MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodospirillum rubrum F11 chromosome

Total Repeats: 99397

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_017584	GCG	2	6	561153	561158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348510
12502	NC_017584	GTC	2	6	561162	561167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348510
12503	NC_017584	GAT	2	6	561219	561224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348510
12504	NC_017584	TGA	2	6	561239	561244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348510
12505	NC_017584	TGGCG	2	10	561278	561287	0 %	20 %	60 %	20 %	386348510
12506	NC_017584	GGGC	2	8	561377	561384	0 %	0 %	75 %	25 %	386348510
12507	NC_017584	CGG	2	6	561436	561441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348510
12508	NC_017584	GTC	2	6	561454	561459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348510
12509	NC_017584	GC	3	6	561487	561492	0 %	0 %	50 %	50 %	386348510
12510	NC_017584	GCG	2	6	561511	561516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348510
12511	NC_017584	TCA	2	6	561530	561535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348510
12512	NC_017584	TGG	2	6	561620	561625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348510
12513	NC_017584	CGC	2	6	561644	561649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348510
12514	NC_017584	CCA	2	6	561704	561709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348510
12515	NC_017584	CTG	2	6	561756	561761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348510
12516	NC_017584	ATC	2	6	561828	561833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348510
12517	NC_017584	C	6	6	561946	561951	0 %	0 %	0 %	100 %	386348510
12518	NC_017584	GATC	2	8	561968	561975	25 %	25 %	25 %	25 %	386348510
12519	NC_017584	GCC	2	6	561976	561981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348510
12520	NC_017584	CGG	2	6	561982	561987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348510
12521	NC_017584	AAG	2	6	562056	562061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386348510
12522	NC_017584	CGTT	2	8	562214	562221	0 %	50 %	25 %	25 %	386348511
12523	NC_017584	GCG	2	6	562233	562238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348511
12524	NC_017584	AGC	2	6	562281	562286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348511
12525	NC_017584	CG	3	6	562353	562358	0 %	0 %	50 %	50 %	386348511
12526	NC_017584	CAT	2	6	562375	562380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348511
12527	NC_017584	CGA	2	6	562428	562433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348511
12528	NC_017584	CTC	2	6	562441	562446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386348511
12529	NC_017584	GCC	3	9	562507	562515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348511
12530	NC_017584	CGG	2	6	562554	562559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348511
12531	NC_017584	CGG	2	6	562578	562583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348511
12532	NC_017584	TCG	2	6	562685	562690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348511
12533	NC_017584	GAGC	2	8	562702	562709	25 %	0 %	50 %	25 %	386348511
12534	NC_017584	GCG	2	6	562732	562737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348511
12535	NC_017584	GCC	2	6	562738	562743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348511
12536	NC_017584	ATG	2	6	562820	562825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348511
12537	NC_017584	ATT	2	6	562840	562845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386348511
12538	NC_017584	TCG	2	6	562910	562915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348511
12539	NC_017584	GGCC	2	8	562974	562981	0 %	0 %	50 %	50 %	386348511
12540	NC_017584	GAT	2	6	563065	563070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348511
12541	NC_017584	GGCC	2	8	563133	563140	0 %	0 %	50 %	50 %	386348511
12542	NC_017584	CTT	2	6	563188	563193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386348511
12543	NC_017584	GGTG	2	8	563232	563239	0 %	25 %	75 %	0 %	386348511
12544	NC_017584	GC	3	6	563264	563269	0 %	0 %	50 %	50 %	386348511
12545	NC_017584	GCT	2	6	563280	563285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348511
12546	NC_017584	CCG	2	6	563318	563323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348511
12547	NC_017584	TTG	2	6	563420	563425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386348511
12548	NC_017584	GC	3	6	563487	563492	0 %	0 %	50 %	50 %	386348511
12549	NC_017584	AGC	2	6	563534	563539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348511
12550	NC_017584	GGA	2	6	563565	563570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386348511
12551	NC_017584	GCG	2	6	563654	563659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348511
12552	NC_017584	CAG	2	6	563763	563768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348512
12553	NC_017584	CCTT	2	8	563835	563842	0 %	50 %	0 %	50 %	386348512
12554	NC_017584	TGA	2	6	563875	563880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348512
12555	NC_017584	GGCC	2	8	563924	563931	0 %	0 %	50 %	50 %	386348512
12556	NC_017584	GCG	2	6	564087	564092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348513
12557	NC_017584	TTA	2	6	564294	564299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386348513
12558	NC_017584	CGGC	2	8	564324	564331	0 %	0 %	50 %	50 %	386348513
12559	NC_017584	GGC	2	6	564338	564343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348513
12560	NC_017584	CCG	2	6	564408	564413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348513
12561	NC_017584	GCC	3	9	564455	564463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348513
12562	NC_017584	GGTTG	2	10	564498	564507	0 %	40 %	60 %	0 %	386348513
12563	NC_017584	GCC	2	6	564515	564520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348513
12564	NC_017584	CAG	2	6	564569	564574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348513
12565	NC_017584	GTT	2	6	564580	564585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386348513
12566	NC_017584	CGA	2	6	564589	564594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348513
12567	NC_017584	CAG	2	6	564680	564685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348513
12568	NC_017584	GCC	2	6	564713	564718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348513
12569	NC_017584	AAT	2	6	564775	564780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386348513
12570	NC_017584	GCC	2	6	564816	564821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348513
12571	NC_017584	GAG	2	6	564861	564866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386348513
12572	NC_017584	G	6	6	564886	564891	0 %	0 %	100 %	0 %	386348513
12573	NC_017584	TTTGG	2	10	564926	564935	0 %	60 %	40 %	0 %	386348513
12574	NC_017584	CGGC	2	8	564943	564950	0 %	0 %	50 %	50 %	386348513
12575	NC_017584	AGC	2	6	565051	565056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348513
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12577	NC_017584	CGT	2	6	565130	565135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348513
12578	NC_017584	CGC	2	6	565162	565167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348513
12579	NC_017584	CGGC	3	12	565286	565297	0 %	0 %	50 %	50 %	386348513
12580	NC_017584	GC	3	6	565296	565301	0 %	0 %	50 %	50 %	386348513
12581	NC_017584	GTC	2	6	565320	565325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348513
12582	NC_017584	GCG	2	6	565353	565358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348513
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12584	NC_017584	GAAC	2	8	565441	565448	50 %	0 %	25 %	25 %	386348513
12585	NC_017584	GAT	2	6	565486	565491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348513
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12587	NC_017584	GCG	2	6	565567	565572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348513
12588	NC_017584	GCG	2	6	565639	565644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348513
12589	NC_017584	CGG	2	6	565688	565693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348513
12590	NC_017584	C	6	6	565725	565730	0 %	0 %	0 %	100 %	386348513
12591	NC_017584	GGCT	2	8	565767	565774	0 %	25 %	50 %	25 %	386348513
12592	NC_017584	GCC	3	9	565844	565852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348513
12593	NC_017584	GGCG	2	8	565884	565891	0 %	0 %	75 %	25 %	386348513
12594	NC_017584	GTGAT	2	10	565917	565926	20 %	40 %	40 %	0 %	386348513
12595	NC_017584	GCC	2	6	566418	566423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348514
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12597	NC_017584	GCG	2	6	566507	566512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348514
12598	NC_017584	GCG	3	9	566542	566550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348514
12599	NC_017584	GCC	2	6	566643	566648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348514
12600	NC_017584	CGG	2	6	566655	566660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348514
12601	NC_017584	GAG	2	6	566724	566729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386348514
12602	NC_017584	G	7	7	567230	567236	0 %	0 %	100 %	0 %	386348515
12603	NC_017584	GGC	2	6	567244	567249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348515
12604	NC_017584	CGG	2	6	567318	567323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348515
12605	NC_017584	ATG	2	6	567359	567364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348515
12606	NC_017584	GCG	2	6	567499	567504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348516
12607	NC_017584	GGC	2	6	567524	567529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348516
12608	NC_017584	GC	4	8	567574	567581	0 %	0 %	50 %	50 %	386348516
12609	NC_017584	AAC	2	6	567585	567590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386348516
12610	NC_017584	ACC	2	6	567597	567602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348516
12611	NC_017584	CAG	2	6	567623	567628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348516
12612	NC_017584	ACC	2	6	567645	567650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348516
12613	NC_017584	GGC	2	6	567653	567658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348516
12614	NC_017584	TGAT	2	8	567672	567679	25 %	50 %	25 %	0 %	386348516
12615	NC_017584	GCC	2	6	567722	567727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348516
12616	NC_017584	CGAGG	2	10	567758	567767	20 %	0 %	60 %	20 %	386348516
12617	NC_017584	CAC	2	6	567779	567784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348516
12618	NC_017584	GAT	2	6	567824	567829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348516
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12979	NC_017584	CAT	2	6	582295	582300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348529
12980	NC_017584	GCG	2	6	582340	582345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348529
12981	NC_017584	ACC	2	6	582438	582443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348529
12982	NC_017584	TTG	2	6	582456	582461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386348529
12983	NC_017584	CCG	2	6	582529	582534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348529
12984	NC_017584	CGCC	2	8	582535	582542	0 %	0 %	25 %	75 %	386348529
12985	NC_017584	CG	3	6	582547	582552	0 %	0 %	50 %	50 %	386348529
12986	NC_017584	TCG	2	6	582553	582558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348529
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12991	NC_017584	ACC	3	9	582714	582722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348529
12992	NC_017584	CCT	3	9	582742	582750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386348529
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