MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ralstonia solanacearum CMR15 chromosome

Total Repeats: 88123

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_017559	TCT	2	6	423545	423550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523408609
10002	NC_017559	GGCCTC	2	12	423573	423584	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	523408609
10003	NC_017559	CGG	2	6	423587	423592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408609
10004	NC_017559	CGC	4	12	423633	423644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408609
10005	NC_017559	TGG	2	6	423650	423655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408609
10006	NC_017559	CGA	2	6	423846	423851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408610
10007	NC_017559	GAT	2	6	423867	423872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408610
10008	NC_017559	GGT	2	6	423894	423899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408610
10009	NC_017559	GGC	2	6	423904	423909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408610
10010	NC_017559	CGC	2	6	423924	423929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408610
10011	NC_017559	CGGCGA	2	12	423942	423953	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	523408610
10012	NC_017559	GGGCAA	2	12	423969	423980	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	523408610
10013	NC_017559	GAAG	2	8	423984	423991	50 %	0 %	50 %	0 %	523408610
10014	NC_017559	GAA	2	6	424053	424058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523408610
10015	NC_017559	GAAG	2	8	424122	424129	50 %	0 %	50 %	0 %	523408610
10016	NC_017559	CGG	2	6	424146	424151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408610
10017	NC_017559	GC	3	6	424158	424163	0 %	0 %	50 %	50 %	523408610
10018	NC_017559	ACA	2	6	424226	424231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523408610
10019	NC_017559	GC	3	6	424236	424241	0 %	0 %	50 %	50 %	523408610
10020	NC_017559	GTCG	2	8	424302	424309	0 %	25 %	50 %	25 %	523408610
10021	NC_017559	CG	3	6	424398	424403	0 %	0 %	50 %	50 %	523408611
10022	NC_017559	ACC	2	6	424407	424412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523408611
10023	NC_017559	GGCCTG	2	12	424427	424438	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	523408611
10024	NC_017559	CGC	2	6	424439	424444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408611
10025	NC_017559	CAA	2	6	424495	424500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523408611
10026	NC_017559	GTCG	2	8	424604	424611	0 %	25 %	50 %	25 %	523408612
10027	NC_017559	GGT	2	6	424676	424681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408612
10028	NC_017559	GGC	2	6	424703	424708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408612
10029	NC_017559	TCG	2	6	424723	424728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408612
10030	NC_017559	CTG	2	6	424823	424828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408612
10031	NC_017559	AAGC	2	8	424835	424842	50 %	0 %	25 %	25 %	523408612
10032	NC_017559	TGG	2	6	424848	424853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408612
10033	NC_017559	TCGA	2	8	424892	424899	25 %	25 %	25 %	25 %	523408612
10034	NC_017559	AAG	2	6	424901	424906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523408612
10035	NC_017559	TGG	2	6	424963	424968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408612
10036	NC_017559	TCCTGG	2	12	425093	425104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408613
10037	NC_017559	CTG	2	6	425107	425112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408613
10038	NC_017559	GC	3	6	425126	425131	0 %	0 %	50 %	50 %	523408613
10039	NC_017559	CGG	2	6	425223	425228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408613
10040	NC_017559	ATC	2	6	425287	425292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408613
10041	NC_017559	GCT	2	6	425298	425303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408613
10042	NC_017559	TGC	2	6	425312	425317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408613
10043	NC_017559	GAA	2	6	425334	425339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523408613
10044	NC_017559	ATC	3	9	425575	425583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408613
10045	NC_017559	GCA	2	6	425596	425601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408613
10046	NC_017559	CGG	2	6	425619	425624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408613
10047	NC_017559	TGG	3	9	425675	425683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408613
10048	NC_017559	TGG	2	6	425708	425713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408613
10049	NC_017559	GTC	2	6	425793	425798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408613
10050	NC_017559	CCG	2	6	425836	425841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408613
10051	NC_017559	TCG	2	6	425851	425856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408613
10052	NC_017559	CGGC	2	8	425894	425901	0 %	0 %	50 %	50 %	523408613
10053	NC_017559	CTG	2	6	425977	425982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408613
10054	NC_017559	ATC	2	6	425995	426000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408613
10055	NC_017559	TTC	2	6	426001	426006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523408613
10056	NC_017559	CTT	2	6	426009	426014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523408613
10057	NC_017559	GAA	2	6	426060	426065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523408613
10058	NC_017559	CTGG	2	8	426145	426152	0 %	25 %	50 %	25 %	523408613
10059	NC_017559	GT	3	6	426172	426177	0 %	50 %	50 %	0 %	523408613
10060	NC_017559	GCT	2	6	426237	426242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408613
10061	NC_017559	ATC	2	6	426244	426249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408613
10062	NC_017559	GTG	2	6	426250	426255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408613
10063	NC_017559	CAG	2	6	426301	426306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408613
10064	NC_017559	TGA	2	6	426317	426322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408613
10065	NC_017559	GAC	2	6	426399	426404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408614
10066	NC_017559	GGT	2	6	426425	426430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408614
10067	NC_017559	CG	4	8	426579	426586	0 %	0 %	50 %	50 %	523408614
10068	NC_017559	ATC	2	6	426684	426689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408615
10069	NC_017559	GTG	2	6	426702	426707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408615
10070	NC_017559	TCG	2	6	426720	426725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408615
10071	NC_017559	AGC	2	6	426739	426744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408615
10072	NC_017559	CG	3	6	426859	426864	0 %	0 %	50 %	50 %	523408616
10073	NC_017559	CGAC	2	8	426895	426902	25 %	0 %	25 %	50 %	523408616
10074	NC_017559	AAG	2	6	426903	426908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523408616
10075	NC_017559	TCG	2	6	426967	426972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408616
10076	NC_017559	ACG	2	6	426993	426998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408616
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10079	NC_017559	AGC	2	6	427176	427181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408617
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10081	NC_017559	GC	4	8	427197	427204	0 %	0 %	50 %	50 %	523408617
10082	NC_017559	AAG	2	6	427207	427212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523408617
10083	NC_017559	CGT	2	6	427253	427258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408617
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10085	NC_017559	ATC	2	6	427270	427275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408617
10086	NC_017559	GGC	2	6	427321	427326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408617
10087	NC_017559	CGC	2	6	427362	427367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408617
10088	NC_017559	GGC	2	6	427374	427379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408617
10089	NC_017559	GCCG	2	8	427387	427394	0 %	0 %	50 %	50 %	523408617
10090	NC_017559	GGGCCC	2	12	427440	427451	0 %	0 %	50 %	50 %	523408617
10091	NC_017559	AAC	2	6	427480	427485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523408617
10092	NC_017559	CCG	2	6	427546	427551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408617
10093	NC_017559	GCC	2	6	427556	427561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408617
10094	NC_017559	CGC	2	6	427811	427816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408618
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10097	NC_017559	CCG	2	6	427993	427998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408618
10098	NC_017559	CGC	2	6	428018	428023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408618
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10100	NC_017559	CTG	2	6	428054	428059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408618
10101	NC_017559	CGT	2	6	428077	428082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408618
10102	NC_017559	GC	3	6	428117	428122	0 %	0 %	50 %	50 %	523408618
10103	NC_017559	GAA	2	6	428224	428229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523408618
10104	NC_017559	TCGCTG	2	12	428249	428260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408618
10105	NC_017559	AAG	2	6	428303	428308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523408618
10106	NC_017559	CAAG	2	8	428323	428330	50 %	0 %	25 %	25 %	523408618
10107	NC_017559	TCG	2	6	428376	428381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408618
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10109	NC_017559	ATC	2	6	428692	428697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408619
10110	NC_017559	GTC	2	6	428706	428711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408619
10111	NC_017559	TGC	2	6	428767	428772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408619
10112	NC_017559	GTC	2	6	428774	428779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408619
10113	NC_017559	CCGA	2	8	428796	428803	25 %	0 %	25 %	50 %	523408619
10114	NC_017559	GTC	2	6	428820	428825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408619
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10116	NC_017559	CGT	2	6	428861	428866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408619
10117	NC_017559	CTG	3	9	428871	428879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408619
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10119	NC_017559	AAGG	2	8	428940	428947	50 %	0 %	50 %	0 %	523408619
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10232	NC_017559	GTC	2	6	433409	433414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408623
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10478	NC_017559	TCG	2	6	443503	443508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408633
10479	NC_017559	CGG	2	6	443540	443545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408633
10480	NC_017559	GCC	2	6	443550	443555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408633
10481	NC_017559	GGC	2	6	443556	443561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408633
10482	NC_017559	CGC	2	6	443569	443574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408633
10483	NC_017559	CCCG	2	8	443580	443587	0 %	0 %	25 %	75 %	523408633
10484	NC_017559	GCA	2	6	443627	443632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408633
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