MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia prowazekii Rp22 chromosome

Total Repeats: 22553

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017560	GAA	2	6	202407	202412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386082001
4002	NC_017560	AAG	2	6	202419	202424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386082001
4003	NC_017560	TTTA	2	8	202586	202593	25 %	75 %	0 %	0 %	386082003
4004	NC_017560	ATA	2	6	202598	202603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386082003
4005	NC_017560	TA	3	6	202607	202612	50 %	50 %	0 %	0 %	386082003
4006	NC_017560	AT	4	8	202672	202679	50 %	50 %	0 %	0 %	386082003
4007	NC_017560	T	6	6	202684	202689	0 %	100 %	0 %	0 %	386082003
4008	NC_017560	AAT	2	6	202711	202716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386082003
4009	NC_017560	ATT	3	9	202721	202729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386082003
4010	NC_017560	TTG	2	6	202730	202735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386082003
4011	NC_017560	CTT	2	6	202803	202808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386082003
4012	NC_017560	CTG	2	6	202856	202861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386082003
4013	NC_017560	TGC	2	6	202878	202883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386082003
4014	NC_017560	T	7	7	202931	202937	0 %	100 %	0 %	0 %	386082003
4015	NC_017560	TAT	2	6	202959	202964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386082003
4016	NC_017560	ATA	2	6	203063	203068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386082003
4017	NC_017560	TTA	2	6	203081	203086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386082003
4018	NC_017560	TAC	2	6	203094	203099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386082003
4019	NC_017560	TTA	2	6	203143	203148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386082003
4020	NC_017560	A	6	6	203164	203169	100 %	0 %	0 %	0 %	386082003
4021	NC_017560	TAA	2	6	203217	203222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386082003
4022	NC_017560	TAC	2	6	203246	203251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386082003
4023	NC_017560	AT	3	6	203278	203283	50 %	50 %	0 %	0 %	386082003
4024	NC_017560	TA	3	6	203320	203325	50 %	50 %	0 %	0 %	386082003
4025	NC_017560	T	6	6	203341	203346	0 %	100 %	0 %	0 %	386082003
4026	NC_017560	AGA	2	6	204178	204183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386082004
4027	NC_017560	AGG	2	6	204207	204212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386082004
4028	NC_017560	TTA	2	6	204213	204218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386082004
4029	NC_017560	GAT	2	6	204238	204243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386082004
4030	NC_017560	ATT	2	6	204251	204256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386082004
4031	NC_017560	GAA	2	6	204260	204265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386082004
4032	NC_017560	ACA	2	6	204296	204301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386082004
4033	NC_017560	ACC	2	6	204322	204327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386082004
4034	NC_017560	TTA	2	6	204335	204340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386082004
4035	NC_017560	A	6	6	204413	204418	100 %	0 %	0 %	0 %	386082004
4036	NC_017560	ATG	2	6	204576	204581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386082004
4037	NC_017560	TGA	2	6	204624	204629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386082004
4038	NC_017560	GAA	2	6	204632	204637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386082004
4039	NC_017560	A	6	6	204649	204654	100 %	0 %	0 %	0 %	386082004
4040	NC_017560	GGT	2	6	204791	204796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386082004
4041	NC_017560	GCA	2	6	204797	204802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386082004
4042	NC_017560	AGT	2	6	204845	204850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386082004
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4046	NC_017560	A	6	6	204975	204980	100 %	0 %	0 %	0 %	386082004
4047	NC_017560	A	8	8	205045	205052	100 %	0 %	0 %	0 %	386082004
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4052	NC_017560	TAAT	2	8	205203	205210	50 %	50 %	0 %	0 %	386082004
4053	NC_017560	TGC	2	6	205231	205236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386082004
4054	NC_017560	TGA	2	6	205302	205307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386082004
4055	NC_017560	A	7	7	205307	205313	100 %	0 %	0 %	0 %	386082004
4056	NC_017560	TAAT	2	8	205538	205545	50 %	50 %	0 %	0 %	386082005
4057	NC_017560	A	6	6	205566	205571	100 %	0 %	0 %	0 %	386082005
4058	NC_017560	AAT	2	6	205589	205594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386082005
4059	NC_017560	CT	3	6	205600	205605	0 %	50 %	0 %	50 %	386082005
4060	NC_017560	CACTAC	2	12	205613	205624	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386082005
4061	NC_017560	AAGT	2	8	205651	205658	50 %	25 %	25 %	0 %	386082005
4062	NC_017560	TTC	2	6	205697	205702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386082005
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4064	NC_017560	TAA	2	6	205809	205814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386082005
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4071	NC_017560	CCA	2	6	206113	206118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386082005
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4091	NC_017560	CT	3	6	207002	207007	0 %	50 %	0 %	50 %	386082005
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4096	NC_017560	CATCT	2	10	207204	207213	20 %	40 %	0 %	40 %	386082005
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4103	NC_017560	TTGC	2	8	207515	207522	0 %	50 %	25 %	25 %	386082005
4104	NC_017560	TTA	2	6	207538	207543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386082005
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4106	NC_017560	TA	3	6	207614	207619	50 %	50 %	0 %	0 %	386082005
4107	NC_017560	TAT	3	9	207626	207634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386082005
4108	NC_017560	TAA	2	6	207660	207665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386082005
4109	NC_017560	AAT	2	6	207666	207671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386082005
4110	NC_017560	T	7	7	207689	207695	0 %	100 %	0 %	0 %	386082005
4111	NC_017560	ATT	2	6	207697	207702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386082005
4112	NC_017560	A	6	6	207965	207970	100 %	0 %	0 %	0 %	386082006
4113	NC_017560	CATT	2	8	208004	208011	25 %	50 %	0 %	25 %	386082006
4114	NC_017560	TTTG	2	8	208018	208025	0 %	75 %	25 %	0 %	386082006
4115	NC_017560	AGTA	2	8	208061	208068	50 %	25 %	25 %	0 %	386082006
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4118	NC_017560	T	8	8	208156	208163	0 %	100 %	0 %	0 %	386082006
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4121	NC_017560	AATAA	2	10	208215	208224	80 %	20 %	0 %	0 %	386082006
4122	NC_017560	ATT	2	6	208236	208241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386082006
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4494	NC_017560	AGTTA	2	10	227708	227717	40 %	40 %	20 %	0 %	386082018
4495	NC_017560	ATTTT	2	10	227722	227731	20 %	80 %	0 %	0 %	386082019
4496	NC_017560	ATT	2	6	227746	227751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386082019
4497	NC_017560	AGC	2	6	227761	227766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386082019
4498	NC_017560	TA	3	6	227810	227815	50 %	50 %	0 %	0 %	386082019
4499	NC_017560	TCT	2	6	227861	227866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386082019
4500	NC_017560	AT	3	6	227901	227906	50 %	50 %	0 %	0 %	386082019

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