MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia slovaca str. D-CWPP chromosome

Total Repeats: 25070

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017065	TAA	2	6	230700	230705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750857
4502	NC_017065	ATAG	2	8	230734	230741	50 %	25 %	25 %	0 %	383750857
4503	NC_017065	GGA	2	6	230744	230749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383750857
4504	NC_017065	TAAT	2	8	230769	230776	50 %	50 %	0 %	0 %	383750857
4505	NC_017065	TCT	2	6	230780	230785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383750857
4506	NC_017065	TCA	3	9	230789	230797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750857
4507	NC_017065	ACA	2	6	230799	230804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383750857
4508	NC_017065	TAC	2	6	230878	230883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750857
4509	NC_017065	AGA	2	6	231012	231017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750858
4510	NC_017065	CAA	2	6	231034	231039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383750858
4511	NC_017065	GAA	2	6	231239	231244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750859
4512	NC_017065	TA	3	6	231279	231284	50 %	50 %	0 %	0 %	383750859
4513	NC_017065	T	6	6	231306	231311	0 %	100 %	0 %	0 %	383750859
4514	NC_017065	AGTC	2	8	231368	231375	25 %	25 %	25 %	25 %	383750859
4515	NC_017065	ATA	2	6	231405	231410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750860
4516	NC_017065	T	6	6	231489	231494	0 %	100 %	0 %	0 %	383750860
4517	NC_017065	A	6	6	231526	231531	100 %	0 %	0 %	0 %	383750861
4518	NC_017065	T	6	6	231616	231621	0 %	100 %	0 %	0 %	383750861
4519	NC_017065	T	6	6	231628	231633	0 %	100 %	0 %	0 %	383750861
4520	NC_017065	ATCC	2	8	231733	231740	25 %	25 %	0 %	50 %	383750861
4521	NC_017065	TTCT	2	8	231814	231821	0 %	75 %	0 %	25 %	383750861
4522	NC_017065	TCT	2	6	231905	231910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383750861
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4524	NC_017065	ATT	2	6	231946	231951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750861
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4526	NC_017065	T	7	7	231996	232002	0 %	100 %	0 %	0 %	383750861
4527	NC_017065	ATT	2	6	232004	232009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750861
4528	NC_017065	TAA	2	6	232011	232016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750861
4529	NC_017065	ATTAA	2	10	232022	232031	60 %	40 %	0 %	0 %	383750861
4530	NC_017065	TTTA	2	8	232036	232043	25 %	75 %	0 %	0 %	383750861
4531	NC_017065	TTTG	2	8	232342	232349	0 %	75 %	25 %	0 %	383750862
4532	NC_017065	ATT	2	6	232452	232457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750862
4533	NC_017065	AT	3	6	232466	232471	50 %	50 %	0 %	0 %	383750862
4534	NC_017065	T	8	8	232480	232487	0 %	100 %	0 %	0 %	383750862
4535	NC_017065	AAT	2	6	232532	232537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750862
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4537	NC_017065	CAT	2	6	232603	232608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750862
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4539	NC_017065	A	7	7	232694	232700	100 %	0 %	0 %	0 %	383750862
4540	NC_017065	GGC	2	6	232745	232750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383750862
4541	NC_017065	AT	3	6	232785	232790	50 %	50 %	0 %	0 %	383750862
4542	NC_017065	AAG	2	6	232822	232827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750862
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4545	NC_017065	TAG	2	6	233108	233113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750862
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4547	NC_017065	A	6	6	233192	233197	100 %	0 %	0 %	0 %	383750862
4548	NC_017065	ATT	2	6	233238	233243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750862
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4550	NC_017065	ATG	2	6	233256	233261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750862
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4552	NC_017065	ATTAG	2	10	233376	233385	40 %	40 %	20 %	0 %	383750862
4553	NC_017065	ATCT	2	8	233394	233401	25 %	50 %	0 %	25 %	383750862
4554	NC_017065	GATT	2	8	233443	233450	25 %	50 %	25 %	0 %	383750862
4555	NC_017065	ATA	2	6	233620	233625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750863
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4557	NC_017065	A	7	7	233636	233642	100 %	0 %	0 %	0 %	383750863
4558	NC_017065	AAT	3	9	233711	233719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750864
4559	NC_017065	T	6	6	233734	233739	0 %	100 %	0 %	0 %	383750864
4560	NC_017065	GTG	2	6	233748	233753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383750864
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4562	NC_017065	ATG	2	6	233867	233872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750864
4563	NC_017065	AGAA	2	8	233881	233888	75 %	0 %	25 %	0 %	383750864
4564	NC_017065	TAA	2	6	233901	233906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750864
4565	NC_017065	TTA	2	6	233970	233975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750864
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4605	NC_017065	A	6	6	236145	236150	100 %	0 %	0 %	0 %	383750868
4606	NC_017065	A	7	7	236214	236220	100 %	0 %	0 %	0 %	383750868
4607	NC_017065	A	7	7	236331	236337	100 %	0 %	0 %	0 %	383750868
4608	NC_017065	GTA	2	6	236338	236343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750868
4609	NC_017065	A	6	6	236347	236352	100 %	0 %	0 %	0 %	383750868
4610	NC_017065	TCAT	2	8	236395	236402	25 %	50 %	0 %	25 %	383750868
4611	NC_017065	GAA	2	6	236427	236432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750868
4612	NC_017065	TA	3	6	236515	236520	50 %	50 %	0 %	0 %	383750868
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4616	NC_017065	TTA	2	6	236676	236681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750869
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4619	NC_017065	TAG	3	9	236895	236903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750869
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4623	NC_017065	T	6	6	237077	237082	0 %	100 %	0 %	0 %	383750870
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