MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia typhi str. B9991CWPP chromosome

Total Repeats: 22274

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_017062	TGT	2	6	561811	561816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383843255
11502	NC_017062	TGG	2	6	561838	561843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383843255
11503	NC_017062	TAA	2	6	561856	561861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843255
11504	NC_017062	TG	3	6	561865	561870	0 %	50 %	50 %	0 %	383843255
11505	NC_017062	TAA	2	6	561916	561921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843255
11506	NC_017062	AGC	2	6	561949	561954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383843255
11507	NC_017062	TAT	2	6	561984	561989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843255
11508	NC_017062	AAAT	2	8	562002	562009	75 %	25 %	0 %	0 %	383843255
11509	NC_017062	ACT	2	6	562090	562095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843255
11510	NC_017062	TAT	2	6	562099	562104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843255
11511	NC_017062	AT	3	6	562140	562145	50 %	50 %	0 %	0 %	383843255
11512	NC_017062	TAA	2	6	562191	562196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843255
11513	NC_017062	AGT	2	6	562252	562257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843255
11514	NC_017062	AT	3	6	562277	562282	50 %	50 %	0 %	0 %	383843255
11515	NC_017062	ATT	2	6	562307	562312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843255
11516	NC_017062	AAAT	2	8	562330	562337	75 %	25 %	0 %	0 %	383843255
11517	NC_017062	TAA	3	9	562453	562461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843255
11518	NC_017062	TAG	2	6	562462	562467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843255
11519	NC_017062	AGT	2	6	562474	562479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843255
11520	NC_017062	TAAAGA	2	12	562489	562500	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383843255
11521	NC_017062	TTA	2	6	562596	562601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843255
11522	NC_017062	TAC	2	6	562624	562629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843255
11523	NC_017062	ATT	2	6	562642	562647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843255
11524	NC_017062	TAGA	2	8	562692	562699	50 %	25 %	25 %	0 %	383843255
11525	NC_017062	T	6	6	562771	562776	0 %	100 %	0 %	0 %	383843255
11526	NC_017062	AATA	2	8	562789	562796	75 %	25 %	0 %	0 %	383843255
11527	NC_017062	CTG	2	6	562809	562814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383843255
11528	NC_017062	AGA	2	6	562834	562839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383843255
11529	NC_017062	AAT	3	9	562895	562903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843255
11530	NC_017062	AAG	2	6	562912	562917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383843255
11531	NC_017062	TGC	2	6	562921	562926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383843255
11532	NC_017062	TAA	2	6	562927	562932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843255
11533	NC_017062	TGC	2	6	562945	562950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383843255
11534	NC_017062	TGA	2	6	562954	562959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843255
11535	NC_017062	ATA	2	6	562962	562967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843255
11536	NC_017062	TAAAA	2	10	563002	563011	80 %	20 %	0 %	0 %	383843255
11537	NC_017062	TGC	2	6	563107	563112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383843255
11538	NC_017062	GTG	2	6	563157	563162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383843255
11539	NC_017062	AT	4	8	563184	563191	50 %	50 %	0 %	0 %	383843255
11540	NC_017062	TAA	3	9	563218	563226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843255
11541	NC_017062	T	6	6	563228	563233	0 %	100 %	0 %	0 %	383843255
11542	NC_017062	GT	3	6	563247	563252	0 %	50 %	50 %	0 %	383843255
11543	NC_017062	TTA	2	6	563325	563330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843255
11544	NC_017062	TAC	2	6	563386	563391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843255
11545	NC_017062	TAC	2	6	563419	563424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843255
11546	NC_017062	ATA	2	6	563433	563438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843255
11547	NC_017062	ATA	2	6	563451	563456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843255
11548	NC_017062	ATT	2	6	563535	563540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843255
11549	NC_017062	ATA	3	9	563552	563560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843255
11550	NC_017062	ACA	2	6	563651	563656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383843255
11551	NC_017062	GGT	3	9	563693	563701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383843255
11552	NC_017062	CTA	2	6	563706	563711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843255
11553	NC_017062	ATA	2	6	563715	563720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843255
11554	NC_017062	A	6	6	563759	563764	100 %	0 %	0 %	0 %	383843255
11555	NC_017062	AT	3	6	563809	563814	50 %	50 %	0 %	0 %	383843255
11556	NC_017062	ATT	2	6	564530	564535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843256
11557	NC_017062	ACA	2	6	564536	564541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383843256
11558	NC_017062	CATAG	2	10	564586	564595	40 %	20 %	20 %	20 %	383843256
11559	NC_017062	GCT	2	6	564605	564610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383843256
11560	NC_017062	TAA	2	6	564666	564671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843256
11561	NC_017062	CAC	2	6	564743	564748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383843256
11562	NC_017062	TAA	2	6	564821	564826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843256
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11564	NC_017062	CCG	2	6	564895	564900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383843256
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11567	NC_017062	CTT	2	6	565016	565021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383843256
11568	NC_017062	AAT	2	6	565189	565194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843256
11569	NC_017062	TAA	2	6	565251	565256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843256
11570	NC_017062	TAG	2	6	565337	565342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843256
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11572	NC_017062	AT	3	6	565381	565386	50 %	50 %	0 %	0 %	383843256
11573	NC_017062	AGT	4	12	565398	565409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843256
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11577	NC_017062	TAT	2	6	567422	567427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843257
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11582	NC_017062	TAT	3	9	567566	567574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843257
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11588	NC_017062	TTC	2	6	567719	567724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383843257
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11592	NC_017062	AAT	2	6	567788	567793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843257
11593	NC_017062	CATA	2	8	567803	567810	50 %	25 %	0 %	25 %	383843257
11594	NC_017062	TAA	2	6	567821	567826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843257
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11598	NC_017062	TGTGC	2	10	567898	567907	0 %	40 %	40 %	20 %	383843257
11599	NC_017062	TTC	2	6	567915	567920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383843257
11600	NC_017062	GTA	2	6	567923	567928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843257
11601	NC_017062	T	6	6	567963	567968	0 %	100 %	0 %	0 %	383843257
11602	NC_017062	CAT	2	6	567995	568000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843257
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11605	NC_017062	TAT	2	6	568157	568162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843258
11606	NC_017062	TCC	2	6	568173	568178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383843258
11607	NC_017062	CAT	3	9	568210	568218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843258
11608	NC_017062	TCT	2	6	568221	568226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383843258
11609	NC_017062	T	6	6	568250	568255	0 %	100 %	0 %	0 %	383843258
11610	NC_017062	ATC	2	6	568268	568273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843258
11611	NC_017062	TA	3	6	568304	568309	50 %	50 %	0 %	0 %	383843258
11612	NC_017062	TA	3	6	568378	568383	50 %	50 %	0 %	0 %	383843258
11613	NC_017062	ATA	2	6	568407	568412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843258
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11616	NC_017062	TAAA	2	8	568498	568505	75 %	25 %	0 %	0 %	383843258
11617	NC_017062	TAT	2	6	568585	568590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843258
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11619	NC_017062	CAT	2	6	568675	568680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843258
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