MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodospirillum rubrum F11 chromosome

Total Repeats: 99397

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_017584	ACC	2	6	583275	583280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348529
13002	NC_017584	GCG	2	6	583284	583289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348529
13003	NC_017584	T	6	6	583443	583448	0 %	100 %	0 %	0 %	386348530
13004	NC_017584	CGG	2	6	583455	583460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348530
13005	NC_017584	CGC	2	6	583488	583493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348530
13006	NC_017584	ATC	2	6	583513	583518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348530
13007	NC_017584	GCG	2	6	583525	583530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348530
13008	NC_017584	GCA	2	6	583685	583690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348530
13009	NC_017584	GCC	2	6	583723	583728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348530
13010	NC_017584	TGC	2	6	583751	583756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348530
13011	NC_017584	AGGGC	2	10	583787	583796	20 %	0 %	60 %	20 %	386348530
13012	NC_017584	AGGCGA	2	12	583808	583819	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386348530
13013	NC_017584	CGA	2	6	583863	583868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348530
13014	NC_017584	TGT	2	6	583871	583876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386348530
13015	NC_017584	GACGAT	2	12	583896	583907	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386348530
13016	NC_017584	TGA	2	6	583934	583939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348530
13017	NC_017584	CGA	2	6	583943	583948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348530
13018	NC_017584	GGCA	2	8	583993	584000	25 %	0 %	50 %	25 %	386348530
13019	NC_017584	CGACGC	2	12	584006	584017	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386348530
13020	NC_017584	GCC	2	6	584023	584028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348530
13021	NC_017584	TCG	2	6	584074	584079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348530
13022	NC_017584	C	6	6	584111	584116	0 %	0 %	0 %	100 %	386348530
13023	NC_017584	GCG	2	6	584216	584221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348531
13024	NC_017584	TCGCC	2	10	584232	584241	0 %	20 %	20 %	60 %	386348531
13025	NC_017584	TGA	2	6	584278	584283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348531
13026	NC_017584	CAGGGC	2	12	584294	584305	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386348531
13027	NC_017584	CGC	2	6	584335	584340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348531
13028	NC_017584	GCC	2	6	584485	584490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348531
13029	NC_017584	CGC	3	9	584519	584527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348531
13030	NC_017584	TGA	2	6	584566	584571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348531
13031	NC_017584	CAG	2	6	584630	584635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348531
13032	NC_017584	CGG	2	6	584815	584820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348531
13033	NC_017584	CGC	2	6	584848	584853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348531
13034	NC_017584	GGC	2	6	584864	584869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348531
13035	NC_017584	GGC	2	6	584894	584899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348531
13036	NC_017584	GCC	2	6	584945	584950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348531
13037	NC_017584	CAA	2	6	584996	585001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386348531
13038	NC_017584	GGC	2	6	585008	585013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348531
13039	NC_017584	GAA	2	6	585020	585025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386348531
13040	NC_017584	TGG	2	6	585064	585069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348531
13041	NC_017584	ATT	2	6	585193	585198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386348532
13042	NC_017584	CGA	2	6	585211	585216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348532
13043	NC_017584	TCG	2	6	585261	585266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348532
13044	NC_017584	AGGCCG	2	12	585292	585303	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386348532
13045	NC_017584	AGA	2	6	585318	585323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386348532
13046	NC_017584	CGG	2	6	585325	585330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348532
13047	NC_017584	CAGC	2	8	585386	585393	25 %	0 %	25 %	50 %	386348532
13048	NC_017584	TCG	2	6	585405	585410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348532
13049	NC_017584	TCCA	2	8	585423	585430	25 %	25 %	0 %	50 %	386348532
13050	NC_017584	GGC	2	6	585437	585442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348532
13051	NC_017584	TGGGG	2	10	585445	585454	0 %	20 %	80 %	0 %	386348532
13052	NC_017584	G	6	6	585451	585456	0 %	0 %	100 %	0 %	386348532
13053	NC_017584	CGC	2	6	585496	585501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348532
13054	NC_017584	CAC	2	6	585512	585517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348532
13055	NC_017584	GAT	2	6	585581	585586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348532
13056	NC_017584	GGC	2	6	585611	585616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348532
13057	NC_017584	GCG	2	6	585657	585662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348532
13058	NC_017584	CGG	2	6	585682	585687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348532
13059	NC_017584	CGC	3	9	585700	585708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348532
13060	NC_017584	CGG	2	6	585721	585726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348532
13061	NC_017584	GTCG	2	8	585818	585825	0 %	25 %	50 %	25 %	386348532
13062	NC_017584	GTA	2	6	585872	585877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348532
13063	NC_017584	GCC	2	6	585972	585977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348532
13064	NC_017584	TTG	2	6	586035	586040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386348532
13065	NC_017584	TCG	2	6	586059	586064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348532
13066	NC_017584	GC	3	6	586132	586137	0 %	0 %	50 %	50 %	386348532
13067	NC_017584	CCTT	2	8	586182	586189	0 %	50 %	0 %	50 %	386348532
13068	NC_017584	GGC	3	9	586193	586201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348532
13069	NC_017584	GGC	2	6	586229	586234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348532
13070	NC_017584	CGC	2	6	586241	586246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348532
13071	NC_017584	GCA	2	6	586276	586281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348532
13072	NC_017584	AGG	2	6	586861	586866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386348533
13073	NC_017584	CGC	2	6	586902	586907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348533
13074	NC_017584	CGA	2	6	586940	586945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348533
13075	NC_017584	CG	3	6	587048	587053	0 %	0 %	50 %	50 %	386348533
13076	NC_017584	GCC	2	6	587071	587076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348533
13077	NC_017584	TCG	2	6	587371	587376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348534
13078	NC_017584	CGA	2	6	587390	587395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348534
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13083	NC_017584	CGT	2	6	587688	587693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348534
13084	NC_017584	TCG	2	6	587734	587739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348534
13085	NC_017584	CGA	2	6	587750	587755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348534
13086	NC_017584	GCT	2	6	587772	587777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348534
13087	NC_017584	GT	3	6	587790	587795	0 %	50 %	50 %	0 %	386348534
13088	NC_017584	GC	3	6	587874	587879	0 %	0 %	50 %	50 %	386348534
13089	NC_017584	AAC	2	6	587901	587906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386348534
13090	NC_017584	CCA	2	6	587969	587974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348534
13091	NC_017584	AGC	2	6	588084	588089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348534
13092	NC_017584	GGC	2	6	588181	588186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348534
13093	NC_017584	GAC	2	6	588261	588266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348534
13094	NC_017584	TGA	2	6	588304	588309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348534
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13098	NC_017584	CGCAG	2	10	588578	588587	20 %	0 %	40 %	40 %	386348534
13099	NC_017584	TCT	2	6	588671	588676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386348534
13100	NC_017584	CCG	2	6	588761	588766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348534
13101	NC_017584	ATC	2	6	588831	588836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348534
13102	NC_017584	CTG	2	6	588876	588881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348534
13103	NC_017584	TCA	2	6	588932	588937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348534
13104	NC_017584	ATG	2	6	588939	588944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348534
13105	NC_017584	GCC	2	6	588970	588975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348534
13106	NC_017584	CGATC	2	10	589175	589184	20 %	20 %	20 %	40 %	386348534
13107	NC_017584	ACTTCC	2	12	589193	589204	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	386348534
13108	NC_017584	CGC	2	6	589257	589262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348534
13109	NC_017584	CAC	2	6	589296	589301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348534
13110	NC_017584	CTT	2	6	589425	589430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386348534
13111	NC_017584	GCTC	2	8	589495	589502	0 %	25 %	25 %	50 %	386348534
13112	NC_017584	TGC	2	6	589553	589558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348534
13113	NC_017584	TCG	2	6	589619	589624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348534
13114	NC_017584	ATC	2	6	589629	589634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348534
13115	NC_017584	GC	3	6	589690	589695	0 %	0 %	50 %	50 %	386348534
13116	NC_017584	TTC	2	6	589951	589956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386348534
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13118	NC_017584	GCC	2	6	590173	590178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348534
13119	NC_017584	CTT	2	6	590210	590215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386348534
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13227	NC_017584	GATC	2	8	595956	595963	25 %	25 %	25 %	25 %	386348537
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13229	NC_017584	CCGCCT	2	12	596042	596053	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386348537
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13234	NC_017584	TAT	3	9	596182	596190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386348537
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13236	NC_017584	CACCGG	2	12	596226	596237	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386348537
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13353	NC_017584	CGA	2	6	601384	601389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348539
13354	NC_017584	GCG	2	6	601400	601405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348539
13355	NC_017584	TGGGG	2	10	601417	601426	0 %	20 %	80 %	0 %	386348539
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13463	NC_017584	GCC	2	6	607903	607908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348545
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13474	NC_017584	CGC	2	6	608542	608547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348547
13475	NC_017584	CCGCGC	2	12	608565	608576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348547
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13477	NC_017584	GGC	2	6	608648	608653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348547
13478	NC_017584	CG	3	6	608674	608679	0 %	0 %	50 %	50 %	386348547
13479	NC_017584	ACC	2	6	608712	608717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348547
13480	NC_017584	GCC	2	6	608724	608729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348547
13481	NC_017584	GC	3	6	608816	608821	0 %	0 %	50 %	50 %	386348547
13482	NC_017584	CTG	2	6	608847	608852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348547
13483	NC_017584	CGCCCG	2	12	608855	608866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348547
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13492	NC_017584	GGC	2	6	609153	609158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348547
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