MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia slovaca str. D-CWPP chromosome

Total Repeats: 25070

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_017065	ACC	2	6	621311	621316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383751283
12502	NC_017065	GTT	2	6	621363	621368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383751283
12503	NC_017065	CAA	2	6	621381	621386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383751283
12504	NC_017065	ATTCAC	2	12	621425	621436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383751283
12505	NC_017065	CCGG	2	8	621440	621447	0 %	0 %	50 %	50 %	383751283
12506	NC_017065	TGA	2	6	621507	621512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383751283
12507	NC_017065	GGT	2	6	621584	621589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383751283
12508	NC_017065	TGC	2	6	621607	621612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383751283
12509	NC_017065	GAA	2	6	621647	621652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383751283
12510	NC_017065	CCG	2	6	621677	621682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383751283
12511	NC_017065	AAAG	2	8	621689	621696	75 %	0 %	25 %	0 %	383751283
12512	NC_017065	ATAA	2	8	621761	621768	75 %	25 %	0 %	0 %	383751283
12513	NC_017065	TAC	2	6	623505	623510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383751284
12514	NC_017065	AGG	2	6	623583	623588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383751284
12515	NC_017065	TAA	2	6	623598	623603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751284
12516	NC_017065	GCG	2	6	623615	623620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383751284
12517	NC_017065	TAA	3	9	623627	623635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751284
12518	NC_017065	CAAT	2	8	623648	623655	50 %	25 %	0 %	25 %	383751284
12519	NC_017065	ATT	2	6	623661	623666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751284
12520	NC_017065	AAAT	2	8	623690	623697	75 %	25 %	0 %	0 %	383751284
12521	NC_017065	CAAT	2	8	623708	623715	50 %	25 %	0 %	25 %	383751284
12522	NC_017065	ATTAA	2	10	625342	625351	60 %	40 %	0 %	0 %	383751285
12523	NC_017065	TAT	3	9	625413	625421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751285
12524	NC_017065	AAT	2	6	625428	625433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751285
12525	NC_017065	AAGA	2	8	625456	625463	75 %	0 %	25 %	0 %	383751285
12526	NC_017065	CAA	2	6	625466	625471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383751285
12527	NC_017065	A	6	6	625489	625494	100 %	0 %	0 %	0 %	383751285
12528	NC_017065	TTG	2	6	625499	625504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383751285
12529	NC_017065	AAT	2	6	625507	625512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751285
12530	NC_017065	AAGA	2	8	625563	625570	75 %	0 %	25 %	0 %	383751285
12531	NC_017065	A	6	6	625576	625581	100 %	0 %	0 %	0 %	383751285
12532	NC_017065	CAA	2	6	625594	625599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383751285
12533	NC_017065	TTAT	2	8	625743	625750	25 %	75 %	0 %	0 %	383751286
12534	NC_017065	ATT	2	6	625752	625757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751286
12535	NC_017065	TAA	2	6	625787	625792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751286
12536	NC_017065	AG	3	6	625811	625816	50 %	0 %	50 %	0 %	383751286
12537	NC_017065	A	6	6	625833	625838	100 %	0 %	0 %	0 %	383751286
12538	NC_017065	ATA	2	6	625851	625856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751286
12539	NC_017065	AAG	2	6	625879	625884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383751286
12540	NC_017065	ATA	2	6	625933	625938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751286
12541	NC_017065	AT	4	8	625966	625973	50 %	50 %	0 %	0 %	383751286
12542	NC_017065	ATC	2	6	626041	626046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383751286
12543	NC_017065	GTAAA	2	10	626053	626062	60 %	20 %	20 %	0 %	383751286
12544	NC_017065	AT	3	6	626093	626098	50 %	50 %	0 %	0 %	383751286
12545	NC_017065	GATAAT	2	12	626139	626150	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383751286
12546	NC_017065	AAG	2	6	626200	626205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383751286
12547	NC_017065	AGA	2	6	626225	626230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383751286
12548	NC_017065	AGT	2	6	626240	626245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383751286
12549	NC_017065	ATAA	2	8	626256	626263	75 %	25 %	0 %	0 %	383751286
12550	NC_017065	TAT	2	6	626283	626288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751286
12551	NC_017065	TAAT	2	8	626321	626328	50 %	50 %	0 %	0 %	383751286
12552	NC_017065	AT	3	6	626377	626382	50 %	50 %	0 %	0 %	383751287
12553	NC_017065	AGC	2	6	626390	626395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383751287
12554	NC_017065	GTA	2	6	626421	626426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383751287
12555	NC_017065	ATA	2	6	626487	626492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751287
12556	NC_017065	ATA	2	6	626556	626561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751287
12557	NC_017065	TC	4	8	626575	626582	0 %	50 %	0 %	50 %	383751287
12558	NC_017065	ATA	2	6	626604	626609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751287
12559	NC_017065	AGA	2	6	626656	626661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383751287
12560	NC_017065	TGC	2	6	626674	626679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383751287
12561	NC_017065	AGA	2	6	626700	626705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383751287
12562	NC_017065	ATGG	2	8	626725	626732	25 %	25 %	50 %	0 %	383751287
12563	NC_017065	AT	3	6	626779	626784	50 %	50 %	0 %	0 %	383751287
12564	NC_017065	TA	3	6	626887	626892	50 %	50 %	0 %	0 %	383751288
12565	NC_017065	GCC	2	6	626954	626959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383751288
12566	NC_017065	AT	3	6	626973	626978	50 %	50 %	0 %	0 %	383751288
12567	NC_017065	TGC	2	6	627028	627033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383751288
12568	NC_017065	GCA	2	6	627114	627119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383751288
12569	NC_017065	TG	3	6	627157	627162	0 %	50 %	50 %	0 %	383751288
12570	NC_017065	CTA	2	6	627226	627231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383751288
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12572	NC_017065	T	7	7	627284	627290	0 %	100 %	0 %	0 %	383751288
12573	NC_017065	GTAA	2	8	627349	627356	50 %	25 %	25 %	0 %	383751288
12574	NC_017065	ATTTT	2	10	627414	627423	20 %	80 %	0 %	0 %	383751288
12575	NC_017065	TAG	2	6	627523	627528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383751288
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12577	NC_017065	TTA	2	6	627538	627543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751288
12578	NC_017065	T	6	6	627573	627578	0 %	100 %	0 %	0 %	383751288
12579	NC_017065	ATAA	2	8	627593	627600	75 %	25 %	0 %	0 %	383751288
12580	NC_017065	CTA	2	6	627619	627624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383751288
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12582	NC_017065	TTTA	2	8	627875	627882	25 %	75 %	0 %	0 %	383751289
12583	NC_017065	CTT	2	6	627895	627900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383751289
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12586	NC_017065	ATG	2	6	627969	627974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383751289
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12589	NC_017065	A	7	7	628161	628167	100 %	0 %	0 %	0 %	383751289
12590	NC_017065	GTA	2	6	628169	628174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383751289
12591	NC_017065	AT	3	6	628175	628180	50 %	50 %	0 %	0 %	383751289
12592	NC_017065	TAT	2	6	628199	628204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751289
12593	NC_017065	TAT	2	6	628241	628246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751289
12594	NC_017065	TTA	2	6	628277	628282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751289
12595	NC_017065	AT	3	6	628368	628373	50 %	50 %	0 %	0 %	383751289
12596	NC_017065	CGC	2	6	628424	628429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383751289
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12599	NC_017065	GTTT	2	8	628526	628533	0 %	75 %	25 %	0 %	383751289
12600	NC_017065	CCTGCT	2	12	628546	628557	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	383751289
12601	NC_017065	AAT	3	9	628560	628568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751289
12602	NC_017065	TAA	2	6	628580	628585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751289
12603	NC_017065	T	6	6	628591	628596	0 %	100 %	0 %	0 %	383751289
12604	NC_017065	A	7	7	628611	628617	100 %	0 %	0 %	0 %	383751289
12605	NC_017065	TTTA	2	8	628626	628633	25 %	75 %	0 %	0 %	383751289
12606	NC_017065	AT	3	6	628659	628664	50 %	50 %	0 %	0 %	383751289
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12612	NC_017065	AAT	2	6	628849	628854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751289
12613	NC_017065	ACCGG	2	10	628858	628867	20 %	0 %	40 %	40 %	383751289
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12619	NC_017065	AT	3	6	629084	629089	50 %	50 %	0 %	0 %	383751290
12620	NC_017065	TTTGT	2	10	629106	629115	0 %	80 %	20 %	0 %	383751290
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