MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Riemerella anatipestifer RA-GD chromosome

Total Repeats: 41163

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3502	NC_017569	ATG	2	6	178883	178888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320573
3503	NC_017569	CAG	2	6	178889	178894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386320573
3504	NC_017569	GAA	2	6	178997	179002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320574
3505	NC_017569	TGG	2	6	179048	179053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386320574
3506	NC_017569	AAT	2	6	179092	179097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320574
3507	NC_017569	A	7	7	179098	179104	100 %	0 %	0 %	0 %	386320574
3508	NC_017569	CTG	2	6	179107	179112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386320574
3509	NC_017569	TTA	2	6	179136	179141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320574
3510	NC_017569	GA	3	6	179273	179278	50 %	0 %	50 %	0 %	386320574
3511	NC_017569	CAA	2	6	179383	179388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386320574
3512	NC_017569	CTCG	2	8	179452	179459	0 %	25 %	25 %	50 %	386320574
3513	NC_017569	CA	3	6	179585	179590	50 %	0 %	0 %	50 %	386320574
3514	NC_017569	AGG	2	6	179612	179617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386320574
3515	NC_017569	AAT	2	6	179655	179660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320574
3516	NC_017569	AAT	2	6	179665	179670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320574
3517	NC_017569	TGG	2	6	179675	179680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386320574
3518	NC_017569	AGA	2	6	179797	179802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320574
3519	NC_017569	CAA	3	9	179841	179849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386320574
3520	NC_017569	TA	3	6	179881	179886	50 %	50 %	0 %	0 %	386320574
3521	NC_017569	TTA	2	6	179987	179992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320574
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3523	NC_017569	ATA	2	6	180050	180055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320575
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3525	NC_017569	GAA	2	6	180083	180088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320575
3526	NC_017569	TGA	2	6	180148	180153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320575
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3528	NC_017569	AAGT	2	8	180315	180322	50 %	25 %	25 %	0 %	386320576
3529	NC_017569	ATATA	2	10	180357	180366	60 %	40 %	0 %	0 %	386320576
3530	NC_017569	A	7	7	180444	180450	100 %	0 %	0 %	0 %	386320576
3531	NC_017569	A	6	6	180456	180461	100 %	0 %	0 %	0 %	386320576
3532	NC_017569	ACT	2	6	180504	180509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320576
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3534	NC_017569	ATTT	3	12	180554	180565	25 %	75 %	0 %	0 %	386320576
3535	NC_017569	AAT	2	6	180580	180585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320576
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3537	NC_017569	ATC	2	6	180782	180787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320577
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3539	NC_017569	TTA	2	6	180819	180824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320577
3540	NC_017569	T	8	8	180828	180835	0 %	100 %	0 %	0 %	386320577
3541	NC_017569	GCC	2	6	180873	180878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386320577
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3543	NC_017569	AAT	2	6	180976	180981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320578
3544	NC_017569	T	6	6	181011	181016	0 %	100 %	0 %	0 %	386320578
3545	NC_017569	TTTC	2	8	181035	181042	0 %	75 %	0 %	25 %	386320578
3546	NC_017569	T	6	6	181058	181063	0 %	100 %	0 %	0 %	386320578
3547	NC_017569	A	6	6	181064	181069	100 %	0 %	0 %	0 %	386320578
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3550	NC_017569	ACC	2	6	181382	181387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386320579
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3552	NC_017569	TAGGAA	2	12	181409	181420	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386320579
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3554	NC_017569	AGTAAA	2	12	181539	181550	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386320579
3555	NC_017569	TTA	2	6	181603	181608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320580
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3557	NC_017569	TTA	2	6	181686	181691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320580
3558	NC_017569	T	6	6	181692	181697	0 %	100 %	0 %	0 %	386320580
3559	NC_017569	ATC	2	6	181765	181770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320580
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3562	NC_017569	A	7	7	182011	182017	100 %	0 %	0 %	0 %	386320581
3563	NC_017569	AGA	2	6	182109	182114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320581
3564	NC_017569	AGA	2	6	182118	182123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320581
3565	NC_017569	AGA	2	6	182240	182245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320581
3566	NC_017569	AACCCT	2	12	182266	182277	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386320581
3567	NC_017569	A	6	6	182369	182374	100 %	0 %	0 %	0 %	386320581
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3574	NC_017569	AG	3	6	182772	182777	50 %	0 %	50 %	0 %	386320582
3575	NC_017569	GTT	2	6	182791	182796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386320582
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3587	NC_017569	GATT	2	8	183545	183552	25 %	50 %	25 %	0 %	386320583
3588	NC_017569	TAC	2	6	183665	183670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320583
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3593	NC_017569	A	6	6	184355	184360	100 %	0 %	0 %	0 %	386320584
3594	NC_017569	AG	3	6	184366	184371	50 %	0 %	50 %	0 %	386320584
3595	NC_017569	TAT	2	6	184373	184378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320584
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3602	NC_017569	ATGA	2	8	184788	184795	50 %	25 %	25 %	0 %	386320586
3603	NC_017569	TAA	2	6	184843	184848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320586
3604	NC_017569	GT	3	6	184874	184879	0 %	50 %	50 %	0 %	386320586
3605	NC_017569	TGA	2	6	184973	184978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320586
3606	NC_017569	AG	3	6	185040	185045	50 %	0 %	50 %	0 %	386320586
3607	NC_017569	TCA	2	6	185274	185279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320587
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3611	NC_017569	ACA	2	6	185448	185453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386320587
3612	NC_017569	GAA	2	6	185549	185554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320587
3613	NC_017569	ATT	2	6	185565	185570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320587
3614	NC_017569	CCTAC	2	10	185595	185604	20 %	20 %	0 %	60 %	386320587
3615	NC_017569	A	7	7	185613	185619	100 %	0 %	0 %	0 %	386320587
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3620	NC_017569	GGGTC	2	10	185915	185924	0 %	20 %	60 %	20 %	386320588
3621	NC_017569	AATC	2	8	185948	185955	50 %	25 %	0 %	25 %	386320588
3622	NC_017569	A	6	6	185990	185995	100 %	0 %	0 %	0 %	386320588
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