MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella aquatilis HX2 plasmid PRA1

Total Repeats: 9998

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_017060	TCAA	2	8	120128	120135	50 %	25 %	0 %	25 %	384527696
2002	NC_017060	CGC	2	6	120238	120243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527696
2003	NC_017060	CTG	2	6	120292	120297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527696
2004	NC_017060	TTTC	2	8	120315	120322	0 %	75 %	0 %	25 %	384527696
2005	NC_017060	AT	3	6	120323	120328	50 %	50 %	0 %	0 %	384527696
2006	NC_017060	ATA	2	6	120374	120379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527696
2007	NC_017060	CAC	2	6	120385	120390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527696
2008	NC_017060	CAT	2	6	120408	120413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527696
2009	NC_017060	AGC	2	6	120437	120442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527696
2010	NC_017060	AACAAG	2	12	120487	120498	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384527696
2011	NC_017060	GAC	2	6	120503	120508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527696
2012	NC_017060	GC	3	6	121401	121406	0 %	0 %	50 %	50 %	384527697
2013	NC_017060	AC	3	6	121427	121432	50 %	0 %	0 %	50 %	384527697
2014	NC_017060	GGC	2	6	121434	121439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527697
2015	NC_017060	AGA	2	6	121444	121449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527697
2016	NC_017060	CCGT	2	8	121508	121515	0 %	25 %	25 %	50 %	384527697
2017	NC_017060	TAA	2	6	121541	121546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527697
2018	NC_017060	GAA	2	6	121629	121634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527697
2019	NC_017060	TC	3	6	121639	121644	0 %	50 %	0 %	50 %	384527697
2020	NC_017060	AATGA	2	10	121653	121662	60 %	20 %	20 %	0 %	384527697
2021	NC_017060	GC	3	6	121706	121711	0 %	0 %	50 %	50 %	384527697
2022	NC_017060	TTA	2	6	121731	121736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527697
2023	NC_017060	GTCA	2	8	121902	121909	25 %	25 %	25 %	25 %	384527698
2024	NC_017060	CTT	2	6	121922	121927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527698
2025	NC_017060	CCAG	2	8	121928	121935	25 %	0 %	25 %	50 %	384527698
2026	NC_017060	CGGTA	2	10	121962	121971	20 %	20 %	40 %	20 %	384527698
2027	NC_017060	ATC	2	6	122162	122167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527698
2028	NC_017060	CTG	2	6	122311	122316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527698
2029	NC_017060	GAC	2	6	122329	122334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527698
2030	NC_017060	ATC	2	6	122365	122370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527698
2031	NC_017060	GCG	2	6	122420	122425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527698
2032	NC_017060	CTG	2	6	122485	122490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527698
2033	NC_017060	TCG	2	6	122531	122536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527698
2034	NC_017060	TTC	2	6	122554	122559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527698
2035	NC_017060	GAA	2	6	122575	122580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527698
2036	NC_017060	GGC	2	6	122583	122588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527698
2037	NC_017060	ACT	2	6	122606	122611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527698
2038	NC_017060	CG	3	6	122687	122692	0 %	0 %	50 %	50 %	384527698
2039	NC_017060	GAA	2	6	122752	122757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527698
2040	NC_017060	TCA	2	6	122834	122839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527698
2041	NC_017060	GT	3	6	122850	122855	0 %	50 %	50 %	0 %	384527698
2042	NC_017060	GGCG	2	8	122874	122881	0 %	0 %	75 %	25 %	384527698
2043	NC_017060	TGA	2	6	122954	122959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527698
2044	NC_017060	GAATTT	2	12	122974	122985	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384527698
2045	NC_017060	TAC	2	6	123013	123018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527698
2046	NC_017060	CTT	2	6	123039	123044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527698
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2048	NC_017060	CGT	2	6	123202	123207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527698
2049	NC_017060	CTG	2	6	123208	123213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527698
2050	NC_017060	GAACTG	2	12	123214	123225	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384527698
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2052	NC_017060	CGA	2	6	123270	123275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527698
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2055	NC_017060	CAG	2	6	123505	123510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527699
2056	NC_017060	CAG	3	9	123514	123522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527699
2057	NC_017060	GTT	2	6	123568	123573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527699
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2059	NC_017060	GATA	2	8	123675	123682	50 %	25 %	25 %	0 %	384527699
2060	NC_017060	AGC	2	6	123688	123693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527699
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2062	NC_017060	C	6	6	123702	123707	0 %	0 %	0 %	100 %	384527699
2063	NC_017060	CAG	2	6	123789	123794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527699
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2094	NC_017060	TACGG	2	10	125757	125766	20 %	20 %	40 %	20 %	384527701
2095	NC_017060	AGAC	2	8	125792	125799	50 %	0 %	25 %	25 %	384527701
2096	NC_017060	TGCCG	2	10	125917	125926	0 %	20 %	40 %	40 %	384527701
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2100	NC_017060	GAC	2	6	126067	126072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527701
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2117	NC_017060	GGCT	2	8	126874	126881	0 %	25 %	50 %	25 %	384527701
2118	NC_017060	TGG	2	6	126887	126892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527701
2119	NC_017060	AC	3	6	126897	126902	50 %	0 %	0 %	50 %	384527701
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2121	NC_017060	CGT	2	6	127078	127083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527701
2122	NC_017060	TCA	2	6	127141	127146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527701
2123	NC_017060	TGAT	2	8	127149	127156	25 %	50 %	25 %	0 %	384527701
2124	NC_017060	GAC	2	6	127218	127223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527702
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2142	NC_017060	CTG	2	6	128187	128192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527703
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2220	NC_017060	A	6	6	133127	133132	100 %	0 %	0 %	0 %	384527705
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2223	NC_017060	AGGA	2	8	133194	133201	50 %	0 %	50 %	0 %	384527705
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2225	NC_017060	A	7	7	133394	133400	100 %	0 %	0 %	0 %	384527705
2226	NC_017060	A	6	6	133531	133536	100 %	0 %	0 %	0 %	384527706
2227	NC_017060	ATT	2	6	133593	133598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527706
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2234	NC_017060	A	7	7	133915	133921	100 %	0 %	0 %	0 %	384527706
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2240	NC_017060	A	7	7	134331	134337	100 %	0 %	0 %	0 %	384527706
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2366	NC_017060	ATCA	2	8	141242	141249	50 %	25 %	0 %	25 %	384527712
2367	NC_017060	ATT	2	6	141281	141286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527712
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2487	NC_017060	ATTG	2	8	152745	152752	25 %	50 %	25 %	0 %	384527717
2488	NC_017060	GCTG	2	8	152860	152867	0 %	25 %	50 %	25 %	384527717
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