MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Riemerella anatipestifer RA-GD chromosome

Total Repeats: 41163

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_017569	TTTC	2	8	668199	668206	0 %	75 %	0 %	25 %	386321018
12502	NC_017569	GCT	2	6	668271	668276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386321018
12503	NC_017569	T	6	6	668294	668299	0 %	100 %	0 %	0 %	386321018
12504	NC_017569	GAA	2	6	668347	668352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386321018
12505	NC_017569	T	6	6	668405	668410	0 %	100 %	0 %	0 %	386321018
12506	NC_017569	TA	3	6	668420	668425	50 %	50 %	0 %	0 %	386321018
12507	NC_017569	GTA	2	6	668451	668456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386321018
12508	NC_017569	TCCA	2	8	668460	668467	25 %	25 %	0 %	50 %	386321018
12509	NC_017569	GAA	2	6	668534	668539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386321018
12510	NC_017569	TAC	2	6	668567	668572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386321018
12511	NC_017569	TGA	2	6	668590	668595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386321018
12512	NC_017569	GTACC	2	10	668623	668632	20 %	20 %	20 %	40 %	386321018
12513	NC_017569	ATC	2	6	668663	668668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386321018
12514	NC_017569	TAAG	2	8	668721	668728	50 %	25 %	25 %	0 %	386321018
12515	NC_017569	CT	4	8	668731	668738	0 %	50 %	0 %	50 %	386321018
12516	NC_017569	AC	3	6	668739	668744	50 %	0 %	0 %	50 %	386321018
12517	NC_017569	GAG	2	6	668761	668766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386321018
12518	NC_017569	CTA	2	6	668770	668775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386321018
12519	NC_017569	CT	3	6	668863	668868	0 %	50 %	0 %	50 %	386321018
12520	NC_017569	GT	3	6	668878	668883	0 %	50 %	50 %	0 %	386321018
12521	NC_017569	AATT	2	8	668965	668972	50 %	50 %	0 %	0 %	386321018
12522	NC_017569	GTC	2	6	668997	669002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386321018
12523	NC_017569	A	6	6	669459	669464	100 %	0 %	0 %	0 %	386321019
12524	NC_017569	T	6	6	669486	669491	0 %	100 %	0 %	0 %	386321019
12525	NC_017569	ATC	2	6	669503	669508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386321019
12526	NC_017569	CAG	2	6	669535	669540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386321019
12527	NC_017569	CTAAAA	2	12	669544	669555	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386321019
12528	NC_017569	TGT	2	6	669563	669568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386321019
12529	NC_017569	TAT	2	6	669584	669589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386321019
12530	NC_017569	CT	3	6	669619	669624	0 %	50 %	0 %	50 %	386321019
12531	NC_017569	GAG	2	6	669625	669630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386321019
12532	NC_017569	CTGA	2	8	669664	669671	25 %	25 %	25 %	25 %	386321019
12533	NC_017569	CCAC	2	8	669686	669693	25 %	0 %	0 %	75 %	386321019
12534	NC_017569	TTAACT	2	12	669705	669716	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386321019
12535	NC_017569	TCC	2	6	669755	669760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386321019
12536	NC_017569	TTG	2	6	669767	669772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386321019
12537	NC_017569	GAA	2	6	669852	669857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386321019
12538	NC_017569	A	6	6	669901	669906	100 %	0 %	0 %	0 %	386321019
12539	NC_017569	ATA	2	6	669937	669942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386321019
12540	NC_017569	T	7	7	669943	669949	0 %	100 %	0 %	0 %	386321019
12541	NC_017569	ATT	2	6	669951	669956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386321019
12542	NC_017569	CAT	2	6	670116	670121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386321020
12543	NC_017569	ATC	2	6	670222	670227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386321020
12544	NC_017569	ACT	2	6	670293	670298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386321020
12545	NC_017569	CTG	3	9	670418	670426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386321020
12546	NC_017569	TCG	2	6	670463	670468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386321020
12547	NC_017569	CCT	2	6	670480	670485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386321020
12548	NC_017569	AACTA	2	10	670491	670500	60 %	20 %	0 %	20 %	386321020
12549	NC_017569	TGA	2	6	670536	670541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386321020
12550	NC_017569	CCT	2	6	670573	670578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386321020
12551	NC_017569	ACT	2	6	670585	670590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386321020
12552	NC_017569	ATC	2	6	670599	670604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386321020
12553	NC_017569	ATA	2	6	670644	670649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386321020
12554	NC_017569	ACT	2	6	670764	670769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386321020
12555	NC_017569	TAG	2	6	670805	670810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386321020
12556	NC_017569	ATC	2	6	670905	670910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386321020
12557	NC_017569	TAA	2	6	670982	670987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386321020
12558	NC_017569	CT	3	6	671041	671046	0 %	50 %	0 %	50 %	386321020
12559	NC_017569	TTG	2	6	671086	671091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386321020
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12562	NC_017569	CAG	2	6	671237	671242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386321020
12563	NC_017569	AT	4	8	671321	671328	50 %	50 %	0 %	0 %	386321020
12564	NC_017569	T	7	7	671342	671348	0 %	100 %	0 %	0 %	386321020
12565	NC_017569	T	6	6	671353	671358	0 %	100 %	0 %	0 %	386321020
12566	NC_017569	A	6	6	671394	671399	100 %	0 %	0 %	0 %	386321021
12567	NC_017569	GGA	3	9	671405	671413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386321021
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12569	NC_017569	ATTT	2	8	671436	671443	25 %	75 %	0 %	0 %	386321021
12570	NC_017569	TAA	2	6	671445	671450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386321021
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12572	NC_017569	A	6	6	671528	671533	100 %	0 %	0 %	0 %	386321021
12573	NC_017569	A	6	6	671547	671552	100 %	0 %	0 %	0 %	386321021
12574	NC_017569	ATT	2	6	671593	671598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386321021
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12580	NC_017569	AAT	2	6	671749	671754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386321021
12581	NC_017569	ATT	2	6	671770	671775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386321021
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12585	NC_017569	ATTCT	2	10	671897	671906	20 %	60 %	0 %	20 %	386321021
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12587	NC_017569	ACC	2	6	672057	672062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386321022
12588	NC_017569	ACT	2	6	672161	672166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386321022
12589	NC_017569	TAT	2	6	672247	672252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386321022
12590	NC_017569	TAT	2	6	672280	672285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386321022
12591	NC_017569	TAT	2	6	672349	672354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386321022
12592	NC_017569	T	7	7	672405	672411	0 %	100 %	0 %	0 %	386321022
12593	NC_017569	ATT	2	6	672416	672421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386321022
12594	NC_017569	TAA	2	6	672428	672433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386321022
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12597	NC_017569	T	7	7	672535	672541	0 %	100 %	0 %	0 %	386321022
12598	NC_017569	TC	3	6	672574	672579	0 %	50 %	0 %	50 %	386321023
12599	NC_017569	ACA	2	6	672621	672626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386321023
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12601	NC_017569	CAT	2	6	672686	672691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386321023
12602	NC_017569	CCA	2	6	672783	672788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386321023
12603	NC_017569	TGA	2	6	672872	672877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386321023
12604	NC_017569	CAT	2	6	672925	672930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386321023
12605	NC_017569	ATT	3	9	672938	672946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386321023
12606	NC_017569	TTGAA	2	10	672989	672998	40 %	40 %	20 %	0 %	386321023
12607	NC_017569	GAA	3	9	672996	673004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386321023
12608	NC_017569	GTA	2	6	673077	673082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386321023
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12610	NC_017569	GAATCT	2	12	673212	673223	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386321023
12611	NC_017569	AAT	2	6	673231	673236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386321023
12612	NC_017569	CCATCT	2	12	673245	673256	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	386321023
12613	NC_017569	CCT	2	6	673296	673301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386321023
12614	NC_017569	TCCAT	2	10	673315	673324	20 %	40 %	0 %	40 %	386321023
12615	NC_017569	CTG	2	6	673391	673396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386321023
12616	NC_017569	TA	3	6	673408	673413	50 %	50 %	0 %	0 %	386321023
12617	NC_017569	GCC	2	6	673449	673454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386321023
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12619	NC_017569	A	6	6	673467	673472	100 %	0 %	0 %	0 %	386321023
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