MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia typhi str. B9991CWPP chromosome

Total Repeats: 22274

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_017062	ATATT	2	10	657601	657610	40 %	60 %	0 %	0 %	383843321
13502	NC_017062	GCT	2	6	657639	657644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383843321
13503	NC_017062	TTG	2	6	657686	657691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383843321
13504	NC_017062	TAA	2	6	657761	657766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843321
13505	NC_017062	A	6	6	657786	657791	100 %	0 %	0 %	0 %	383843321
13506	NC_017062	ATT	2	6	657809	657814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843321
13507	NC_017062	TCT	2	6	657885	657890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383843321
13508	NC_017062	TCA	2	6	658073	658078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843322
13509	NC_017062	ACT	2	6	658124	658129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843322
13510	NC_017062	ATCT	2	8	658132	658139	25 %	50 %	0 %	25 %	383843322
13511	NC_017062	ACCT	2	8	658225	658232	25 %	25 %	0 %	50 %	383843322
13512	NC_017062	CGT	2	6	658271	658276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383843322
13513	NC_017062	TTC	2	6	658279	658284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383843322
13514	NC_017062	GAA	2	6	658299	658304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383843322
13515	NC_017062	TGCTTT	2	12	658312	658323	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	383843322
13516	NC_017062	TGC	2	6	658331	658336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383843322
13517	NC_017062	AGT	2	6	658402	658407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843322
13518	NC_017062	CCA	2	6	658421	658426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383843322
13519	NC_017062	AGA	2	6	658432	658437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383843322
13520	NC_017062	TGC	2	6	658516	658521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383843322
13521	NC_017062	GACGCT	2	12	658625	658636	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	383843322
13522	NC_017062	GCA	2	6	658733	658738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383843322
13523	NC_017062	CTT	2	6	658749	658754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383843322
13524	NC_017062	AAT	2	6	658780	658785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843322
13525	NC_017062	TAA	2	6	658816	658821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843322
13526	NC_017062	ATT	2	6	658879	658884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843322
13527	NC_017062	ATT	2	6	658930	658935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843322
13528	NC_017062	CTT	2	6	658938	658943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383843322
13529	NC_017062	TTA	2	6	658961	658966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843322
13530	NC_017062	TAC	2	6	658981	658986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843322
13531	NC_017062	AAT	2	6	659038	659043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843322
13532	NC_017062	ATTTT	2	10	659114	659123	20 %	80 %	0 %	0 %	383843322
13533	NC_017062	ATG	2	6	659338	659343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843323
13534	NC_017062	CAG	2	6	659386	659391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383843323
13535	NC_017062	TTG	2	6	659410	659415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383843323
13536	NC_017062	ATT	2	6	659421	659426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843323
13537	NC_017062	GT	3	6	659488	659493	0 %	50 %	50 %	0 %	383843323
13538	NC_017062	TCC	2	6	659549	659554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383843323
13539	NC_017062	TAT	2	6	659581	659586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843323
13540	NC_017062	T	8	8	659637	659644	0 %	100 %	0 %	0 %	383843323
13541	NC_017062	ATT	2	6	659711	659716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843323
13542	NC_017062	TCT	2	6	659733	659738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383843323
13543	NC_017062	TAGCAT	2	12	659746	659757	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383843323
13544	NC_017062	CTT	2	6	659764	659769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383843323
13545	NC_017062	TTA	2	6	659844	659849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843323
13546	NC_017062	TAA	2	6	659867	659872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843323
13547	NC_017062	ACATT	2	10	659880	659889	40 %	40 %	0 %	20 %	383843323
13548	NC_017062	ATAA	2	8	659896	659903	75 %	25 %	0 %	0 %	383843323
13549	NC_017062	ATT	3	9	659960	659968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843323
13550	NC_017062	TTC	2	6	659984	659989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383843323
13551	NC_017062	ATA	2	6	660025	660030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843323
13552	NC_017062	GTG	2	6	660118	660123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383843323
13553	NC_017062	AGT	2	6	660194	660199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843323
13554	NC_017062	TAT	2	6	660226	660231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843323
13555	NC_017062	T	6	6	660231	660236	0 %	100 %	0 %	0 %	383843323
13556	NC_017062	CTG	2	6	660256	660261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383843323
13557	NC_017062	CTT	2	6	660271	660276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383843323
13558	NC_017062	AAT	2	6	660329	660334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843323
13559	NC_017062	TTG	2	6	660376	660381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383843323
13560	NC_017062	CTT	2	6	660433	660438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383843323
13561	NC_017062	T	7	7	660437	660443	0 %	100 %	0 %	0 %	383843323
13562	NC_017062	ACC	2	6	660445	660450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383843323
13563	NC_017062	ATTATC	2	12	660655	660666	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	383843324
13564	NC_017062	GAA	2	6	660764	660769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383843324
13565	NC_017062	TC	3	6	660770	660775	0 %	50 %	0 %	50 %	383843324
13566	NC_017062	CTTAG	2	10	660838	660847	20 %	40 %	20 %	20 %	383843324
13567	NC_017062	ATTTC	2	10	660881	660890	20 %	60 %	0 %	20 %	383843324
13568	NC_017062	T	6	6	660905	660910	0 %	100 %	0 %	0 %	383843324
13569	NC_017062	GGT	2	6	660985	660990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383843324
13570	NC_017062	TAC	2	6	661062	661067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843324
13571	NC_017062	TTTA	2	8	661240	661247	25 %	75 %	0 %	0 %	383843325
13572	NC_017062	TAAA	2	8	661256	661263	75 %	25 %	0 %	0 %	383843325
13573	NC_017062	TAA	2	6	661292	661297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843325
13574	NC_017062	TGG	2	6	661448	661453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383843325
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13576	NC_017062	T	6	6	661469	661474	0 %	100 %	0 %	0 %	383843325
13577	NC_017062	ATT	2	6	661484	661489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843325
13578	NC_017062	TTTA	2	8	661526	661533	25 %	75 %	0 %	0 %	383843325
13579	NC_017062	A	7	7	661550	661556	100 %	0 %	0 %	0 %	383843325
13580	NC_017062	TA	3	6	661598	661603	50 %	50 %	0 %	0 %	383843326
13581	NC_017062	AT	3	6	661604	661609	50 %	50 %	0 %	0 %	383843326
13582	NC_017062	AATT	2	8	661635	661642	50 %	50 %	0 %	0 %	383843326
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13584	NC_017062	TGT	2	6	661660	661665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383843326
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13586	NC_017062	ATT	2	6	662231	662236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843327
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13588	NC_017062	TAT	2	6	662271	662276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843327
13589	NC_017062	T	7	7	662362	662368	0 %	100 %	0 %	0 %	383843327
13590	NC_017062	TAA	2	6	662370	662375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843327
13591	NC_017062	ATT	2	6	662386	662391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843327
13592	NC_017062	TAT	2	6	662461	662466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843327
13593	NC_017062	TTA	2	6	662475	662480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843327
13594	NC_017062	TAG	3	9	662484	662492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843327
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13596	NC_017062	AATACC	2	12	662527	662538	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	383843327
13597	NC_017062	ATA	2	6	662540	662545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843327
13598	NC_017062	TAA	2	6	662549	662554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843327
13599	NC_017062	TTA	2	6	662555	662560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843327
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13601	NC_017062	TCA	2	6	662607	662612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843327
13602	NC_017062	CAT	2	6	662616	662621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843327
13603	NC_017062	CA	3	6	662655	662660	50 %	0 %	0 %	50 %	383843327
13604	NC_017062	CATTG	2	10	662665	662674	20 %	40 %	20 %	20 %	383843327
13605	NC_017062	ATT	2	6	662677	662682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843327
13606	NC_017062	ATA	2	6	662718	662723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843327
13607	NC_017062	TAT	2	6	662727	662732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843327
13608	NC_017062	TTA	2	6	662793	662798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843327
13609	NC_017062	CTT	2	6	662846	662851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383843327
13610	NC_017062	TAT	2	6	662904	662909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843327
13611	NC_017062	TCA	2	6	662951	662956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843327
13612	NC_017062	TTA	2	6	663171	663176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843328
13613	NC_017062	CTAA	2	8	663196	663203	50 %	25 %	0 %	25 %	383843328
13614	NC_017062	AGCGC	2	10	663226	663235	20 %	0 %	40 %	40 %	383843328
13615	NC_017062	T	7	7	663236	663242	0 %	100 %	0 %	0 %	383843328
13616	NC_017062	A	6	6	663250	663255	100 %	0 %	0 %	0 %	383843328
13617	NC_017062	T	6	6	663267	663272	0 %	100 %	0 %	0 %	383843328
13618	NC_017062	GTTTTA	2	12	663307	663318	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383843328
13619	NC_017062	TTTTA	2	10	663372	663381	20 %	80 %	0 %	0 %	383843328
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