MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia slovaca str. D-CWPP chromosome

Total Repeats: 25070

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017065	ATT	2	6	13	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750642
2	NC_017065	GCA	2	6	58	63	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383750642
3	NC_017065	TAT	2	6	182	187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750642
4	NC_017065	ATT	2	6	274	279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750642
5	NC_017065	T	6	6	293	298	0 %	100 %	0 %	0 %	383750642
6	NC_017065	AATTAT	2	12	325	336	50 %	50 %	0 %	0 %	383750642
7	NC_017065	ATG	2	6	392	397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750642
8	NC_017065	ATA	2	6	433	438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750642
9	NC_017065	GTA	2	6	574	579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750642
10	NC_017065	TTA	2	6	587	592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750642
11	NC_017065	CAG	2	6	767	772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383750642
12	NC_017065	TAA	2	6	776	781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750642
13	NC_017065	AT	3	6	787	792	50 %	50 %	0 %	0 %	383750642
14	NC_017065	A	6	6	801	806	100 %	0 %	0 %	0 %	383750642
15	NC_017065	ATA	2	6	812	817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750642
16	NC_017065	ATA	2	6	1196	1201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750643
17	NC_017065	AAAGTA	2	12	1229	1240	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383750643
18	NC_017065	TGA	2	6	1255	1260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750643
19	NC_017065	GTA	2	6	1293	1298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750643
20	NC_017065	CAA	2	6	1355	1360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383750643
21	NC_017065	A	7	7	1359	1365	100 %	0 %	0 %	0 %	383750643
22	NC_017065	TAA	2	6	1384	1389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750643
23	NC_017065	TCT	2	6	1505	1510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383750644
24	NC_017065	A	6	6	1513	1518	100 %	0 %	0 %	0 %	383750644
25	NC_017065	TC	3	6	1523	1528	0 %	50 %	0 %	50 %	383750644
26	NC_017065	A	6	6	1583	1588	100 %	0 %	0 %	0 %	383750644
27	NC_017065	AT	3	6	1648	1653	50 %	50 %	0 %	0 %	383750644
28	NC_017065	TA	3	6	1766	1771	50 %	50 %	0 %	0 %	383750644
29	NC_017065	ATA	3	9	1769	1777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750644
30	NC_017065	A	7	7	1795	1801	100 %	0 %	0 %	0 %	383750644
31	NC_017065	GTA	2	6	1835	1840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750644
32	NC_017065	TGA	2	6	1935	1940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750644
33	NC_017065	GAA	2	6	1992	1997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750644
34	NC_017065	AAT	2	6	2022	2027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750644
35	NC_017065	AAG	2	6	2039	2044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750644
36	NC_017065	TTA	2	6	2077	2082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750644
37	NC_017065	CAA	3	9	2140	2148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383750644
38	NC_017065	T	8	8	2172	2179	0 %	100 %	0 %	0 %	383750645
39	NC_017065	A	6	6	2182	2187	100 %	0 %	0 %	0 %	383750645
40	NC_017065	T	6	6	2247	2252	0 %	100 %	0 %	0 %	383750645
41	NC_017065	T	6	6	2307	2312	0 %	100 %	0 %	0 %	383750645
42	NC_017065	T	6	6	2316	2321	0 %	100 %	0 %	0 %	383750645
43	NC_017065	GA	3	6	2334	2339	50 %	0 %	50 %	0 %	383750645
44	NC_017065	AGC	2	6	2392	2397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383750645
45	NC_017065	ATA	2	6	2437	2442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750645
46	NC_017065	A	7	7	2442	2448	100 %	0 %	0 %	0 %	383750645
47	NC_017065	T	7	7	2466	2472	0 %	100 %	0 %	0 %	383750645
48	NC_017065	TA	3	6	2498	2503	50 %	50 %	0 %	0 %	383750645
49	NC_017065	TTTTA	2	10	2538	2547	20 %	80 %	0 %	0 %	383750645
50	NC_017065	ATA	2	6	2575	2580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750645
51	NC_017065	TAA	2	6	2606	2611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750645
52	NC_017065	TG	3	6	2614	2619	0 %	50 %	50 %	0 %	383750645
53	NC_017065	TTAT	2	8	2699	2706	25 %	75 %	0 %	0 %	383750645
54	NC_017065	AT	3	6	2758	2763	50 %	50 %	0 %	0 %	383750645
55	NC_017065	ATG	2	6	2836	2841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750645
56	NC_017065	TAT	2	6	2856	2861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750645
57	NC_017065	TTA	2	6	2870	2875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750645
58	NC_017065	ATTTA	2	10	2891	2900	40 %	60 %	0 %	0 %	383750645
59	NC_017065	TTAT	2	8	2921	2928	25 %	75 %	0 %	0 %	383750645
60	NC_017065	A	6	6	2985	2990	100 %	0 %	0 %	0 %	383750646
61	NC_017065	CTC	2	6	3067	3072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383750646
62	NC_017065	TC	3	6	3071	3076	0 %	50 %	0 %	50 %	383750646
63	NC_017065	ATT	2	6	3078	3083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750646
64	NC_017065	ATT	2	6	3091	3096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750646
65	NC_017065	T	6	6	3134	3139	0 %	100 %	0 %	0 %	383750646
66	NC_017065	ATT	2	6	3204	3209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750646
67	NC_017065	A	7	7	3248	3254	100 %	0 %	0 %	0 %	383750646
68	NC_017065	A	6	6	3265	3270	100 %	0 %	0 %	0 %	383750646
69	NC_017065	AACT	2	8	3304	3311	50 %	25 %	0 %	25 %	383750646
70	NC_017065	CAAA	2	8	3350	3357	75 %	0 %	0 %	25 %	383750646
71	NC_017065	AGA	2	6	3377	3382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750646
72	NC_017065	AGA	2	6	3392	3397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750646
73	NC_017065	AGC	2	6	3407	3412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383750646
74	NC_017065	TGC	2	6	3419	3424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383750646
75	NC_017065	TG	3	6	3439	3444	0 %	50 %	50 %	0 %	383750646
76	NC_017065	A	7	7	3519	3525	100 %	0 %	0 %	0 %	383750646
77	NC_017065	A	7	7	3538	3544	100 %	0 %	0 %	0 %	383750646
78	NC_017065	GA	3	6	3546	3551	50 %	0 %	50 %	0 %	383750646
79	NC_017065	T	6	6	3575	3580	0 %	100 %	0 %	0 %	383750646
80	NC_017065	ATT	2	6	3610	3615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750646
81	NC_017065	TATT	2	8	3617	3624	25 %	75 %	0 %	0 %	383750646
82	NC_017065	GAG	2	6	3687	3692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383750646
83	NC_017065	TCGC	2	8	3747	3754	0 %	25 %	25 %	50 %	383750646
84	NC_017065	A	6	6	3790	3795	100 %	0 %	0 %	0 %	383750646
85	NC_017065	TAT	2	6	3848	3853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750646
86	NC_017065	GCA	2	6	3876	3881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383750646
87	NC_017065	AGA	2	6	3974	3979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750646
88	NC_017065	AT	3	6	4008	4013	50 %	50 %	0 %	0 %	383750646
89	NC_017065	CTA	2	6	4069	4074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750646
90	NC_017065	TAT	2	6	4125	4130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750646
91	NC_017065	TTA	2	6	4131	4136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750646
92	NC_017065	GGTCA	2	10	4138	4147	20 %	20 %	40 %	20 %	383750646
93	NC_017065	TGT	2	6	4151	4156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383750646
94	NC_017065	AT	3	6	4318	4323	50 %	50 %	0 %	0 %	383750646
95	NC_017065	AG	3	6	4337	4342	50 %	0 %	50 %	0 %	383750646
96	NC_017065	ATA	2	6	4345	4350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750646
97	NC_017065	TA	3	6	4425	4430	50 %	50 %	0 %	0 %	383750646
98	NC_017065	GGC	2	6	4596	4601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383750646
99	NC_017065	GCA	2	6	4620	4625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383750646
100	NC_017065	A	6	6	4647	4652	100 %	0 %	0 %	0 %	383750646
101	NC_017065	TA	3	6	4677	4682	50 %	50 %	0 %	0 %	383750646
102	NC_017065	GGA	2	6	4697	4702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383750646
103	NC_017065	GAA	2	6	4719	4724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750646
104	NC_017065	AAG	2	6	4750	4755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750646
105	NC_017065	AAT	2	6	4761	4766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750646
106	NC_017065	GAA	2	6	4767	4772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750646
107	NC_017065	TAA	2	6	4787	4792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750646
108	NC_017065	CTA	2	6	4811	4816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750646
109	NC_017065	TAAAT	2	10	4847	4856	60 %	40 %	0 %	0 %	383750646
110	NC_017065	GAG	2	6	4860	4865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383750646
111	NC_017065	AT	3	6	4869	4874	50 %	50 %	0 %	0 %	383750646
112	NC_017065	CAAAAC	2	12	5072	5083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383750646
113	NC_017065	TCAAT	2	10	5117	5126	40 %	40 %	0 %	20 %	383750646
114	NC_017065	GTAGT	2	10	5173	5182	20 %	40 %	40 %	0 %	383750646
115	NC_017065	AAG	2	6	5203	5208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750646
116	NC_017065	ACG	2	6	5212	5217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383750646
117	NC_017065	ATA	2	6	5239	5244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750646
118	NC_017065	ATT	2	6	5290	5295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750646
119	NC_017065	TAA	2	6	5312	5317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750646
120	NC_017065	AATA	2	8	5318	5325	75 %	25 %	0 %	0 %	383750646
121	NC_017065	GAT	2	6	5331	5336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750646
122	NC_017065	ATTC	2	8	5355	5362	25 %	50 %	0 %	25 %	383750646
123	NC_017065	TGC	2	6	5369	5374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383750646
124	NC_017065	T	6	6	5397	5402	0 %	100 %	0 %	0 %	383750646
125	NC_017065	ATT	2	6	5413	5418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750646
126	NC_017065	TGC	2	6	5426	5431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383750646
127	NC_017065	CTA	2	6	5521	5526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750646
128	NC_017065	AGT	2	6	5558	5563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750646
129	NC_017065	CGC	2	6	5584	5589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383750646
130	NC_017065	A	7	7	5607	5613	100 %	0 %	0 %	0 %	383750646
131	NC_017065	TTG	2	6	5620	5625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383750646
132	NC_017065	TTA	2	6	5649	5654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750646
133	NC_017065	ATA	2	6	5671	5676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750646
134	NC_017065	TAA	2	6	5740	5745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750646
135	NC_017065	ATA	2	6	5763	5768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750646
136	NC_017065	GAA	2	6	5769	5774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750646
137	NC_017065	A	6	6	5786	5791	100 %	0 %	0 %	0 %	383750646
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