MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia typhi str. TH1527 chromosome

Total Repeats: 22257

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12502	NC_017066	ATACT	2	10	609776	609785	40 %	40 %	0 %	20 %	383752454
12503	NC_017066	GAAT	2	8	609794	609801	50 %	25 %	25 %	0 %	383752454
12504	NC_017066	GT	3	6	609808	609813	0 %	50 %	50 %	0 %	383752454
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12512	NC_017066	TA	3	6	610124	610129	50 %	50 %	0 %	0 %	383752454
12513	NC_017066	AGA	2	6	610149	610154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752454
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12516	NC_017066	GCCTAT	2	12	610320	610331	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383752454
12517	NC_017066	GCAA	2	8	610356	610363	50 %	0 %	25 %	25 %	383752454
12518	NC_017066	A	6	6	610401	610406	100 %	0 %	0 %	0 %	383752454
12519	NC_017066	GAA	2	6	610411	610416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752454
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12521	NC_017066	TA	4	8	610466	610473	50 %	50 %	0 %	0 %	383752454
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12543	NC_017066	AGT	2	6	611634	611639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752454
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12604	NC_017066	A	8	8	615740	615747	100 %	0 %	0 %	0 %	383752457
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12987	NC_017066	TGGT	2	8	631241	631248	0 %	50 %	50 %	0 %	383752469
12988	NC_017066	TAT	2	6	631277	631282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752469
12989	NC_017066	ATA	2	6	631326	631331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752469
12990	NC_017066	ATG	2	6	631335	631340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752469
12991	NC_017066	AATA	2	8	631341	631348	75 %	25 %	0 %	0 %	383752469
12992	NC_017066	ATTA	3	12	631367	631378	50 %	50 %	0 %	0 %	383752469
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