MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Riemerella anatipestifer RA-GD chromosome

Total Repeats: 41163

< Previous12...71727374757677787980818283Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41001	NC_017569	GTTG	2	8	2159509	2159516	0 %	50 %	50 %	0 %	386322364
41002	NC_017569	TAATA	2	10	2159534	2159543	60 %	40 %	0 %	0 %	386322364
41003	NC_017569	ATC	2	6	2159666	2159671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322365
41004	NC_017569	CTTT	2	8	2159719	2159726	0 %	75 %	0 %	25 %	386322365
41005	NC_017569	TAG	2	6	2159806	2159811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322365
41006	NC_017569	CTT	2	6	2159947	2159952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322365
41007	NC_017569	ATT	2	6	2159987	2159992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386322365
41008	NC_017569	CAA	2	6	2159996	2160001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386322365
41009	NC_017569	AGA	2	6	2160088	2160093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322365
41010	NC_017569	TCA	2	6	2160114	2160119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322365
41011	NC_017569	TCC	2	6	2160215	2160220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386322365
41012	NC_017569	CTT	2	6	2160251	2160256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322365
41013	NC_017569	CTC	2	6	2160338	2160343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386322365
41014	NC_017569	TTC	2	6	2160376	2160381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322365
41015	NC_017569	ATC	2	6	2160392	2160397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322365
41016	NC_017569	TCA	2	6	2160414	2160419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322365
41017	NC_017569	ATTTTT	2	12	2160485	2160496	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386322365
41018	NC_017569	T	6	6	2160572	2160577	0 %	100 %	0 %	0 %	386322365
41019	NC_017569	T	6	6	2160644	2160649	0 %	100 %	0 %	0 %	386322365
41020	NC_017569	CTA	2	6	2160658	2160663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322365
41021	NC_017569	CTA	2	6	2160670	2160675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322365
41022	NC_017569	T	6	6	2160709	2160714	0 %	100 %	0 %	0 %	386322365
41023	NC_017569	ATC	2	6	2160824	2160829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322365
41024	NC_017569	ATT	2	6	2160888	2160893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386322365
41025	NC_017569	CCT	2	6	2160992	2160997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386322366
41026	NC_017569	TCA	2	6	2161030	2161035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322366
41027	NC_017569	TTTC	2	8	2161078	2161085	0 %	75 %	0 %	25 %	386322366
41028	NC_017569	ATT	2	6	2161092	2161097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386322366
41029	NC_017569	ACC	2	6	2161164	2161169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386322366
41030	NC_017569	TAC	2	6	2161181	2161186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322366
41031	NC_017569	TAA	2	6	2161199	2161204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322366
41032	NC_017569	ATAA	2	8	2161266	2161273	75 %	25 %	0 %	0 %	386322366
41033	NC_017569	AT	3	6	2161274	2161279	50 %	50 %	0 %	0 %	386322366
41034	NC_017569	A	6	6	2161327	2161332	100 %	0 %	0 %	0 %	386322366
41035	NC_017569	CTT	2	6	2161370	2161375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322366
41036	NC_017569	CTAC	2	8	2161393	2161400	25 %	25 %	0 %	50 %	386322366
41037	NC_017569	TAAG	2	8	2161445	2161452	50 %	25 %	25 %	0 %	386322366
41038	NC_017569	T	6	6	2161453	2161458	0 %	100 %	0 %	0 %	386322366
41039	NC_017569	TCT	2	6	2161462	2161467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322366
41040	NC_017569	TCT	2	6	2161589	2161594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322366
41041	NC_017569	TAA	2	6	2161616	2161621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322366
41042	NC_017569	TGTT	2	8	2161632	2161639	0 %	75 %	25 %	0 %	386322366
41043	NC_017569	TTG	2	6	2161665	2161670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386322366
41044	NC_017569	AAAG	2	8	2161710	2161717	75 %	0 %	25 %	0 %	386322366
41045	NC_017569	T	6	6	2161767	2161772	0 %	100 %	0 %	0 %	386322366
41046	NC_017569	TTTGCC	2	12	2161859	2161870	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386322366
41047	NC_017569	T	6	6	2161946	2161951	0 %	100 %	0 %	0 %	386322366
41048	NC_017569	AGA	2	6	2161957	2161962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322366
41049	NC_017569	GTATTG	2	12	2161965	2161976	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386322366
41050	NC_017569	AAT	2	6	2162015	2162020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322366
41051	NC_017569	TAT	2	6	2162036	2162041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386322366
41052	NC_017569	A	7	7	2162043	2162049	100 %	0 %	0 %	0 %	386322366
41053	NC_017569	ATT	2	6	2162081	2162086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386322367
41054	NC_017569	T	6	6	2162090	2162095	0 %	100 %	0 %	0 %	386322367
41055	NC_017569	GTA	2	6	2162197	2162202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322367
41056	NC_017569	T	7	7	2162222	2162228	0 %	100 %	0 %	0 %	386322367
41057	NC_017569	AGT	2	6	2162302	2162307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322367
41058	NC_017569	TA	3	6	2162311	2162316	50 %	50 %	0 %	0 %	386322367
41059	NC_017569	TAA	2	6	2162361	2162366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322367
41060	NC_017569	ATT	2	6	2162394	2162399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386322367
41061	NC_017569	AGA	2	6	2162466	2162471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322367
41062	NC_017569	TACT	2	8	2162492	2162499	25 %	50 %	0 %	25 %	386322367
41063	NC_017569	TG	3	6	2162548	2162553	0 %	50 %	50 %	0 %	386322367
41064	NC_017569	TAAA	2	8	2162555	2162562	75 %	25 %	0 %	0 %	386322367
41065	NC_017569	T	7	7	2162583	2162589	0 %	100 %	0 %	0 %	386322367
41066	NC_017569	GT	3	6	2162623	2162628	0 %	50 %	50 %	0 %	386322367
41067	NC_017569	TGA	2	6	2162659	2162664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322367
41068	NC_017569	ACT	2	6	2162692	2162697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322367
41069	NC_017569	A	8	8	2162702	2162709	100 %	0 %	0 %	0 %	386322367
41070	NC_017569	T	6	6	2162728	2162733	0 %	100 %	0 %	0 %	386322367
41071	NC_017569	GTT	2	6	2162777	2162782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386322367
41072	NC_017569	TTC	2	6	2162826	2162831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322367
41073	NC_017569	T	6	6	2162868	2162873	0 %	100 %	0 %	0 %	386322368
41074	NC_017569	TAA	2	6	2162878	2162883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322368
41075	NC_017569	ATT	2	6	2162937	2162942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386322368
41076	NC_017569	AAT	2	6	2162948	2162953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322368
41077	NC_017569	A	6	6	2162969	2162974	100 %	0 %	0 %	0 %	386322368
41078	NC_017569	TA	3	6	2163047	2163052	50 %	50 %	0 %	0 %	386322368
41079	NC_017569	GAAAA	2	10	2163072	2163081	80 %	0 %	20 %	0 %	386322368
41080	NC_017569	A	6	6	2163078	2163083	100 %	0 %	0 %	0 %	386322368
41081	NC_017569	GCC	2	6	2163093	2163098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386322368
41082	NC_017569	ATG	2	6	2163121	2163126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322368
41083	NC_017569	GCT	2	6	2163170	2163175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322368
41084	NC_017569	CT	3	6	2163174	2163179	0 %	50 %	0 %	50 %	386322368
41085	NC_017569	CAA	2	6	2163199	2163204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386322368
41086	NC_017569	GTTT	2	8	2163216	2163223	0 %	75 %	25 %	0 %	386322368
41087	NC_017569	AACC	2	8	2163226	2163233	50 %	0 %	0 %	50 %	386322368
41088	NC_017569	A	7	7	2163252	2163258	100 %	0 %	0 %	0 %	386322368
41089	NC_017569	CTT	2	6	2163265	2163270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322368
41090	NC_017569	ATA	2	6	2163282	2163287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322368
41091	NC_017569	ACC	3	9	2163323	2163331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386322368
41092	NC_017569	GTT	2	6	2163387	2163392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386322368
41093	NC_017569	T	7	7	2163391	2163397	0 %	100 %	0 %	0 %	386322368
41094	NC_017569	A	6	6	2163399	2163404	100 %	0 %	0 %	0 %	386322368
41095	NC_017569	CTT	2	6	2163451	2163456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322368
41096	NC_017569	T	7	7	2163461	2163467	0 %	100 %	0 %	0 %	386322368
41097	NC_017569	AATC	2	8	2163479	2163486	50 %	25 %	0 %	25 %	386322368
41098	NC_017569	TGC	2	6	2163495	2163500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322368
41099	NC_017569	AAC	2	6	2163518	2163523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386322368
41100	NC_017569	CTT	2	6	2163604	2163609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322368
41101	NC_017569	CAT	2	6	2163661	2163666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322368
41102	NC_017569	T	7	7	2163713	2163719	0 %	100 %	0 %	0 %	386322368
41103	NC_017569	AAT	2	6	2163817	2163822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322369
41104	NC_017569	AAT	2	6	2163843	2163848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322369
41105	NC_017569	ACA	2	6	2163875	2163880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386322369
41106	NC_017569	TAA	2	6	2163904	2163909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322369
41107	NC_017569	TCT	2	6	2163915	2163920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322369
41108	NC_017569	AAAT	2	8	2163935	2163942	75 %	25 %	0 %	0 %	386322369
41109	NC_017569	T	7	7	2164008	2164014	0 %	100 %	0 %	0 %	386322369
41110	NC_017569	AAT	2	6	2164049	2164054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322369
41111	NC_017569	CTGAAC	2	12	2164069	2164080	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386322369
41112	NC_017569	TAAA	2	8	2164081	2164088	75 %	25 %	0 %	0 %	386322369
41113	NC_017569	AAT	2	6	2164178	2164183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322369
41114	NC_017569	AT	3	6	2164210	2164215	50 %	50 %	0 %	0 %	386322369
41115	NC_017569	TAGA	2	8	2164285	2164292	50 %	25 %	25 %	0 %	386322369
41116	NC_017569	T	6	6	2164293	2164298	0 %	100 %	0 %	0 %	386322369
41117	NC_017569	A	6	6	2164402	2164407	100 %	0 %	0 %	0 %	386322369
41118	NC_017569	CTT	2	6	2164412	2164417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322369
41119	NC_017569	A	6	6	2164472	2164477	100 %	0 %	0 %	0 %	386322369
41120	NC_017569	ATA	2	6	2164537	2164542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322369
41121	NC_017569	CTG	3	9	2164582	2164590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322369
41122	NC_017569	AT	3	6	2164593	2164598	50 %	50 %	0 %	0 %	386322369
41123	NC_017569	T	7	7	2164627	2164633	0 %	100 %	0 %	0 %	386322369
41124	NC_017569	TAG	2	6	2164636	2164641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322369
41125	NC_017569	CAG	2	6	2164670	2164675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322369
41126	NC_017569	ATT	2	6	2164737	2164742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386322369
41127	NC_017569	AAAGT	2	10	2164778	2164787	60 %	20 %	20 %	0 %	386322369
41128	NC_017569	TTC	2	6	2164809	2164814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322369
41129	NC_017569	GAA	2	6	2164829	2164834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322369
41130	NC_017569	ATT	2	6	2164856	2164861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386322369
41131	NC_017569	A	6	6	2164900	2164905	100 %	0 %	0 %	0 %	386322369
41132	NC_017569	GCC	2	6	2164908	2164913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386322369
41133	NC_017569	ATT	2	6	2164999	2165004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386322370
41134	NC_017569	CT	3	6	2165005	2165010	0 %	50 %	0 %	50 %	386322370
41135	NC_017569	TTCTT	2	10	2165047	2165056	0 %	80 %	0 %	20 %	386322370
41136	NC_017569	T	6	6	2165104	2165109	0 %	100 %	0 %	0 %	386322370
41137	NC_017569	TAC	2	6	2165128	2165133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322370
41138	NC_017569	TAG	2	6	2165196	2165201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322370
41139	NC_017569	CTT	2	6	2165235	2165240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322370
41140	NC_017569	CAA	2	6	2165280	2165285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386322370
41141	NC_017569	TCT	2	6	2165294	2165299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322370
41142	NC_017569	ACC	2	6	2165335	2165340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386322370
41143	NC_017569	ACC	2	6	2165350	2165355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386322370
41144	NC_017569	CAT	2	6	2165461	2165466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322370
41145	NC_017569	TA	3	6	2165482	2165487	50 %	50 %	0 %	0 %	386322370
41146	NC_017569	ACT	2	6	2165516	2165521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322370
41147	NC_017569	T	6	6	2165601	2165606	0 %	100 %	0 %	0 %	386322370
41148	NC_017569	TAC	2	6	2165623	2165628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322370
41149	NC_017569	TTC	2	6	2165737	2165742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322370
41150	NC_017569	TAA	2	6	2165749	2165754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322370
41151	NC_017569	TTGT	2	8	2165781	2165788	0 %	75 %	25 %	0 %	386322370
41152	NC_017569	A	6	6	2165837	2165842	100 %	0 %	0 %	0 %	386322371
41153	NC_017569	ATA	2	6	2165876	2165881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322371
41154	NC_017569	AATTT	2	10	2165909	2165918	40 %	60 %	0 %	0 %	386322371
41155	NC_017569	GA	3	6	2165955	2165960	50 %	0 %	50 %	0 %	386322371
41156	NC_017569	A	7	7	2165984	2165990	100 %	0 %	0 %	0 %	386322371
41157	NC_017569	TAT	2	6	2166072	2166077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386322371
41158	NC_017569	ATT	2	6	2166179	2166184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386322371
41159	NC_017569	T	8	8	2166183	2166190	0 %	100 %	0 %	0 %	386322371
41160	NC_017569	TAC	2	6	2166202	2166207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322371
41161	NC_017569	CTAA	2	8	2166290	2166297	50 %	25 %	0 %	25 %	386322371
41162	NC_017569	TCT	2	6	2166328	2166333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322371
41163	NC_017569	ATT	2	6	2166335	2166340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386322371

< Previous12...71727374757677787980818283Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.