MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia typhi str. TH1527 chromosome

Total Repeats: 22257

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13502	NC_017066	TGC	2	6	657949	657954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752487
13503	NC_017066	GACGCT	2	12	658058	658069	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	383752487
13504	NC_017066	GCA	2	6	658166	658171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752487
13505	NC_017066	CTT	2	6	658182	658187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752487
13506	NC_017066	AAT	2	6	658213	658218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752487
13507	NC_017066	TAA	2	6	658249	658254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752487
13508	NC_017066	ATT	2	6	658312	658317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752487
13509	NC_017066	ATT	2	6	658363	658368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752487
13510	NC_017066	CTT	2	6	658371	658376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752487
13511	NC_017066	TTA	2	6	658394	658399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752487
13512	NC_017066	TAC	2	6	658414	658419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752487
13513	NC_017066	AAT	2	6	658471	658476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752487
13514	NC_017066	ATTTT	2	10	658547	658556	20 %	80 %	0 %	0 %	383752487
13515	NC_017066	ATG	2	6	658771	658776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752488
13516	NC_017066	CAG	2	6	658819	658824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752488
13517	NC_017066	TTG	2	6	658843	658848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383752488
13518	NC_017066	ATT	2	6	658854	658859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752488
13519	NC_017066	GT	3	6	658921	658926	0 %	50 %	50 %	0 %	383752488
13520	NC_017066	TCC	2	6	658982	658987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383752488
13521	NC_017066	TAT	2	6	659014	659019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752488
13522	NC_017066	T	8	8	659070	659077	0 %	100 %	0 %	0 %	383752488
13523	NC_017066	ATT	2	6	659144	659149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752488
13524	NC_017066	TCT	2	6	659166	659171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752488
13525	NC_017066	TAGCAT	2	12	659179	659190	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383752488
13526	NC_017066	CTT	2	6	659197	659202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752488
13527	NC_017066	TTA	2	6	659277	659282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752488
13528	NC_017066	TAA	2	6	659300	659305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752488
13529	NC_017066	ACATT	2	10	659313	659322	40 %	40 %	0 %	20 %	383752488
13530	NC_017066	ATAA	2	8	659329	659336	75 %	25 %	0 %	0 %	383752488
13531	NC_017066	ATT	3	9	659393	659401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752488
13532	NC_017066	TTC	2	6	659417	659422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752488
13533	NC_017066	ATA	2	6	659458	659463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752488
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13535	NC_017066	AGT	2	6	659627	659632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752488
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13537	NC_017066	T	6	6	659664	659669	0 %	100 %	0 %	0 %	383752488
13538	NC_017066	CTG	2	6	659689	659694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752488
13539	NC_017066	CTT	2	6	659704	659709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752488
13540	NC_017066	AAT	2	6	659762	659767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752488
13541	NC_017066	TTG	2	6	659809	659814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383752488
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13548	NC_017066	CTTAG	2	10	660271	660280	20 %	40 %	20 %	20 %	383752489
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13550	NC_017066	T	6	6	660338	660343	0 %	100 %	0 %	0 %	383752489
13551	NC_017066	GGT	2	6	660418	660423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752489
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13554	NC_017066	TAAA	2	8	660689	660696	75 %	25 %	0 %	0 %	383752490
13555	NC_017066	TAA	2	6	660725	660730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752490
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13559	NC_017066	ATT	2	6	660917	660922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752490
13560	NC_017066	TTTA	2	8	660959	660966	25 %	75 %	0 %	0 %	383752490
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13592	NC_017066	TAT	2	6	662337	662342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752492
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13596	NC_017066	AGCGC	2	10	662659	662668	20 %	0 %	40 %	40 %	383752493
13597	NC_017066	T	7	7	662669	662675	0 %	100 %	0 %	0 %	383752493
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13601	NC_017066	TTTTA	2	10	662805	662814	20 %	80 %	0 %	0 %	383752493
13602	NC_017066	TATTG	2	10	662877	662886	20 %	60 %	20 %	0 %	383752493
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13604	NC_017066	TC	3	6	662917	662922	0 %	50 %	0 %	50 %	383752493
13605	NC_017066	TTC	2	6	662940	662945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752493
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13986	NC_017066	TAA	2	6	684685	684690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752505
13987	NC_017066	A	7	7	684785	684791	100 %	0 %	0 %	0 %	383752506
13988	NC_017066	TAT	2	6	684812	684817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752506
13989	NC_017066	A	9	9	684872	684880	100 %	0 %	0 %	0 %	383752506
13990	NC_017066	TA	3	6	684887	684892	50 %	50 %	0 %	0 %	383752506
13991	NC_017066	AAG	2	6	684895	684900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752506
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