MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia typhi str. TH1527 chromosome

Total Repeats: 22257

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017066	TAA	2	6	239746	239751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752171
5002	NC_017066	TAC	2	6	239766	239771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752171
5003	NC_017066	TTA	2	6	239778	239783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752171
5004	NC_017066	ATA	2	6	239857	239862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752171
5005	NC_017066	GCA	2	6	239906	239911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752171
5006	NC_017066	TAA	2	6	239940	239945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752171
5007	NC_017066	TAGT	2	8	239946	239953	25 %	50 %	25 %	0 %	383752171
5008	NC_017066	ATT	2	6	239962	239967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752171
5009	NC_017066	ATT	2	6	239984	239989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752172
5010	NC_017066	T	7	7	239997	240003	0 %	100 %	0 %	0 %	383752172
5011	NC_017066	TAA	2	6	240032	240037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752172
5012	NC_017066	T	6	6	240093	240098	0 %	100 %	0 %	0 %	383752172
5013	NC_017066	TTG	2	6	240102	240107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383752172
5014	NC_017066	TAT	2	6	240121	240126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752172
5015	NC_017066	TGT	2	6	240127	240132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383752172
5016	NC_017066	AAT	2	6	240176	240181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752172
5017	NC_017066	T	7	7	240193	240199	0 %	100 %	0 %	0 %	383752172
5018	NC_017066	A	6	6	240202	240207	100 %	0 %	0 %	0 %	383752172
5019	NC_017066	ATT	2	6	240212	240217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752172
5020	NC_017066	TTA	2	6	240285	240290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752172
5021	NC_017066	AAATAA	2	12	240340	240351	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	383752172
5022	NC_017066	AAG	2	6	240412	240417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752172
5023	NC_017066	AT	3	6	240493	240498	50 %	50 %	0 %	0 %	383752172
5024	NC_017066	TGA	2	6	240564	240569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752172
5025	NC_017066	TAT	2	6	240592	240597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752172
5026	NC_017066	ATC	2	6	240632	240637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752172
5027	NC_017066	TA	3	6	240649	240654	50 %	50 %	0 %	0 %	383752172
5028	NC_017066	TTA	2	6	240660	240665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752172
5029	NC_017066	ATT	2	6	240689	240694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752172
5030	NC_017066	TAA	2	6	240742	240747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752172
5031	NC_017066	AT	3	6	240787	240792	50 %	50 %	0 %	0 %	383752172
5032	NC_017066	ACTTT	2	10	240844	240853	20 %	60 %	0 %	20 %	383752172
5033	NC_017066	AT	3	6	240914	240919	50 %	50 %	0 %	0 %	383752172
5034	NC_017066	T	6	6	240942	240947	0 %	100 %	0 %	0 %	383752172
5035	NC_017066	T	6	6	240966	240971	0 %	100 %	0 %	0 %	383752172
5036	NC_017066	GAAG	2	8	241079	241086	50 %	0 %	50 %	0 %	383752173
5037	NC_017066	TCCA	2	8	241099	241106	25 %	25 %	0 %	50 %	383752173
5038	NC_017066	TTC	2	6	241108	241113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752173
5039	NC_017066	AAT	2	6	241120	241125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752173
5040	NC_017066	T	7	7	241198	241204	0 %	100 %	0 %	0 %	383752173
5041	NC_017066	TGT	2	6	241209	241214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383752173
5042	NC_017066	TTC	3	9	241219	241227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752173
5043	NC_017066	CAAG	2	8	241250	241257	50 %	0 %	25 %	25 %	383752173
5044	NC_017066	T	6	6	241341	241346	0 %	100 %	0 %	0 %	383752173
5045	NC_017066	CTT	2	6	241347	241352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752173
5046	NC_017066	CAT	2	6	241353	241358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752173
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5048	NC_017066	ATTAAT	2	12	241472	241483	50 %	50 %	0 %	0 %	383752174
5049	NC_017066	AT	3	6	241498	241503	50 %	50 %	0 %	0 %	383752174
5050	NC_017066	T	6	6	241503	241508	0 %	100 %	0 %	0 %	383752174
5051	NC_017066	TTAA	2	8	241539	241546	50 %	50 %	0 %	0 %	383752174
5052	NC_017066	TAT	2	6	241579	241584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752174
5053	NC_017066	ATTA	2	8	241595	241602	50 %	50 %	0 %	0 %	383752174
5054	NC_017066	GTT	2	6	241629	241634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383752174
5055	NC_017066	TAT	2	6	241640	241645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752174
5056	NC_017066	ATT	2	6	241683	241688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752174
5057	NC_017066	TCT	2	6	241689	241694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752174
5058	NC_017066	TAA	2	6	241697	241702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752174
5059	NC_017066	TAG	2	6	241705	241710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752174
5060	NC_017066	AATCTC	2	12	241751	241762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752174
5061	NC_017066	AT	3	6	241807	241812	50 %	50 %	0 %	0 %	383752174
5062	NC_017066	T	6	6	241819	241824	0 %	100 %	0 %	0 %	383752174
5063	NC_017066	ATA	2	6	241840	241845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752174
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5065	NC_017066	AT	3	6	241972	241977	50 %	50 %	0 %	0 %	383752174
5066	NC_017066	TTA	2	6	242023	242028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752174
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5068	NC_017066	TAC	2	6	242108	242113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752174
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5070	NC_017066	ATTT	2	8	242213	242220	25 %	75 %	0 %	0 %	383752174
5071	NC_017066	TA	3	6	242230	242235	50 %	50 %	0 %	0 %	383752174
5072	NC_017066	GTC	2	6	242262	242267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752174
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5080	NC_017066	T	7	7	242441	242447	0 %	100 %	0 %	0 %	383752174
5081	NC_017066	TTA	2	6	242487	242492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752174
5082	NC_017066	TAC	2	6	242510	242515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752174
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5089	NC_017066	T	6	6	242802	242807	0 %	100 %	0 %	0 %	383752174
5090	NC_017066	T	6	6	242826	242831	0 %	100 %	0 %	0 %	383752174
5091	NC_017066	TAAA	2	8	242835	242842	75 %	25 %	0 %	0 %	383752174
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5102	NC_017066	TAG	2	6	243130	243135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752174
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5104	NC_017066	TAT	2	6	243206	243211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752174
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5106	NC_017066	T	6	6	243225	243230	0 %	100 %	0 %	0 %	383752175
5107	NC_017066	AT	3	6	243257	243262	50 %	50 %	0 %	0 %	383752175
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5109	NC_017066	TGT	2	6	243338	243343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383752175
5110	NC_017066	T	6	6	243369	243374	0 %	100 %	0 %	0 %	383752175
5111	NC_017066	TAAA	2	8	243384	243391	75 %	25 %	0 %	0 %	383752175
5112	NC_017066	TCA	2	6	243467	243472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752175
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5114	NC_017066	AGAGT	2	10	243530	243539	40 %	20 %	40 %	0 %	383752175
5115	NC_017066	TTTA	2	8	243544	243551	25 %	75 %	0 %	0 %	383752175
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5120	NC_017066	AG	3	6	244085	244090	50 %	0 %	50 %	0 %	383752176
5121	NC_017066	TAT	2	6	244137	244142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752176
5122	NC_017066	TGA	2	6	244158	244163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752176
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5124	NC_017066	A	6	6	244186	244191	100 %	0 %	0 %	0 %	383752176
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5493	NC_017066	AAT	2	6	267357	267362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752189
5494	NC_017066	ATC	2	6	267370	267375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752189
5495	NC_017066	A	6	6	267468	267473	100 %	0 %	0 %	0 %	383752189
5496	NC_017066	GTTT	2	8	267485	267492	0 %	75 %	25 %	0 %	383752189
5497	NC_017066	TTA	2	6	267501	267506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752189
5498	NC_017066	TTA	2	6	267510	267515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752189
5499	NC_017066	AT	3	6	267548	267553	50 %	50 %	0 %	0 %	383752189
5500	NC_017066	GCA	4	12	267582	267593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752189

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