MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia typhi str. B9991CWPP chromosome

Total Repeats: 22274

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_017062	ATT	2	6	266887	266892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843024
5503	NC_017062	TA	3	6	266904	266909	50 %	50 %	0 %	0 %	383843024
5504	NC_017062	TTATA	2	10	266910	266919	40 %	60 %	0 %	0 %	383843024
5505	NC_017062	TAA	2	6	266924	266929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843024
5506	NC_017062	GATA	2	8	266946	266953	50 %	25 %	25 %	0 %	383843024
5507	NC_017062	TA	3	6	267129	267134	50 %	50 %	0 %	0 %	383843025
5508	NC_017062	TTGT	2	8	267145	267152	0 %	75 %	25 %	0 %	383843025
5509	NC_017062	GAT	2	6	267243	267248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843025
5510	NC_017062	GTC	2	6	267250	267255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383843025
5511	NC_017062	GGT	3	9	267318	267326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383843025
5512	NC_017062	TA	3	6	267373	267378	50 %	50 %	0 %	0 %	383843025
5513	NC_017062	TGCT	2	8	267496	267503	0 %	50 %	25 %	25 %	383843025
5514	NC_017062	T	6	6	267505	267510	0 %	100 %	0 %	0 %	383843025
5515	NC_017062	GGC	2	6	267559	267564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383843025
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5517	NC_017062	ATTTT	2	10	267717	267726	20 %	80 %	0 %	0 %	383843025
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5521	NC_017062	GTTT	2	8	267902	267909	0 %	75 %	25 %	0 %	383843025
5522	NC_017062	TTA	2	6	267918	267923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843025
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5528	NC_017062	ATC	2	6	268106	268111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843025
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5530	NC_017062	A	7	7	268393	268399	100 %	0 %	0 %	0 %	383843026
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5534	NC_017062	TGA	2	6	268473	268478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843026
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5539	NC_017062	TGA	2	6	268635	268640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843026
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5544	NC_017062	A	6	6	268801	268806	100 %	0 %	0 %	0 %	383843026
5545	NC_017062	TAC	2	6	268836	268841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843026
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5547	NC_017062	ATT	2	6	268916	268921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843026
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5549	NC_017062	AGCA	2	8	268973	268980	50 %	0 %	25 %	25 %	383843026
5550	NC_017062	A	6	6	269001	269006	100 %	0 %	0 %	0 %	383843026
5551	NC_017062	GAT	2	6	269034	269039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843026
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5554	NC_017062	AAT	2	6	269109	269114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843026
5555	NC_017062	TTTTGC	2	12	269115	269126	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	383843026
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5559	NC_017062	A	7	7	269234	269240	100 %	0 %	0 %	0 %	383843026
5560	NC_017062	A	7	7	269259	269265	100 %	0 %	0 %	0 %	383843026
5561	NC_017062	GAAA	2	8	269409	269416	75 %	0 %	25 %	0 %	383843027
5562	NC_017062	A	6	6	269436	269441	100 %	0 %	0 %	0 %	383843027
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5608	NC_017062	ATCAT	2	10	271031	271040	40 %	40 %	0 %	20 %	383843028
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5612	NC_017062	T	6	6	271237	271242	0 %	100 %	0 %	0 %	383843028
5613	NC_017062	TTAT	2	8	271250	271257	25 %	75 %	0 %	0 %	383843028
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5621	NC_017062	A	6	6	272482	272487	100 %	0 %	0 %	0 %	383843029
5622	NC_017062	ATTTTC	2	12	272492	272503	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	383843029
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5994	NC_017062	A	6	6	289318	289323	100 %	0 %	0 %	0 %	383843040
5995	NC_017062	TTA	2	6	289325	289330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843040
5996	NC_017062	AAT	2	6	289337	289342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843040
5997	NC_017062	AAT	2	6	289395	289400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843040
5998	NC_017062	A	9	9	289430	289438	100 %	0 %	0 %	0 %	383843041
5999	NC_017062	TAT	2	6	289448	289453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843041
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