	6	587726	587731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407451337
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11549	NC_018609	TAA	2	6	587885	587890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407451337
11550	NC_018609	AAT	2	6	587891	587896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407451337
11551	NC_018609	AAG	2	6	587899	587904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407451337
11552	NC_018609	TAA	2	6	587993	587998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407451337
11553	NC_018609	T	6	6	588019	588024	0 %	100 %	0 %	0 %	407451338
11554	NC_018609	TCT	2	6	588027	588032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407451338
11555	NC_018609	CGTT	2	8	588062	588069	0 %	50 %	25 %	25 %	407451338
11556	NC_018609	GA	3	6	588070	588075	50 %	0 %	50 %	0 %	407451338
11557	NC_018609	GCT	2	6	588090	588095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407451338
11558	NC_018609	ATT	2	6	588149	588154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407451338
11559	NC_018609	AAAGAT	2	12	588159	588170	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407451338
11560	NC_018609	CCTCTA	2	12	588184	588195	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	407451338
11561	NC_018609	CAT	2	6	588211	588216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451338
11562	NC_018609	TAC	2	6	588247	588252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451338
11563	NC_018609	T	6	6	588366	588371	0 %	100 %	0 %	0 %	407451338
11564	NC_018609	TC	5	10	588442	588451	0 %	50 %	0 %	50 %	407451338
11565	NC_018609	TTC	2	6	588486	588491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407451338
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11567	NC_018609	ATCT	2	8	588548	588555	25 %	50 %	0 %	25 %	407451338
11568	NC_018609	CT	3	6	588554	588559	0 %	50 %	0 %	50 %	407451338
11569	NC_018609	T	6	6	588559	588564	0 %	100 %	0 %	0 %	407451338
11570	NC_018609	CCA	2	6	588568	588573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407451338
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11572	NC_018609	TAAGTT	2	12	588658	588669	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407451338
11573	NC_018609	GTG	2	6	588748	588753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407451338
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11575	NC_018609	AAAT	2	8	588785	588792	75 %	25 %	0 %	0 %	407451338
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11579	NC_018609	TAT	2	6	589360	589365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407451339
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11581	NC_018609	TGA	2	6	589500	589505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407451339
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11584	NC_018609	TCT	2	6	589609	589614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407451339
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11587	NC_018609	CTA	2	6	589732	589737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451339
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11589	NC_018609	TAA	2	6	589786	589791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407451339
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11592	NC_018609	CAG	2	6	589991	589996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407451339
11593	NC_018609	GA	3	6	589999	590004	50 %	0 %	50 %	0 %	407451339
11594	NC_018609	T	6	6	590051	590056	0 %	100 %	0 %	0 %	407451339
11595	NC_018609	AGTAA	2	10	590100	590109	60 %	20 %	20 %	0 %	407451339
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11600	NC_018609	AAG	2	6	590354	590359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407451339
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11603	NC_018609	T	6	6	590486	590491	0 %	100 %	0 %	0 %	407451339
11604	NC_018609	CTT	2	6	590578	590583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407451339
11605	NC_018609	TCA	2	6	590610	590615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451339
11606	NC_018609	A	7	7	590676	590682	100 %	0 %	0 %	0 %	407451339
11607	NC_018609	CCTT	2	8	590697	590704	0 %	50 %	0 %	50 %	407451339
11608	NC_018609	GAC	2	6	590731	590736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407451339
11609	NC_018609	TA	3	6	590744	590749	50 %	50 %	0 %	0 %	407451339
11610	NC_018609	CCA	2	6	590945	590950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407451340
11611	NC_018609	GAAC	2	8	590965	590972	50 %	0 %	25 %	25 %	407451340
11612	NC_018609	ACC	2	6	590982	590987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407451340
11613	NC_018609	CTTA	2	8	591048	591055	25 %	50 %	0 %	25 %	407451340
11614	NC_018609	T	6	6	591071	591076	0 %	100 %	0 %	0 %	407451340
11615	NC_018609	ACT	2	6	591157	591162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451340
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11617	NC_018609	CAAA	2	8	591176	591183	75 %	0 %	0 %	25 %	407451340
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11620	NC_018609	TTG	2	6	591314	591319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407451340
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11987	NC_018609	CTA	2	6	610192	610197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451358
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