MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia typhi str. TH1527 chromosome

Total Repeats: 22257

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11502	NC_017066	T	6	6	562204	562209	0 %	100 %	0 %	0 %	383752418
11503	NC_017066	AATA	2	8	562222	562229	75 %	25 %	0 %	0 %	383752418
11504	NC_017066	CTG	2	6	562242	562247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752418
11505	NC_017066	AGA	2	6	562267	562272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752418
11506	NC_017066	AAT	3	9	562328	562336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752418
11507	NC_017066	AAG	2	6	562345	562350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752418
11508	NC_017066	TGC	2	6	562354	562359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752418
11509	NC_017066	TAA	2	6	562360	562365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752418
11510	NC_017066	TGC	2	6	562378	562383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752418
11511	NC_017066	TGA	2	6	562387	562392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752418
11512	NC_017066	ATA	2	6	562395	562400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752418
11513	NC_017066	TAAAA	2	10	562435	562444	80 %	20 %	0 %	0 %	383752418
11514	NC_017066	TGC	2	6	562540	562545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752418
11515	NC_017066	GTG	2	6	562590	562595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752418
11516	NC_017066	AT	4	8	562617	562624	50 %	50 %	0 %	0 %	383752418
11517	NC_017066	TAA	3	9	562651	562659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752418
11518	NC_017066	T	6	6	562661	562666	0 %	100 %	0 %	0 %	383752418
11519	NC_017066	GT	3	6	562680	562685	0 %	50 %	50 %	0 %	383752418
11520	NC_017066	TTA	2	6	562758	562763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752418
11521	NC_017066	TAC	2	6	562819	562824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752418
11522	NC_017066	TAC	2	6	562852	562857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752418
11523	NC_017066	ATA	2	6	562866	562871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752418
11524	NC_017066	ATA	2	6	562884	562889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752418
11525	NC_017066	ATT	2	6	562968	562973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752418
11526	NC_017066	ATA	3	9	562985	562993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752418
11527	NC_017066	ACA	2	6	563084	563089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383752418
11528	NC_017066	GGT	3	9	563126	563134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752418
11529	NC_017066	CTA	2	6	563139	563144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752418
11530	NC_017066	ATA	2	6	563148	563153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752418
11531	NC_017066	A	6	6	563192	563197	100 %	0 %	0 %	0 %	383752418
11532	NC_017066	AT	3	6	563242	563247	50 %	50 %	0 %	0 %	383752418
11533	NC_017066	ATT	2	6	563963	563968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752419
11534	NC_017066	ACA	2	6	563969	563974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383752419
11535	NC_017066	CATAG	2	10	564019	564028	40 %	20 %	20 %	20 %	383752419
11536	NC_017066	GCT	2	6	564038	564043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752419
11537	NC_017066	TAA	2	6	564099	564104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752419
11538	NC_017066	CAC	2	6	564176	564181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383752419
11539	NC_017066	TAA	2	6	564254	564259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752419
11540	NC_017066	CTA	2	6	564262	564267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752419
11541	NC_017066	CCG	2	6	564328	564333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383752419
11542	NC_017066	CTT	2	6	564375	564380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752419
11543	NC_017066	TAAT	2	8	564439	564446	50 %	50 %	0 %	0 %	383752419
11544	NC_017066	CTT	2	6	564449	564454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752419
11545	NC_017066	AAT	2	6	564622	564627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752419
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11547	NC_017066	TAG	2	6	564770	564775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752419
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11549	NC_017066	AT	3	6	564814	564819	50 %	50 %	0 %	0 %	383752419
11550	NC_017066	AGT	4	12	564831	564842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752419
11551	NC_017066	TTTC	2	8	564961	564968	0 %	75 %	0 %	25 %	383752419
11552	NC_017066	TTC	2	6	564984	564989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752419
11553	NC_017066	A	8	8	566847	566854	100 %	0 %	0 %	0 %	383752420
11554	NC_017066	TAT	2	6	566855	566860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752420
11555	NC_017066	CTT	2	6	566864	566869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752420
11556	NC_017066	CAA	2	6	566894	566899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383752420
11557	NC_017066	ATA	2	6	566918	566923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752420
11558	NC_017066	TAAA	2	8	566973	566980	75 %	25 %	0 %	0 %	383752420
11559	NC_017066	TAT	3	9	566999	567007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752420
11560	NC_017066	ATTT	2	8	567026	567033	25 %	75 %	0 %	0 %	383752420
11561	NC_017066	ACT	2	6	567042	567047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752420
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11563	NC_017066	T	7	7	567080	567086	0 %	100 %	0 %	0 %	383752420
11564	NC_017066	A	6	6	567124	567129	100 %	0 %	0 %	0 %	383752420
11565	NC_017066	TTC	2	6	567152	567157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752420
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11570	NC_017066	CATA	2	8	567236	567243	50 %	25 %	0 %	25 %	383752420
11571	NC_017066	TAA	2	6	567254	567259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752420
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11587	NC_017066	ATC	2	6	567701	567706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752421
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11589	NC_017066	TA	3	6	567811	567816	50 %	50 %	0 %	0 %	383752421
11590	NC_017066	ATA	2	6	567840	567845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752421
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11593	NC_017066	TAAA	2	8	567931	567938	75 %	25 %	0 %	0 %	383752421
11594	NC_017066	TAT	2	6	568018	568023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752421
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11601	NC_017066	T	8	8	568383	568390	0 %	100 %	0 %	0 %	383752422
11602	NC_017066	TTA	2	6	568393	568398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752422
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11604	NC_017066	T	7	7	568445	568451	0 %	100 %	0 %	0 %	383752422
11605	NC_017066	ACT	2	6	568790	568795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752423
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11607	NC_017066	ATA	2	6	568833	568838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752423
11608	NC_017066	TAT	3	9	568869	568877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752423
11609	NC_017066	T	7	7	568879	568885	0 %	100 %	0 %	0 %	383752423
11610	NC_017066	ATT	2	6	568901	568906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752423
11611	NC_017066	A	8	8	568962	568969	100 %	0 %	0 %	0 %	383752423
11612	NC_017066	A	7	7	569020	569026	100 %	0 %	0 %	0 %	383752423
11613	NC_017066	TTA	2	6	569086	569091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752423
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11990	NC_017066	TAA	2	6	589377	589382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752437
11991	NC_017066	AGT	2	6	589407	589412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752437
11992	NC_017066	ATTATA	2	12	589419	589430	50 %	50 %	0 %	0 %	383752437
11993	NC_017066	A	6	6	589492	589497	100 %	0 %	0 %	0 %	383752437
11994	NC_017066	TAA	3	9	589509	589517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752437
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11999	NC_017066	TTA	2	6	589653	589658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752438
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