MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella aquatilis HX2 plasmid PRA1

Total Repeats: 9998

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017060	GTC	2	6	235784	235789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527808
4002	NC_017060	AT	3	6	235828	235833	50 %	50 %	0 %	0 %	384527808
4003	NC_017060	GGC	2	6	236202	236207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527809
4004	NC_017060	ATGG	2	8	236292	236299	25 %	25 %	50 %	0 %	384527809
4005	NC_017060	T	7	7	236325	236331	0 %	100 %	0 %	0 %	384527809
4006	NC_017060	ATCA	2	8	236371	236378	50 %	25 %	0 %	25 %	384527809
4007	NC_017060	TCC	2	6	236422	236427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384527809
4008	NC_017060	A	6	6	236451	236456	100 %	0 %	0 %	0 %	384527810
4009	NC_017060	CGA	2	6	236458	236463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527810
4010	NC_017060	A	6	6	236551	236556	100 %	0 %	0 %	0 %	384527810
4011	NC_017060	ATT	2	6	236577	236582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527810
4012	NC_017060	GTT	2	6	236623	236628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527810
4013	NC_017060	GGAA	2	8	236635	236642	50 %	0 %	50 %	0 %	384527810
4014	NC_017060	GT	3	6	236654	236659	0 %	50 %	50 %	0 %	384527810
4015	NC_017060	GGA	2	6	236704	236709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384527810
4016	NC_017060	TAT	2	6	236710	236715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527810
4017	NC_017060	TGT	2	6	236756	236761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527810
4018	NC_017060	GTC	2	6	236780	236785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527810
4019	NC_017060	GAA	2	6	236798	236803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527810
4020	NC_017060	TGC	2	6	236824	236829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527810
4021	NC_017060	TGA	2	6	236901	236906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527810
4022	NC_017060	CGA	2	6	236932	236937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527810
4023	NC_017060	GCA	2	6	236971	236976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527810
4024	NC_017060	GATTTT	2	12	237104	237115	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384527810
4025	NC_017060	CGG	2	6	237124	237129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527810
4026	NC_017060	TTG	2	6	237174	237179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527810
4027	NC_017060	ATC	2	6	237242	237247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527810
4028	NC_017060	GT	3	6	237338	237343	0 %	50 %	50 %	0 %	384527810
4029	NC_017060	ACA	2	6	237442	237447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527810
4030	NC_017060	AT	3	6	237486	237491	50 %	50 %	0 %	0 %	384527810
4031	NC_017060	CCG	2	6	237606	237611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527810
4032	NC_017060	TGG	2	6	237618	237623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527810
4033	NC_017060	ATT	2	6	237670	237675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527810
4034	NC_017060	A	7	7	237774	237780	100 %	0 %	0 %	0 %	384527811
4035	NC_017060	AAC	2	6	237810	237815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527811
4036	NC_017060	T	7	7	237844	237850	0 %	100 %	0 %	0 %	384527811
4037	NC_017060	ACG	2	6	237926	237931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527811
4038	NC_017060	A	6	6	237938	237943	100 %	0 %	0 %	0 %	384527811
4039	NC_017060	TGG	2	6	237990	237995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527811
4040	NC_017060	ATT	2	6	238049	238054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527811
4041	NC_017060	CTG	2	6	238187	238192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527811
4042	NC_017060	ATG	2	6	238193	238198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527811
4043	NC_017060	CGG	2	6	238365	238370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527811
4044	NC_017060	ATT	2	6	238433	238438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527811
4045	NC_017060	TTA	2	6	238544	238549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527811
4046	NC_017060	A	7	7	238549	238555	100 %	0 %	0 %	0 %	384527811
4047	NC_017060	TTA	2	6	238580	238585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527811
4048	NC_017060	ATG	2	6	238586	238591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527811
4049	NC_017060	GGAAG	2	10	238594	238603	40 %	0 %	60 %	0 %	384527811
4050	NC_017060	CTG	2	6	238696	238701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527812
4051	NC_017060	A	8	8	238703	238710	100 %	0 %	0 %	0 %	384527812
4052	NC_017060	CTG	2	6	238713	238718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527812
4053	NC_017060	TGA	2	6	238782	238787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527812
4054	NC_017060	GAA	2	6	238918	238923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527812
4055	NC_017060	T	6	6	238945	238950	0 %	100 %	0 %	0 %	384527812
4056	NC_017060	T	7	7	238969	238975	0 %	100 %	0 %	0 %	384527812
4057	NC_017060	GC	3	6	239037	239042	0 %	0 %	50 %	50 %	384527812
4058	NC_017060	CAG	2	6	239047	239052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527812
4059	NC_017060	CT	4	8	239057	239064	0 %	50 %	0 %	50 %	384527812
4060	NC_017060	ACA	2	6	239244	239249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527812
4061	NC_017060	TGA	2	6	239327	239332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527812
4062	NC_017060	A	6	6	239345	239350	100 %	0 %	0 %	0 %	384527812
4063	NC_017060	GGCG	2	8	239355	239362	0 %	0 %	75 %	25 %	384527812
4064	NC_017060	GAA	2	6	239377	239382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527812
4065	NC_017060	TCTGGC	2	12	239574	239585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527812
4066	NC_017060	TGGC	2	8	239670	239677	0 %	25 %	50 %	25 %	384527813
4067	NC_017060	TGC	2	6	239681	239686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527813
4068	NC_017060	TGA	2	6	239723	239728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527813
4069	NC_017060	GTG	2	6	239814	239819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527813
4070	NC_017060	CG	4	8	239915	239922	0 %	0 %	50 %	50 %	384527813
4071	NC_017060	CAA	2	6	239936	239941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527813
4072	NC_017060	CAG	2	6	239963	239968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527813
4073	NC_017060	GCC	2	6	240058	240063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527813
4074	NC_017060	CAG	2	6	240081	240086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527813
4075	NC_017060	GCAG	2	8	240095	240102	25 %	0 %	50 %	25 %	384527813
4076	NC_017060	GCCT	2	8	240147	240154	0 %	25 %	25 %	50 %	384527813
4077	NC_017060	GCG	2	6	240222	240227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527813
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4080	NC_017060	AAC	2	6	240388	240393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527813
4081	NC_017060	CCA	2	6	240430	240435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527813
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4084	NC_017060	GTG	2	6	240678	240683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527813
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4087	NC_017060	TGA	2	6	241007	241012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527813
4088	NC_017060	TCG	2	6	241015	241020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527813
4089	NC_017060	TG	3	6	241032	241037	0 %	50 %	50 %	0 %	384527813
4090	NC_017060	TAT	2	6	241110	241115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527813
4091	NC_017060	ATA	2	6	241138	241143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527813
4092	NC_017060	ATG	2	6	241195	241200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527813
4093	NC_017060	CAA	2	6	241247	241252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527814
4094	NC_017060	TC	3	6	241290	241295	0 %	50 %	0 %	50 %	384527814
4095	NC_017060	TGCA	2	8	241301	241308	25 %	25 %	25 %	25 %	384527814
4096	NC_017060	GAA	2	6	241375	241380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527814
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4098	NC_017060	AC	3	6	241567	241572	50 %	0 %	0 %	50 %	384527815
4099	NC_017060	GC	3	6	241599	241604	0 %	0 %	50 %	50 %	384527815
4100	NC_017060	CAGA	2	8	241636	241643	50 %	0 %	25 %	25 %	384527815
4101	NC_017060	GCC	2	6	241702	241707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527815
4102	NC_017060	TGG	2	6	241708	241713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527815
4103	NC_017060	CTG	3	9	241807	241815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527815
4104	NC_017060	ACG	2	6	241819	241824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527815
4105	NC_017060	CGG	2	6	241865	241870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527815
4106	NC_017060	CTGT	2	8	241883	241890	0 %	50 %	25 %	25 %	384527815
4107	NC_017060	GCT	2	6	241911	241916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527815
4108	NC_017060	GCC	2	6	241925	241930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527815
4109	NC_017060	CAT	2	6	241968	241973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527815
4110	NC_017060	TCC	2	6	241978	241983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384527815
4111	NC_017060	CAC	2	6	241986	241991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527815
4112	NC_017060	TTCA	2	8	242038	242045	25 %	50 %	0 %	25 %	384527815
4113	NC_017060	TCA	2	6	242180	242185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527815
4114	NC_017060	CTG	2	6	242229	242234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527815
4115	NC_017060	CTG	2	6	242266	242271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527815
4116	NC_017060	CGG	2	6	242308	242313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527815
4117	NC_017060	T	6	6	242318	242323	0 %	100 %	0 %	0 %	384527815
4118	NC_017060	CA	3	6	242352	242357	50 %	0 %	0 %	50 %	384527815
4119	NC_017060	TTA	2	6	242438	242443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527815
4120	NC_017060	GC	3	6	242858	242863	0 %	0 %	50 %	50 %	384527815
4121	NC_017060	CCG	2	6	242899	242904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527815
4122	NC_017060	GCGCG	2	10	242975	242984	0 %	0 %	60 %	40 %	384527815
4123	NC_017060	ACGG	2	8	243121	243128	25 %	0 %	50 %	25 %	384527816
4124	NC_017060	AAC	2	6	243189	243194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527816
4125	NC_017060	CGC	2	6	243205	243210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527816
4126	NC_017060	TGT	2	6	243236	243241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527816
4127	NC_017060	CCG	2	6	243266	243271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527816
4128	NC_017060	A	6	6	243282	243287	100 %	0 %	0 %	0 %	384527816
4129	NC_017060	ATC	2	6	243314	243319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527816
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4131	NC_017060	GT	3	6	243364	243369	0 %	50 %	50 %	0 %	384527816
4132	NC_017060	CAT	2	6	243417	243422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527816
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4136	NC_017060	TGA	2	6	243690	243695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527816
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4139	NC_017060	CA	3	6	243844	243849	50 %	0 %	0 %	50 %	384527816
4140	NC_017060	CCGA	2	8	243896	243903	25 %	0 %	25 %	50 %	384527816
4141	NC_017060	ACGCAT	2	12	243917	243928	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384527816
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4145	NC_017060	CCG	2	6	244260	244265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527816
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4148	NC_017060	ATG	2	6	244356	244361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527816
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4151	NC_017060	TTTGT	2	10	244889	244898	0 %	80 %	20 %	0 %	384527817
4152	NC_017060	GAT	2	6	244903	244908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527817
4153	NC_017060	TAA	2	6	244977	244982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527817
4154	NC_017060	TCA	2	6	244983	244988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527817
4155	NC_017060	GCCA	2	8	244993	245000	25 %	0 %	25 %	50 %	384527817
4156	NC_017060	ATC	2	6	245006	245011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527817
4157	NC_017060	ATC	2	6	245023	245028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527817
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4159	NC_017060	CAGGCG	2	12	245103	245114	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384527818
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4162	NC_017060	GCG	2	6	245187	245192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527818
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4164	NC_017060	CCCGGC	2	12	245331	245342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527818
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4196	NC_017060	CTG	2	6	247165	247170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527820
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4219	NC_017060	CGG	2	6	248699	248704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527822
4220	NC_017060	ATC	2	6	248740	248745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527822
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4223	NC_017060	T	6	6	248887	248892	0 %	100 %	0 %	0 %	384527822
4224	NC_017060	TGG	2	6	248965	248970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527822
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4226	NC_017060	GC	3	6	249006	249011	0 %	0 %	50 %	50 %	384527822
4227	NC_017060	AGA	2	6	249171	249176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527822
4228	NC_017060	GCA	2	6	249207	249212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527822
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4230	NC_017060	CAC	2	6	249279	249284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527822
4231	NC_017060	CTG	2	6	249292	249297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527822
4232	NC_017060	CAG	2	6	249379	249384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527822
4233	NC_017060	CAG	2	6	249418	249423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527822
4234	NC_017060	GCC	2	6	249440	249445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527822
4235	NC_017060	CTGG	2	8	249516	249523	0 %	25 %	50 %	25 %	384527822
4236	NC_017060	GCTTT	2	10	249557	249566	0 %	60 %	20 %	20 %	384527822
4237	NC_017060	ACTT	2	8	249596	249603	25 %	50 %	0 %	25 %	384527822
4238	NC_017060	TCA	2	6	249685	249690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527823
4239	NC_017060	T	6	6	249754	249759	0 %	100 %	0 %	0 %	384527823
4240	NC_017060	CGC	2	6	249760	249765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527823
4241	NC_017060	TCAG	2	8	249780	249787	25 %	25 %	25 %	25 %	384527823
4242	NC_017060	GGC	2	6	249829	249834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527823
4243	NC_017060	TGC	2	6	249858	249863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527823
4244	NC_017060	GCG	2	6	250025	250030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527823
4245	NC_017060	CTGC	2	8	250057	250064	0 %	25 %	25 %	50 %	384527823
4246	NC_017060	A	6	6	250104	250109	100 %	0 %	0 %	0 %	384527823
4247	NC_017060	GC	3	6	250136	250141	0 %	0 %	50 %	50 %	384527823
4248	NC_017060	TGCC	2	8	250159	250166	0 %	25 %	25 %	50 %	384527823
4249	NC_017060	TCTG	2	8	250167	250174	0 %	50 %	25 %	25 %	384527823
4250	NC_017060	GCG	2	6	250376	250381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527823
4251	NC_017060	CTG	2	6	250427	250432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527823
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4254	NC_017060	GCTG	2	8	250626	250633	0 %	25 %	50 %	25 %	384527824
4255	NC_017060	GCA	2	6	250671	250676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527824
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4265	NC_017060	CTG	2	6	250912	250917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527824
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4273	NC_017060	GCCA	3	12	251342	251353	25 %	0 %	25 %	50 %	384527824
4274	NC_017060	CGG	2	6	251373	251378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527824
4275	NC_017060	TGGG	2	8	251380	251387	0 %	25 %	75 %	0 %	384527824
4276	NC_017060	T	6	6	251455	251460	0 %	100 %	0 %	0 %	384527825
4277	NC_017060	GTC	2	6	251520	251525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527825
4278	NC_017060	TGC	3	9	251568	251576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527825
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4354	NC_017060	CGC	2	6	254874	254879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527828
4355	NC_017060	CAGC	2	8	255009	255016	25 %	0 %	25 %	50 %	384527828
4356	NC_017060	CTG	2	6	255024	255029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527828
4357	NC_017060	GCA	2	6	255032	255037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527828
4358	NC_017060	TTCAG	2	10	255094	255103	20 %	40 %	20 %	20 %	384527828
4359	NC_017060	TGG	2	6	255240	255245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527829
4360	NC_017060	AACA	2	8	255256	255263	75 %	0 %	0 %	25 %	384527829
4361	NC_017060	ACAG	2	8	255312	255319	50 %	0 %	25 %	25 %	384527829
4362	NC_017060	TCT	2	6	255326	255331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527829
4363	NC_017060	AC	3	6	255343	255348	50 %	0 %	0 %	50 %	384527829
4364	NC_017060	GCG	2	6	255441	255446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527829
4365	NC_017060	ACA	2	6	255480	255485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527829
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4367	NC_017060	G	8	8	255532	255539	0 %	0 %	100 %	0 %	384527829
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4485	NC_017060	GGT	2	6	261573	261578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527833
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4487	NC_017060	CAG	2	6	261666	261671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527833
4488	NC_017060	AT	3	6	261835	261840	50 %	50 %	0 %	0 %	384527833
4489	NC_017060	GCA	2	6	261850	261855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527833
4490	NC_017060	ATTTT	2	10	261919	261928	20 %	80 %	0 %	0 %	384527833
4491	NC_017060	CGG	2	6	261961	261966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527833
4492	NC_017060	GCC	2	6	262237	262242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527833
4493	NC_017060	CAA	2	6	262268	262273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527833
4494	NC_017060	ATA	3	9	262333	262341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527833
4495	NC_017060	A	6	6	262793	262798	100 %	0 %	0 %	0 %	384527834
4496	NC_017060	CA	3	6	262806	262811	50 %	0 %	0 %	50 %	384527834
4497	NC_017060	CTAT	2	8	262847	262854	25 %	50 %	0 %	25 %	384527834
4498	NC_017060	ATT	2	6	262897	262902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527834
4499	NC_017060	A	6	6	262952	262957	100 %	0 %	0 %	0 %	384527834
4500	NC_017060	ATG	2	6	263006	263011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527834

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