MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia prowazekii Rp22 chromosome

Total Repeats: 22553

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
22501	NC_017560	CTACT	2	10	1109529	1109538	20 %	40 %	0 %	40 %	386082783
22502	NC_017560	TAT	2	6	1109638	1109643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386082783
22503	NC_017560	ATA	2	6	1109670	1109675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386082783
22504	NC_017560	TAT	2	6	1109707	1109712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386082783
22505	NC_017560	TCT	3	9	1109735	1109743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386082783
22506	NC_017560	AATATC	2	12	1109773	1109784	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386082783
22507	NC_017560	A	6	6	1109795	1109800	100 %	0 %	0 %	0 %	386082783
22508	NC_017560	GAT	2	6	1109810	1109815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386082783
22509	NC_017560	GTA	2	6	1109819	1109824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386082783
22510	NC_017560	AAT	2	6	1109852	1109857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386082783
22511	NC_017560	ATT	2	6	1109858	1109863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386082783
22512	NC_017560	CTT	2	6	1109898	1109903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386082783
22513	NC_017560	ATA	2	6	1109939	1109944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386082783
22514	NC_017560	TCT	2	6	1109948	1109953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386082783
22515	NC_017560	TAC	2	6	1110024	1110029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386082783
22516	NC_017560	T	6	6	1110045	1110050	0 %	100 %	0 %	0 %	386082783
22517	NC_017560	T	8	8	1110055	1110062	0 %	100 %	0 %	0 %	386082783
22518	NC_017560	ATT	2	6	1110077	1110082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386082783
22519	NC_017560	AAT	2	6	1110088	1110093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386082783
22520	NC_017560	ATTA	2	8	1110115	1110122	50 %	50 %	0 %	0 %	386082783
22521	NC_017560	TCT	2	6	1110173	1110178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386082783
22522	NC_017560	ACC	2	6	1110181	1110186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386082783
22523	NC_017560	CTTTC	2	10	1110308	1110317	0 %	60 %	0 %	40 %	386082784
22524	NC_017560	T	6	6	1110340	1110345	0 %	100 %	0 %	0 %	386082784
22525	NC_017560	TAA	2	6	1110349	1110354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386082784
22526	NC_017560	TAA	2	6	1110368	1110373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386082784
22527	NC_017560	TAT	2	6	1110398	1110403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386082784
22528	NC_017560	TTA	2	6	1110408	1110413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386082784
22529	NC_017560	CTT	2	6	1110475	1110480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386082784
22530	NC_017560	TAA	2	6	1110497	1110502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386082784
22531	NC_017560	CTT	2	6	1110547	1110552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386082784
22532	NC_017560	T	8	8	1110568	1110575	0 %	100 %	0 %	0 %	386082784
22533	NC_017560	ATC	2	6	1110602	1110607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386082784
22534	NC_017560	T	6	6	1110691	1110696	0 %	100 %	0 %	0 %	386082784
22535	NC_017560	TAA	2	6	1110700	1110705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386082784
22536	NC_017560	TAA	2	6	1110710	1110715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386082784
22537	NC_017560	TATTT	2	10	1110728	1110737	20 %	80 %	0 %	0 %	386082784
22538	NC_017560	AT	3	6	1110740	1110745	50 %	50 %	0 %	0 %	386082784
22539	NC_017560	T	6	6	1110749	1110754	0 %	100 %	0 %	0 %	386082784
22540	NC_017560	TTTTCC	2	12	1110773	1110784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386082784
22541	NC_017560	AAG	2	6	1110835	1110840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386082784
22542	NC_017560	T	7	7	1110866	1110872	0 %	100 %	0 %	0 %	386082784
22543	NC_017560	ATT	2	6	1110873	1110878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386082784
22544	NC_017560	TAT	2	6	1110898	1110903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386082784
22545	NC_017560	AT	3	6	1111015	1111020	50 %	50 %	0 %	0 %	386082784
22546	NC_017560	A	6	6	1111024	1111029	100 %	0 %	0 %	0 %	386082784
22547	NC_017560	CAT	2	6	1111093	1111098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386082784
22548	NC_017560	T	6	6	1111116	1111121	0 %	100 %	0 %	0 %	386082784
22549	NC_017560	GTT	2	6	1111122	1111127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386082784
22550	NC_017560	TC	3	6	1111128	1111133	0 %	50 %	0 %	50 %	386082784
22551	NC_017560	T	6	6	1111136	1111141	0 %	100 %	0 %	0 %	386082784
22552	NC_017560	TTA	2	6	1111191	1111196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386082784
22553	NC_017560	T	6	6	1111200	1111205	0 %	100 %	0 %	0 %	386082784

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.