MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodospirillum rubrum F11 chromosome

Total Repeats: 99397

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_017584	G	6	6	629898	629903	0 %	0 %	100 %	0 %	386348567
14002	NC_017584	CGC	3	9	630071	630079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348568
14003	NC_017584	GCG	2	6	630080	630085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348568
14004	NC_017584	GCGG	2	8	630089	630096	0 %	0 %	75 %	25 %	386348568
14005	NC_017584	GGCG	2	8	630100	630107	0 %	0 %	75 %	25 %	386348568
14006	NC_017584	CCA	2	6	630202	630207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348568
14007	NC_017584	GCC	2	6	630231	630236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348568
14008	NC_017584	GA	3	6	630264	630269	50 %	0 %	50 %	0 %	386348568
14009	NC_017584	GC	3	6	630329	630334	0 %	0 %	50 %	50 %	386348568
14010	NC_017584	CG	3	6	630361	630366	0 %	0 %	50 %	50 %	386348568
14011	NC_017584	GC	3	6	630450	630455	0 %	0 %	50 %	50 %	386348568
14012	NC_017584	GCC	2	6	630491	630496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348568
14013	NC_017584	GCC	2	6	630596	630601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348568
14014	NC_017584	CCG	2	6	630613	630618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348568
14015	NC_017584	GGC	2	6	630647	630652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348568
14016	NC_017584	AGA	2	6	630673	630678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386348568
14017	NC_017584	CGC	2	6	630812	630817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348568
14018	NC_017584	ACG	2	6	630933	630938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348568
14019	NC_017584	TGG	2	6	630961	630966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348568
14020	NC_017584	GAC	2	6	631130	631135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348569
14021	NC_017584	GC	3	6	631187	631192	0 %	0 %	50 %	50 %	386348569
14022	NC_017584	GCC	3	9	631208	631216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348569
14023	NC_017584	CGA	2	6	631228	631233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348569
14024	NC_017584	ACC	2	6	631263	631268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348569
14025	NC_017584	CGC	2	6	631307	631312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348569
14026	NC_017584	GGCG	2	8	631315	631322	0 %	0 %	75 %	25 %	386348569
14027	NC_017584	CCG	2	6	631374	631379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348569
14028	NC_017584	GGTC	2	8	631395	631402	0 %	25 %	50 %	25 %	386348569
14029	NC_017584	CGGTC	2	10	631405	631414	0 %	20 %	40 %	40 %	386348569
14030	NC_017584	CG	3	6	631437	631442	0 %	0 %	50 %	50 %	386348569
14031	NC_017584	GGT	2	6	631459	631464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348569
14032	NC_017584	CCCG	2	8	631484	631491	0 %	0 %	25 %	75 %	386348569
14033	NC_017584	CGGG	2	8	631609	631616	0 %	0 %	75 %	25 %	386348569
14034	NC_017584	GGC	2	6	631633	631638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348569
14035	NC_017584	GGGC	2	8	631678	631685	0 %	0 %	75 %	25 %	386348569
14036	NC_017584	CGCC	2	8	631702	631709	0 %	0 %	25 %	75 %	386348569
14037	NC_017584	GC	3	6	631711	631716	0 %	0 %	50 %	50 %	386348569
14038	NC_017584	CGA	2	6	631753	631758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348569
14039	NC_017584	GCC	2	6	631825	631830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348569
14040	NC_017584	CGG	2	6	631850	631855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348569
14041	NC_017584	GC	3	6	631861	631866	0 %	0 %	50 %	50 %	386348569
14042	NC_017584	GC	3	6	631879	631884	0 %	0 %	50 %	50 %	386348569
14043	NC_017584	GCCT	2	8	631890	631897	0 %	25 %	25 %	50 %	386348569
14044	NC_017584	GCCA	2	8	631928	631935	25 %	0 %	25 %	50 %	386348569
14045	NC_017584	CCGC	2	8	631947	631954	0 %	0 %	25 %	75 %	386348569
14046	NC_017584	GGT	2	6	632003	632008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348569
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14048	NC_017584	TGCTC	2	10	632330	632339	0 %	40 %	20 %	40 %	386348570
14049	NC_017584	TCA	2	6	632371	632376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348570
14050	NC_017584	GCC	2	6	632393	632398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348570
14051	NC_017584	GCG	2	6	632413	632418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348570
14052	NC_017584	CAGG	2	8	632449	632456	25 %	0 %	50 %	25 %	386348570
14053	NC_017584	CTG	2	6	632478	632483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348570
14054	NC_017584	CTG	2	6	632520	632525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348570
14055	NC_017584	GAA	2	6	632532	632537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386348570
14056	NC_017584	TCG	2	6	632557	632562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348570
14057	NC_017584	CG	3	6	632644	632649	0 %	0 %	50 %	50 %	386348570
14058	NC_017584	CGG	2	6	632652	632657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348570
14059	NC_017584	GAT	2	6	632670	632675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348570
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14061	NC_017584	CGA	2	6	632755	632760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348570
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14063	NC_017584	CG	3	6	632838	632843	0 %	0 %	50 %	50 %	386348570
14064	NC_017584	GCT	2	6	632858	632863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348570
14065	NC_017584	GCG	2	6	632905	632910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348570
14066	NC_017584	CGG	2	6	632920	632925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348570
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14069	NC_017584	CGC	2	6	633044	633049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348570
14070	NC_017584	GTC	2	6	633057	633062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348570
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14072	NC_017584	GAT	2	6	633098	633103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348570
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14081	NC_017584	TGAT	2	8	633437	633444	25 %	50 %	25 %	0 %	386348571
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14086	NC_017584	TGA	2	6	633702	633707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348571
14087	NC_017584	GGC	2	6	633759	633764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348571
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14089	NC_017584	AAG	2	6	633788	633793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386348571
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14091	NC_017584	GATTTT	2	12	633871	633882	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386348571
14092	NC_017584	T	7	7	633879	633885	0 %	100 %	0 %	0 %	386348571
14093	NC_017584	TCA	2	6	634122	634127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348572
14094	NC_017584	GAT	2	6	634153	634158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348572
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14097	NC_017584	CGA	2	6	634248	634253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348572
14098	NC_017584	GGCG	2	8	634401	634408	0 %	0 %	75 %	25 %	386348572
14099	NC_017584	ATC	2	6	634433	634438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348572
14100	NC_017584	ATG	2	6	634439	634444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348572
14101	NC_017584	CAG	2	6	634519	634524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348572
14102	NC_017584	TGGG	2	8	634562	634569	0 %	25 %	75 %	0 %	386348572
14103	NC_017584	TCG	2	6	634610	634615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348572
14104	NC_017584	AGC	2	6	634616	634621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348572
14105	NC_017584	CAC	2	6	634666	634671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348572
14106	NC_017584	GTG	2	6	634685	634690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348572
14107	NC_017584	ACC	2	6	634709	634714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348572
14108	NC_017584	CGG	2	6	634764	634769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348572
14109	NC_017584	TCG	2	6	634817	634822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348572
14110	NC_017584	CG	3	6	634824	634829	0 %	0 %	50 %	50 %	386348572
14111	NC_017584	CCT	2	6	634881	634886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386348572
14112	NC_017584	GGC	2	6	634909	634914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348572
14113	NC_017584	TGT	2	6	634923	634928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386348572
14114	NC_017584	CGG	2	6	634942	634947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348572
14115	NC_017584	GGTC	2	8	634998	635005	0 %	25 %	50 %	25 %	386348572
14116	NC_017584	CAG	2	6	635038	635043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348572
14117	NC_017584	CTC	2	6	635098	635103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386348572
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14120	NC_017584	AGC	2	6	635216	635221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348572
14121	NC_017584	AGGGC	2	10	635226	635235	20 %	0 %	60 %	20 %	386348572
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14123	NC_017584	GTC	2	6	635339	635344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348572
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14125	NC_017584	CGG	2	6	635370	635375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348572
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14472	NC_017584	GCG	2	6	650390	650395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348583
14473	NC_017584	CGG	2	6	650478	650483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348583
14474	NC_017584	AGGGC	2	10	650493	650502	20 %	0 %	60 %	20 %	386348583
14475	NC_017584	TCG	2	6	650561	650566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348583
14476	NC_017584	CTT	2	6	650604	650609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386348583
14477	NC_017584	GGCC	2	8	650631	650638	0 %	0 %	50 %	50 %	386348583
14478	NC_017584	CGC	2	6	650653	650658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348583
14479	NC_017584	CCA	2	6	650679	650684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348583
14480	NC_017584	GCG	2	6	650711	650716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348583
14481	NC_017584	CGGC	2	8	650717	650724	0 %	0 %	50 %	50 %	386348583
14482	NC_017584	GCA	3	9	650730	650738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348583
14483	NC_017584	GGC	2	6	650745	650750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348583
14484	NC_017584	TCG	2	6	650765	650770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348583
14485	NC_017584	CGT	2	6	650787	650792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348583
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14487	NC_017584	CGG	2	6	650862	650867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348583
14488	NC_017584	CGG	2	6	650883	650888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348583
14489	NC_017584	GC	3	6	650911	650916	0 %	0 %	50 %	50 %	386348583
14490	NC_017584	GCCA	2	8	650942	650949	25 %	0 %	25 %	50 %	386348583
14491	NC_017584	CCG	2	6	650976	650981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348583
14492	NC_017584	GCC	2	6	650999	651004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348583
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14498	NC_017584	GCC	2	6	651400	651405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348584
14499	NC_017584	G	6	6	651413	651418	0 %	0 %	100 %	0 %	386348584
14500	NC_017584	CTG	2	6	651481	651486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348584

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