MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-1 chromosome

Total Repeats: 45672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_018609	TCA	2	6	252653	252658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451021
5002	NC_018609	A	7	7	252690	252696	100 %	0 %	0 %	0 %	407451021
5003	NC_018609	CTTT	2	8	252715	252722	0 %	75 %	0 %	25 %	407451021
5004	NC_018609	TAA	2	6	252740	252745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407451021
5005	NC_018609	T	6	6	252760	252765	0 %	100 %	0 %	0 %	407451021
5006	NC_018609	AT	3	6	252806	252811	50 %	50 %	0 %	0 %	407451021
5007	NC_018609	CTT	2	6	252812	252817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407451021
5008	NC_018609	TGTT	2	8	252868	252875	0 %	75 %	25 %	0 %	407451021
5009	NC_018609	GAGTA	2	10	252904	252913	40 %	20 %	40 %	0 %	407451021
5010	NC_018609	CCA	2	6	252917	252922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407451021
5011	NC_018609	CT	3	6	253796	253801	0 %	50 %	0 %	50 %	407451022
5012	NC_018609	TGT	2	6	253816	253821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407451022
5013	NC_018609	TTC	2	6	253877	253882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407451022
5014	NC_018609	TAC	2	6	253883	253888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451022
5015	NC_018609	TGC	2	6	254041	254046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407451022
5016	NC_018609	CTA	2	6	254152	254157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451022
5017	NC_018609	T	6	6	254170	254175	0 %	100 %	0 %	0 %	407451022
5018	NC_018609	AAT	2	6	254189	254194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407451022
5019	NC_018609	CT	3	6	254210	254215	0 %	50 %	0 %	50 %	407451022
5020	NC_018609	T	7	7	254215	254221	0 %	100 %	0 %	0 %	407451022
5021	NC_018609	CTA	2	6	254326	254331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451022
5022	NC_018609	TTC	2	6	254392	254397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407451023
5023	NC_018609	TCT	2	6	254405	254410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407451023
5024	NC_018609	CT	3	6	254442	254447	0 %	50 %	0 %	50 %	407451023
5025	NC_018609	A	6	6	254483	254488	100 %	0 %	0 %	0 %	407451023
5026	NC_018609	GTC	2	6	254554	254559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407451023
5027	NC_018609	GTG	2	6	254784	254789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407451024
5028	NC_018609	A	6	6	254806	254811	100 %	0 %	0 %	0 %	407451024
5029	NC_018609	TCG	2	6	254930	254935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407451024
5030	NC_018609	ACA	2	6	254940	254945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407451024
5031	NC_018609	A	6	6	254959	254964	100 %	0 %	0 %	0 %	407451024
5032	NC_018609	TTTTG	2	10	254979	254988	0 %	80 %	20 %	0 %	407451024
5033	NC_018609	GT	3	6	255012	255017	0 %	50 %	50 %	0 %	407451024
5034	NC_018609	AAT	2	6	255030	255035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407451024
5035	NC_018609	CAT	2	6	255088	255093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451024
5036	NC_018609	AGC	2	6	255154	255159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407451024
5037	NC_018609	TAA	2	6	255166	255171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407451024
5038	NC_018609	ATA	2	6	255217	255222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407451024
5039	NC_018609	GGC	2	6	255244	255249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407451024
5040	NC_018609	T	7	7	255269	255275	0 %	100 %	0 %	0 %	407451024
5041	NC_018609	CAG	2	6	255312	255317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407451024
5042	NC_018609	TGC	2	6	255362	255367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407451024
5043	NC_018609	T	6	6	255418	255423	0 %	100 %	0 %	0 %	407451024
5044	NC_018609	CTT	2	6	255429	255434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407451024
5045	NC_018609	TCT	2	6	255463	255468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407451024
5046	NC_018609	TCA	2	6	255482	255487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451024
5047	NC_018609	CTT	2	6	255517	255522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407451024
5048	NC_018609	TGA	2	6	255557	255562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407451024
5049	NC_018609	TCA	2	6	255681	255686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451024
5050	NC_018609	TGG	2	6	255882	255887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407451025
5051	NC_018609	AGT	2	6	255913	255918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407451025
5052	NC_018609	CTA	3	9	255953	255961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451025
5053	NC_018609	ACA	2	6	255976	255981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407451025
5054	NC_018609	CGTG	2	8	255998	256005	0 %	25 %	50 %	25 %	407451025
5055	NC_018609	AGA	2	6	256015	256020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407451025
5056	NC_018609	A	6	6	256025	256030	100 %	0 %	0 %	0 %	407451025
5057	NC_018609	TAA	2	6	256039	256044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407451025
5058	NC_018609	GAG	2	6	256082	256087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407451025
5059	NC_018609	CTA	2	6	256180	256185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451025
5060	NC_018609	CTC	2	6	256205	256210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407451025
5061	NC_018609	GT	3	6	256211	256216	0 %	50 %	50 %	0 %	407451025
5062	NC_018609	CAA	2	6	256225	256230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407451025
5063	NC_018609	TGG	2	6	256273	256278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407451025
5064	NC_018609	ACC	2	6	256323	256328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407451025
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5067	NC_018609	CTAC	2	8	256425	256432	25 %	25 %	0 %	50 %	407451025
5068	NC_018609	A	6	6	256443	256448	100 %	0 %	0 %	0 %	407451025
5069	NC_018609	AGAA	2	8	256452	256459	75 %	0 %	25 %	0 %	407451025
5070	NC_018609	AGA	2	6	256477	256482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407451025
5071	NC_018609	AGC	2	6	256534	256539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407451025
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5080	NC_018609	AGG	2	6	257082	257087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407451026
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5082	NC_018609	TGG	2	6	257166	257171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407451026
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5090	NC_018609	TGA	2	6	257670	257675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407451026
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5093	NC_018609	TTTTA	2	10	257877	257886	20 %	80 %	0 %	0 %	407451026
5094	NC_018609	A	7	7	257926	257932	100 %	0 %	0 %	0 %	407451026
5095	NC_018609	ATT	2	6	258171	258176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407451027
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5098	NC_018609	ACTT	2	8	258284	258291	25 %	50 %	0 %	25 %	407451027
5099	NC_018609	T	7	7	258290	258296	0 %	100 %	0 %	0 %	407451027
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5102	NC_018609	ATT	2	6	258455	258460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407451027
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5104	NC_018609	TA	3	6	258580	258585	50 %	50 %	0 %	0 %	407451027
5105	NC_018609	TTTA	2	8	258587	258594	25 %	75 %	0 %	0 %	407451027
5106	NC_018609	TAT	2	6	258622	258627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407451027
5107	NC_018609	TA	3	6	258644	258649	50 %	50 %	0 %	0 %	407451027
5108	NC_018609	T	6	6	258657	258662	0 %	100 %	0 %	0 %	407451027
5109	NC_018609	ATC	3	9	258689	258697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451027
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5111	NC_018609	T	6	6	258706	258711	0 %	100 %	0 %	0 %	407451027
5112	NC_018609	T	6	6	258748	258753	0 %	100 %	0 %	0 %	407451027
5113	NC_018609	TAT	2	6	259152	259157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407451028
5114	NC_018609	GAAA	2	8	259186	259193	75 %	0 %	25 %	0 %	407451028
5115	NC_018609	AGT	2	6	259259	259264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407451028
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5119	NC_018609	A	6	6	259458	259463	100 %	0 %	0 %	0 %	407451028
5120	NC_018609	TAA	2	6	259499	259504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407451028
5121	NC_018609	CAT	2	6	259524	259529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451028
5122	NC_018609	TGT	2	6	259530	259535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407451028
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5495	NC_018609	GGCTAT	2	12	280008	280019	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407451046
5496	NC_018609	GTA	3	9	280027	280035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407451046
5497	NC_018609	TCT	2	6	280058	280063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407451046
5498	NC_018609	ACT	3	9	280064	280072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451046
5499	NC_018609	TTC	2	6	280165	280170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407451046
5500	NC_018609	G	6	6	280188	280193	0 %	0 %	100 %	0 %	407451046

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