MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella aquatilis HX2 plasmid PRA1

Total Repeats: 9998

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_017060	AATG	2	8	517097	517104	50 %	25 %	25 %	0 %	384528060
9002	NC_017060	CGCA	2	8	517152	517159	25 %	0 %	25 %	50 %	384528060
9003	NC_017060	ACC	2	6	517288	517293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384528060
9004	NC_017060	TAT	2	6	517321	517326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384528060
9005	NC_017060	GCT	2	6	517331	517336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528060
9006	NC_017060	CTG	2	6	517376	517381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528060
9007	NC_017060	GCA	2	6	517382	517387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528060
9008	NC_017060	GTC	2	6	517457	517462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528060
9009	NC_017060	CAG	2	6	517470	517475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528060
9010	NC_017060	GCT	2	6	517478	517483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528060
9011	NC_017060	TGC	2	6	517510	517515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528060
9012	NC_017060	ATC	2	6	517546	517551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528060
9013	NC_017060	CTG	2	6	517552	517557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528060
9014	NC_017060	TGA	2	6	517585	517590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528060
9015	NC_017060	CTGA	2	8	517605	517612	25 %	25 %	25 %	25 %	384528060
9016	NC_017060	CGC	2	6	517689	517694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528060
9017	NC_017060	AAC	2	6	517701	517706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384528060
9018	NC_017060	GTGAA	2	10	517894	517903	40 %	20 %	40 %	0 %	384528060
9019	NC_017060	TGA	2	6	517934	517939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528060
9020	NC_017060	G	6	6	517961	517966	0 %	0 %	100 %	0 %	384528060
9021	NC_017060	ACG	2	6	517981	517986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528060
9022	NC_017060	GTG	2	6	518031	518036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384528060
9023	NC_017060	CCA	2	6	518041	518046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384528060
9024	NC_017060	A	6	6	518061	518066	100 %	0 %	0 %	0 %	384528060
9025	NC_017060	TGC	2	6	518081	518086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528060
9026	NC_017060	ACG	2	6	518093	518098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528060
9027	NC_017060	TGA	2	6	518126	518131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528060
9028	NC_017060	CGCCAT	2	12	518138	518149	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384528060
9029	NC_017060	CAT	2	6	518181	518186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528060
9030	NC_017060	GC	3	6	518206	518211	0 %	0 %	50 %	50 %	384528060
9031	NC_017060	GCC	2	6	518251	518256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528060
9032	NC_017060	GAT	2	6	518354	518359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528060
9033	NC_017060	CTG	2	6	518388	518393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528060
9034	NC_017060	TCCC	2	8	518408	518415	0 %	25 %	0 %	75 %	384528060
9035	NC_017060	CTG	2	6	518469	518474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528060
9036	NC_017060	CAG	2	6	518493	518498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528060
9037	NC_017060	TGCG	2	8	518548	518555	0 %	25 %	50 %	25 %	384528060
9038	NC_017060	GCTG	2	8	518631	518638	0 %	25 %	50 %	25 %	384528060
9039	NC_017060	GAT	2	6	518660	518665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528060
9040	NC_017060	AGC	2	6	518674	518679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528060
9041	NC_017060	GCA	2	6	518753	518758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528060
9042	NC_017060	GC	3	6	518771	518776	0 %	0 %	50 %	50 %	384528060
9043	NC_017060	GCT	2	6	518870	518875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528060
9044	NC_017060	CCCG	2	8	518957	518964	0 %	0 %	25 %	75 %	384528060
9045	NC_017060	CGT	3	9	519009	519017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528060
9046	NC_017060	GTG	2	6	519027	519032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384528060
9047	NC_017060	ATT	2	6	519150	519155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384528060
9048	NC_017060	TGA	2	6	519184	519189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528060
9049	NC_017060	GCC	2	6	519198	519203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528060
9050	NC_017060	TCCG	2	8	519262	519269	0 %	25 %	25 %	50 %	384528060
9051	NC_017060	ATC	2	6	519333	519338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528060
9052	NC_017060	TCC	2	6	519393	519398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384528060
9053	NC_017060	GTG	2	6	519417	519422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384528060
9054	NC_017060	GC	3	6	519462	519467	0 %	0 %	50 %	50 %	384528060
9055	NC_017060	CTG	2	6	519495	519500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528060
9056	NC_017060	GACC	2	8	519509	519516	25 %	0 %	25 %	50 %	384528060
9057	NC_017060	CTG	2	6	519519	519524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528060
9058	NC_017060	AAAGC	2	10	519532	519541	60 %	0 %	20 %	20 %	384528060
9059	NC_017060	AAC	2	6	519622	519627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384528060
9060	NC_017060	GC	3	6	519676	519681	0 %	0 %	50 %	50 %	384528061
9061	NC_017060	GACTG	2	10	519774	519783	20 %	20 %	40 %	20 %	384528061
9062	NC_017060	GAA	2	6	519794	519799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384528061
9063	NC_017060	TCA	2	6	519861	519866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528061
9064	NC_017060	GCTGGC	2	12	519892	519903	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384528061
9065	NC_017060	CAGC	2	8	519937	519944	25 %	0 %	25 %	50 %	384528061
9066	NC_017060	GCT	2	6	519945	519950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528061
9067	NC_017060	GCC	2	6	519952	519957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528061
9068	NC_017060	GCC	2	6	519962	519967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528061
9069	NC_017060	CAG	2	6	519971	519976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528061
9070	NC_017060	CAG	2	6	519980	519985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528061
9071	NC_017060	AGAA	2	8	520072	520079	75 %	0 %	25 %	0 %	384528061
9072	NC_017060	CA	3	6	520096	520101	50 %	0 %	0 %	50 %	384528061
9073	NC_017060	ATT	2	6	520149	520154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384528061
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9085	NC_017060	TGA	2	6	520744	520749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528061
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9087	NC_017060	TCAG	2	8	520887	520894	25 %	25 %	25 %	25 %	384528061
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9089	NC_017060	TATT	2	8	520982	520989	25 %	75 %	0 %	0 %	384528061
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9093	NC_017060	A	7	7	521119	521125	100 %	0 %	0 %	0 %	384528062
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9103	NC_017060	A	6	6	521713	521718	100 %	0 %	0 %	0 %	384528062
9104	NC_017060	ATC	2	6	521973	521978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528063
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