MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella aquatilis HX2 plasmid PRA1

Total Repeats: 9998

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_017060	AGC	2	6	488999	489004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528032
8502	NC_017060	T	7	7	489015	489021	0 %	100 %	0 %	0 %	384528032
8503	NC_017060	CTA	2	6	489120	489125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528032
8504	NC_017060	TCA	2	6	489195	489200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528032
8505	NC_017060	CCA	2	6	489249	489254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384528032
8506	NC_017060	TCA	2	6	489330	489335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528032
8507	NC_017060	GAT	2	6	489349	489354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528032
8508	NC_017060	TCG	2	6	489429	489434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528033
8509	NC_017060	TTCA	2	8	489620	489627	25 %	50 %	0 %	25 %	384528033
8510	NC_017060	CGG	2	6	489730	489735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528033
8511	NC_017060	GTG	2	6	489750	489755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384528033
8512	NC_017060	ACTG	2	8	489853	489860	25 %	25 %	25 %	25 %	384528033
8513	NC_017060	CG	4	8	489868	489875	0 %	0 %	50 %	50 %	384528033
8514	NC_017060	TGA	2	6	489905	489910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528033
8515	NC_017060	GCA	2	6	489933	489938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528033
8516	NC_017060	TTG	2	6	489962	489967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384528033
8517	NC_017060	TTC	2	6	490040	490045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384528033
8518	NC_017060	AAT	2	6	490061	490066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384528033
8519	NC_017060	CAAAT	2	10	490067	490076	60 %	20 %	0 %	20 %	384528033
8520	NC_017060	TTGA	2	8	490167	490174	25 %	50 %	25 %	0 %	384528033
8521	NC_017060	ACC	2	6	490208	490213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384528033
8522	NC_017060	GCC	2	6	490301	490306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528033
8523	NC_017060	AAC	2	6	490331	490336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384528033
8524	NC_017060	TTAA	2	8	490380	490387	50 %	50 %	0 %	0 %	384528034
8525	NC_017060	CAG	2	6	490398	490403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528034
8526	NC_017060	TGC	2	6	490441	490446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528034
8527	NC_017060	GTA	2	6	490481	490486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528034
8528	NC_017060	GA	3	6	490676	490681	50 %	0 %	50 %	0 %	384528034
8529	NC_017060	AGC	2	6	490717	490722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528034
8530	NC_017060	GACT	2	8	490783	490790	25 %	25 %	25 %	25 %	384528034
8531	NC_017060	CAG	2	6	490856	490861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528034
8532	NC_017060	CTT	2	6	490877	490882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384528034
8533	NC_017060	ATA	2	6	490893	490898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384528034
8534	NC_017060	GGT	2	6	490944	490949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384528034
8535	NC_017060	TAA	2	6	490991	490996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384528034
8536	NC_017060	ATT	2	6	491239	491244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384528035
8537	NC_017060	CGC	2	6	491247	491252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528035
8538	NC_017060	CAA	2	6	491283	491288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384528035
8539	NC_017060	ACCA	2	8	491348	491355	50 %	0 %	0 %	50 %	384528035
8540	NC_017060	A	6	6	491369	491374	100 %	0 %	0 %	0 %	384528035
8541	NC_017060	ATT	2	6	491586	491591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384528036
8542	NC_017060	A	8	8	491665	491672	100 %	0 %	0 %	0 %	384528036
8543	NC_017060	GAA	2	6	491738	491743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384528036
8544	NC_017060	TGG	2	6	491767	491772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384528036
8545	NC_017060	TCC	2	6	491867	491872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384528036
8546	NC_017060	GGA	2	6	491912	491917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384528036
8547	NC_017060	ACC	2	6	491984	491989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384528036
8548	NC_017060	CAT	2	6	492022	492027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528036
8549	NC_017060	TTG	2	6	492060	492065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384528036
8550	NC_017060	CCG	2	6	492135	492140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528036
8551	NC_017060	CTGA	2	8	492203	492210	25 %	25 %	25 %	25 %	384528036
8552	NC_017060	GCC	2	6	492212	492217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528036
8553	NC_017060	GAT	2	6	492235	492240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528036
8554	NC_017060	AT	3	6	492277	492282	50 %	50 %	0 %	0 %	384528036
8555	NC_017060	ATA	2	6	492294	492299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384528036
8556	NC_017060	AAC	2	6	492335	492340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384528036
8557	NC_017060	CTG	2	6	492422	492427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528036
8558	NC_017060	CT	3	6	492512	492517	0 %	50 %	0 %	50 %	384528036
8559	NC_017060	CCG	2	6	492553	492558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528036
8560	NC_017060	GCAG	2	8	492564	492571	25 %	0 %	50 %	25 %	384528036
8561	NC_017060	CAT	2	6	492625	492630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528036
8562	NC_017060	A	6	6	492644	492649	100 %	0 %	0 %	0 %	384528036
8563	NC_017060	TCT	2	6	493361	493366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384528037
8564	NC_017060	TCT	2	6	493388	493393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384528037
8565	NC_017060	CTGC	2	8	493422	493429	0 %	25 %	25 %	50 %	384528037
8566	NC_017060	GCC	2	6	493441	493446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528037
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8569	NC_017060	CGC	2	6	493689	493694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528037
8570	NC_017060	GAAAT	2	10	493719	493728	60 %	20 %	20 %	0 %	384528037
8571	NC_017060	GTT	2	6	493768	493773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384528038
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8573	NC_017060	GGT	3	9	493835	493843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384528038
8574	NC_017060	CGGT	2	8	493900	493907	0 %	25 %	50 %	25 %	384528038
8575	NC_017060	GC	3	6	493950	493955	0 %	0 %	50 %	50 %	384528038
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8583	NC_017060	CAGC	2	8	494432	494439	25 %	0 %	25 %	50 %	384528039
8584	NC_017060	TGC	2	6	494515	494520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528039
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8586	NC_017060	GAC	2	6	494595	494600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528039
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8588	NC_017060	ACCCG	2	10	494800	494809	20 %	0 %	20 %	60 %	384528039
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8591	NC_017060	GGAA	2	8	494945	494952	50 %	0 %	50 %	0 %	384528039
8592	NC_017060	TGGTC	2	10	494960	494969	0 %	40 %	40 %	20 %	384528039
8593	NC_017060	AAC	2	6	494974	494979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384528039
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8595	NC_017060	TGGC	2	8	495028	495035	0 %	25 %	50 %	25 %	384528039
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8601	NC_017060	GC	3	6	495226	495231	0 %	0 %	50 %	50 %	384528039
8602	NC_017060	TGC	2	6	495420	495425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528040
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8608	NC_017060	CGT	3	9	495619	495627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528040
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8612	NC_017060	GCC	2	6	495914	495919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528040
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8618	NC_017060	ATTGC	2	10	496129	496138	20 %	40 %	20 %	20 %	384528040
8619	NC_017060	GC	3	6	496151	496156	0 %	0 %	50 %	50 %	384528040
8620	NC_017060	GT	3	6	496191	496196	0 %	50 %	50 %	0 %	384528040
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