MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia prowazekii Rp22 chromosome

Total Repeats: 22553

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017560	AAC	2	6	261371	261376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386082043
5002	NC_017560	TGTATC	2	12	261377	261388	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386082043
5003	NC_017560	CTA	2	6	261415	261420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386082043
5004	NC_017560	TAA	2	6	261421	261426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386082043
5005	NC_017560	TA	3	6	261458	261463	50 %	50 %	0 %	0 %	386082043
5006	NC_017560	AAT	2	6	261480	261485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386082043
5007	NC_017560	TA	3	6	261514	261519	50 %	50 %	0 %	0 %	386082043
5008	NC_017560	ATT	2	6	261572	261577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386082043
5009	NC_017560	T	7	7	261598	261604	0 %	100 %	0 %	0 %	386082043
5010	NC_017560	TTTATT	2	12	261608	261619	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386082043
5011	NC_017560	TA	3	6	261707	261712	50 %	50 %	0 %	0 %	386082043
5012	NC_017560	TAT	2	6	261718	261723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386082043
5013	NC_017560	A	6	6	261744	261749	100 %	0 %	0 %	0 %	386082043
5014	NC_017560	ATT	2	6	261779	261784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386082043
5015	NC_017560	TAAAAA	2	12	261805	261816	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386082043
5016	NC_017560	TTA	2	6	261826	261831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386082043
5017	NC_017560	AAT	2	6	261840	261845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386082043
5018	NC_017560	TTA	2	6	261850	261855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386082043
5019	NC_017560	GTTT	2	8	261909	261916	0 %	75 %	25 %	0 %	386082043
5020	NC_017560	ATA	2	6	261942	261947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386082043
5021	NC_017560	A	7	7	262046	262052	100 %	0 %	0 %	0 %	386082043
5022	NC_017560	TAAA	2	8	262094	262101	75 %	25 %	0 %	0 %	386082043
5023	NC_017560	T	6	6	262107	262112	0 %	100 %	0 %	0 %	386082043
5024	NC_017560	ATG	2	6	262115	262120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386082043
5025	NC_017560	TAAA	2	8	262135	262142	75 %	25 %	0 %	0 %	386082043
5026	NC_017560	CTT	2	6	262159	262164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386082043
5027	NC_017560	TAA	2	6	262187	262192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386082043
5028	NC_017560	GTTT	2	8	262197	262204	0 %	75 %	25 %	0 %	386082043
5029	NC_017560	ATGA	2	8	262215	262222	50 %	25 %	25 %	0 %	386082043
5030	NC_017560	ATC	2	6	262236	262241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386082043
5031	NC_017560	TA	3	6	262834	262839	50 %	50 %	0 %	0 %	386082044
5032	NC_017560	T	6	6	262873	262878	0 %	100 %	0 %	0 %	386082044
5033	NC_017560	TA	3	6	262894	262899	50 %	50 %	0 %	0 %	386082044
5034	NC_017560	GCAT	2	8	262902	262909	25 %	25 %	25 %	25 %	386082044
5035	NC_017560	AATA	2	8	262940	262947	75 %	25 %	0 %	0 %	386082044
5036	NC_017560	GAAAAT	2	12	262960	262971	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386082044
5037	NC_017560	ACT	2	6	262989	262994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386082044
5038	NC_017560	ATT	2	6	263057	263062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386082044
5039	NC_017560	AAT	2	6	263105	263110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386082044
5040	NC_017560	CTTC	2	8	263115	263122	0 %	50 %	0 %	50 %	386082044
5041	NC_017560	TTGTT	2	10	263123	263132	0 %	80 %	20 %	0 %	386082044
5042	NC_017560	GTA	2	6	263157	263162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386082044
5043	NC_017560	A	6	6	263220	263225	100 %	0 %	0 %	0 %	386082044
5044	NC_017560	TGC	2	6	263324	263329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386082044
5045	NC_017560	ATCATT	2	12	263369	263380	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386082044
5046	NC_017560	CTAT	2	8	263385	263392	25 %	50 %	0 %	25 %	386082044
5047	NC_017560	TAT	2	6	263428	263433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386082044
5048	NC_017560	TG	3	6	263455	263460	0 %	50 %	50 %	0 %	386082044
5049	NC_017560	TTGAT	2	10	263464	263473	20 %	60 %	20 %	0 %	386082044
5050	NC_017560	GT	3	6	263479	263484	0 %	50 %	50 %	0 %	386082044
5051	NC_017560	TAA	2	6	263647	263652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386082044
5052	NC_017560	TG	3	6	263659	263664	0 %	50 %	50 %	0 %	386082044
5053	NC_017560	TCA	2	6	263679	263684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386082044
5054	NC_017560	ATTTA	2	10	263690	263699	40 %	60 %	0 %	0 %	386082044
5055	NC_017560	CAA	2	6	263724	263729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386082044
5056	NC_017560	T	6	6	263741	263746	0 %	100 %	0 %	0 %	386082044
5057	NC_017560	TAA	2	6	263791	263796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386082044
5058	NC_017560	TAT	2	6	263803	263808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386082044
5059	NC_017560	TAA	2	6	263816	263821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386082044
5060	NC_017560	T	7	7	263828	263834	0 %	100 %	0 %	0 %	386082044
5061	NC_017560	TAT	2	6	263843	263848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386082044
5062	NC_017560	T	6	6	265406	265411	0 %	100 %	0 %	0 %	386082045
5063	NC_017560	T	6	6	265425	265430	0 %	100 %	0 %	0 %	386082045
5064	NC_017560	AAT	2	6	265431	265436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386082045
5065	NC_017560	TG	3	6	265439	265444	0 %	50 %	50 %	0 %	386082045
5066	NC_017560	CAT	2	6	265450	265455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386082045
5067	NC_017560	TGC	2	6	265462	265467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386082045
5068	NC_017560	AAT	2	6	265552	265557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386082045
5069	NC_017560	ACT	2	6	265598	265603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386082045
5070	NC_017560	TCA	2	6	265611	265616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386082045
5071	NC_017560	T	6	6	265635	265640	0 %	100 %	0 %	0 %	386082045
5072	NC_017560	ATT	2	6	265688	265693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386082045
5073	NC_017560	CA	3	6	265705	265710	50 %	0 %	0 %	50 %	386082045
5074	NC_017560	TGC	2	6	265757	265762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386082045
5075	NC_017560	GCT	3	9	265767	265775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386082045
5076	NC_017560	TCA	2	6	265782	265787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386082045
5077	NC_017560	CTT	2	6	265795	265800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386082045
5078	NC_017560	T	6	6	265799	265804	0 %	100 %	0 %	0 %	386082045
5079	NC_017560	TCT	2	6	265935	265940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386082045
5080	NC_017560	TAA	2	6	265966	265971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386082045
5081	NC_017560	AGT	2	6	265973	265978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386082045
5082	NC_017560	CCTGAA	2	12	265983	265994	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386082045
5083	NC_017560	CTA	2	6	265999	266004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386082045
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5085	NC_017560	ATT	3	9	266054	266062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386082045
5086	NC_017560	TAA	2	6	266067	266072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386082045
5087	NC_017560	AAT	2	6	266096	266101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386082045
5088	NC_017560	CTT	2	6	266104	266109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386082045
5089	NC_017560	GTG	2	6	266152	266157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386082045
5090	NC_017560	AC	3	6	266269	266274	50 %	0 %	0 %	50 %	386082045
5091	NC_017560	ATAA	2	8	266314	266321	75 %	25 %	0 %	0 %	386082045
5092	NC_017560	ATT	2	6	266340	266345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386082045
5093	NC_017560	AG	3	6	266361	266366	50 %	0 %	50 %	0 %	386082045
5094	NC_017560	TCA	2	6	266403	266408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386082045
5095	NC_017560	CAA	2	6	266515	266520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386082045
5096	NC_017560	A	7	7	266589	266595	100 %	0 %	0 %	0 %	386082045
5097	NC_017560	ATAAA	2	10	266605	266614	80 %	20 %	0 %	0 %	386082045
5098	NC_017560	AAT	2	6	266666	266671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386082045
5099	NC_017560	ATC	2	6	266712	266717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386082045
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5102	NC_017560	CCA	2	6	266900	266905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386082045
5103	NC_017560	TGA	2	6	266936	266941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386082045
5104	NC_017560	TCA	2	6	266961	266966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386082045
5105	NC_017560	T	6	6	266992	266997	0 %	100 %	0 %	0 %	386082045
5106	NC_017560	AAT	2	6	267023	267028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386082045
5107	NC_017560	AAATA	2	10	267032	267041	80 %	20 %	0 %	0 %	386082045
5108	NC_017560	TAA	2	6	267053	267058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386082045
5109	NC_017560	A	6	6	267084	267089	100 %	0 %	0 %	0 %	386082045
5110	NC_017560	TAA	2	6	267334	267339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386082046
5111	NC_017560	T	6	6	267340	267345	0 %	100 %	0 %	0 %	386082046
5112	NC_017560	AGA	2	6	267346	267351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386082046
5113	NC_017560	CAAG	2	8	267407	267414	50 %	0 %	25 %	25 %	386082046
5114	NC_017560	TTA	2	6	267416	267421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386082046
5115	NC_017560	ATG	2	6	267447	267452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386082046
5116	NC_017560	TAA	3	9	267565	267573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386082046
5117	NC_017560	TAT	3	9	267775	267783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386082047
5118	NC_017560	T	6	6	267854	267859	0 %	100 %	0 %	0 %	386082047
5119	NC_017560	A	6	6	267890	267895	100 %	0 %	0 %	0 %	386082047
5120	NC_017560	AGT	2	6	267959	267964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386082047
5121	NC_017560	TCT	2	6	268083	268088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386082047
5122	NC_017560	CAT	2	6	268097	268102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386082047
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5495	NC_017560	TGA	2	6	286263	286268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386082060
5496	NC_017560	AGA	2	6	286269	286274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386082060
5497	NC_017560	A	6	6	286274	286279	100 %	0 %	0 %	0 %	386082060
5498	NC_017560	GTAG	2	8	286327	286334	25 %	25 %	50 %	0 %	386082060
5499	NC_017560	ATG	2	6	286354	286359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386082060
5500	NC_017560	ACT	2	6	286378	286383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386082060

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