MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella aquatilis HX2 plasmid PRA1

Total Repeats: 9998

< Previous12...891011121314151617181920Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9501	NC_017060	CAA	2	6	543349	543354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384528084
9502	NC_017060	CAA	2	6	543394	543399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384528084
9503	NC_017060	AGC	2	6	543480	543485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528084
9504	NC_017060	TCA	2	6	543610	543615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528084
9505	NC_017060	GGT	2	6	543634	543639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384528084
9506	NC_017060	AAT	2	6	543704	543709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384528084
9507	NC_017060	TTC	2	6	543710	543715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384528084
9508	NC_017060	TGA	2	6	543738	543743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528084
9509	NC_017060	GCC	2	6	543861	543866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528084
9510	NC_017060	CCA	2	6	543934	543939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384528084
9511	NC_017060	GAT	2	6	543968	543973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528084
9512	NC_017060	AGTC	2	8	543988	543995	25 %	25 %	25 %	25 %	384528084
9513	NC_017060	GCC	2	6	544127	544132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528085
9514	NC_017060	GATA	2	8	544138	544145	50 %	25 %	25 %	0 %	384528085
9515	NC_017060	TGA	2	6	544170	544175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528085
9516	NC_017060	CTG	2	6	544195	544200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528085
9517	NC_017060	TGC	2	6	544787	544792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528086
9518	NC_017060	GC	4	8	544852	544859	0 %	0 %	50 %	50 %	384528086
9519	NC_017060	ACG	2	6	544915	544920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528086
9520	NC_017060	CTG	2	6	545598	545603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528087
9521	NC_017060	ACG	2	6	545675	545680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528087
9522	NC_017060	TAT	2	6	545729	545734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384528087
9523	NC_017060	TGC	2	6	545744	545749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528087
9524	NC_017060	TGGC	2	8	545759	545766	0 %	25 %	50 %	25 %	384528087
9525	NC_017060	TGG	2	6	545773	545778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384528087
9526	NC_017060	GCA	2	6	545851	545856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528087
9527	NC_017060	CGC	2	6	545868	545873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528087
9528	NC_017060	GC	3	6	545938	545943	0 %	0 %	50 %	50 %	384528087
9529	NC_017060	AGC	2	6	545972	545977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528087
9530	NC_017060	CTTC	2	8	546084	546091	0 %	50 %	0 %	50 %	384528087
9531	NC_017060	GCG	2	6	546154	546159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528087
9532	NC_017060	CTG	2	6	546180	546185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528087
9533	NC_017060	GAA	2	6	546254	546259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384528087
9534	NC_017060	GCGTT	2	10	546264	546273	0 %	40 %	40 %	20 %	384528087
9535	NC_017060	CGGG	2	8	546284	546291	0 %	0 %	75 %	25 %	384528087
9536	NC_017060	ACG	2	6	546378	546383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528088
9537	NC_017060	GAC	2	6	546429	546434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528088
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9539	NC_017060	CG	3	6	546486	546491	0 %	0 %	50 %	50 %	384528088
9540	NC_017060	CGG	2	6	546498	546503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528088
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9542	NC_017060	GGT	2	6	546562	546567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384528088
9543	NC_017060	CAGC	2	8	546603	546610	25 %	0 %	25 %	50 %	384528088
9544	NC_017060	GC	3	6	546631	546636	0 %	0 %	50 %	50 %	384528088
9545	NC_017060	GTT	2	6	546682	546687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384528088
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9547	NC_017060	GAT	2	6	546840	546845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528088
9548	NC_017060	GAT	2	6	546868	546873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528088
9549	NC_017060	TGGT	2	8	546918	546925	0 %	50 %	50 %	0 %	384528088
9550	NC_017060	ATG	2	6	546931	546936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528088
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9553	NC_017060	CCA	2	6	547065	547070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384528088
9554	NC_017060	GC	3	6	547084	547089	0 %	0 %	50 %	50 %	384528088
9555	NC_017060	CCA	2	6	547113	547118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384528088
9556	NC_017060	GAT	2	6	547126	547131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528088
9557	NC_017060	GGC	2	6	547216	547221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528088
9558	NC_017060	CCG	2	6	547242	547247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528088
9559	NC_017060	ATC	2	6	547261	547266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528088
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9561	NC_017060	TGAA	2	8	547376	547383	50 %	25 %	25 %	0 %	384528088
9562	NC_017060	TCG	2	6	547451	547456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528088
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9567	NC_017060	GCA	2	6	547770	547775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528088
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9608	NC_017060	TAC	2	6	550319	550324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528090
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9619	NC_017060	AC	3	6	550816	550821	50 %	0 %	0 %	50 %	384528090
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