MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia slovaca str. D-CWPP chromosome

Total Repeats: 25070

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_017065	CTA	2	6	25584	25589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750665
503	NC_017065	AAT	2	6	25613	25618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750665
504	NC_017065	TTCA	2	8	25644	25651	25 %	50 %	0 %	25 %	383750665
505	NC_017065	ATTTAA	2	12	25654	25665	50 %	50 %	0 %	0 %	383750665
506	NC_017065	AAT	2	6	25676	25681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750665
507	NC_017065	TTA	2	6	25692	25697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750665
508	NC_017065	GAA	2	6	25738	25743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750665
509	NC_017065	TTA	2	6	25782	25787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750665
510	NC_017065	AAC	2	6	25795	25800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383750665
511	NC_017065	TTA	2	6	25908	25913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750665
512	NC_017065	TA	3	6	25956	25961	50 %	50 %	0 %	0 %	383750665
513	NC_017065	AAT	2	6	26009	26014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750665
514	NC_017065	AT	3	6	26013	26018	50 %	50 %	0 %	0 %	383750665
515	NC_017065	TAA	2	6	26074	26079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750665
516	NC_017065	AATA	2	8	26137	26144	75 %	25 %	0 %	0 %	383750665
517	NC_017065	GTT	2	6	26147	26152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383750665
518	NC_017065	ATA	2	6	26163	26168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750665
519	NC_017065	TAT	2	6	26230	26235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750665
520	NC_017065	TAC	2	6	26251	26256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750665
521	NC_017065	ATT	2	6	26274	26279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750665
522	NC_017065	TAAA	2	8	26283	26290	75 %	25 %	0 %	0 %	383750665
523	NC_017065	TCA	2	6	26302	26307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750665
524	NC_017065	ACA	2	6	27621	27626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383750666
525	NC_017065	AGA	2	6	27630	27635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750666
526	NC_017065	TTA	2	6	27752	27757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750666
527	NC_017065	GAA	2	6	27838	27843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750666
528	NC_017065	ATA	2	6	27847	27852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750666
529	NC_017065	TAT	2	6	27893	27898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750666
530	NC_017065	TAAT	2	8	27953	27960	50 %	50 %	0 %	0 %	383750666
531	NC_017065	TAC	2	6	27990	27995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750666
532	NC_017065	ATA	2	6	28001	28006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750666
533	NC_017065	TGA	2	6	28014	28019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750666
534	NC_017065	ATATT	2	10	28028	28037	40 %	60 %	0 %	0 %	383750666
535	NC_017065	A	6	6	28054	28059	100 %	0 %	0 %	0 %	383750666
536	NC_017065	ATATT	2	10	28066	28075	40 %	60 %	0 %	0 %	383750666
537	NC_017065	A	6	6	28089	28094	100 %	0 %	0 %	0 %	383750666
538	NC_017065	AAGA	2	8	28105	28112	75 %	0 %	25 %	0 %	383750666
539	NC_017065	TAG	2	6	28124	28129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750666
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541	NC_017065	TGC	2	6	28149	28154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383750666
542	NC_017065	AAAT	2	8	28197	28204	75 %	25 %	0 %	0 %	383750666
543	NC_017065	ATTA	2	8	28225	28232	50 %	50 %	0 %	0 %	383750666
544	NC_017065	GAT	2	6	28249	28254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750666
545	NC_017065	TAC	2	6	28274	28279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750666
546	NC_017065	ATT	2	6	28281	28286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750666
547	NC_017065	GAA	2	6	28368	28373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750667
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549	NC_017065	A	6	6	28712	28717	100 %	0 %	0 %	0 %	383750668
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551	NC_017065	AT	4	8	28734	28741	50 %	50 %	0 %	0 %	383750668
552	NC_017065	GAA	2	6	28753	28758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750668
553	NC_017065	CTT	2	6	28811	28816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383750668
554	NC_017065	CT	3	6	28827	28832	0 %	50 %	0 %	50 %	383750668
555	NC_017065	TAA	2	6	28833	28838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750668
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557	NC_017065	ATG	2	6	29390	29395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750669
558	NC_017065	TAAA	2	8	29405	29412	75 %	25 %	0 %	0 %	383750669
559	NC_017065	GCTA	2	8	29415	29422	25 %	25 %	25 %	25 %	383750669
560	NC_017065	TCA	2	6	29551	29556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750670
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564	NC_017065	T	7	7	29675	29681	0 %	100 %	0 %	0 %	383750670
565	NC_017065	TCT	2	6	29698	29703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383750670
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581	NC_017065	T	7	7	30155	30161	0 %	100 %	0 %	0 %	383750671
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591	NC_017065	A	6	6	30457	30462	100 %	0 %	0 %	0 %	383750672
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598	NC_017065	CAA	2	6	30913	30918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383750674
599	NC_017065	ATA	2	6	30945	30950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750674
600	NC_017065	TAA	2	6	31010	31015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750674
601	NC_017065	CAT	2	6	31028	31033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750674
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611	NC_017065	T	6	6	31593	31598	0 %	100 %	0 %	0 %	383750675
612	NC_017065	TAT	2	6	31629	31634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750675
613	NC_017065	ATA	2	6	31642	31647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750675
614	NC_017065	GTT	2	6	31786	31791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383750675
615	NC_017065	TCATT	2	10	31957	31966	20 %	60 %	0 %	20 %	383750676
616	NC_017065	T	6	6	31965	31970	0 %	100 %	0 %	0 %	383750676
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628	NC_017065	T	6	6	32378	32383	0 %	100 %	0 %	0 %	383750676
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