MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella aquatilis HX2 plasmid PRA1

Total Repeats: 9998

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_017060	CGG	2	6	461092	461097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528006
8002	NC_017060	C	6	6	461110	461115	0 %	0 %	0 %	100 %	384528006
8003	NC_017060	GTC	2	6	461121	461126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528006
8004	NC_017060	AGG	2	6	461296	461301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384528007
8005	NC_017060	A	7	7	461304	461310	100 %	0 %	0 %	0 %	384528007
8006	NC_017060	AG	3	6	461313	461318	50 %	0 %	50 %	0 %	384528007
8007	NC_017060	AGC	2	6	461346	461351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528007
8008	NC_017060	GAA	2	6	461369	461374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384528007
8009	NC_017060	CTT	2	6	461375	461380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384528007
8010	NC_017060	TAA	2	6	461408	461413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384528007
8011	NC_017060	ATA	2	6	461436	461441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384528007
8012	NC_017060	GTC	2	6	461820	461825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528008
8013	NC_017060	CAA	2	6	461848	461853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384528008
8014	NC_017060	ACTG	2	8	461858	461865	25 %	25 %	25 %	25 %	384528008
8015	NC_017060	AAATA	2	10	461876	461885	80 %	20 %	0 %	0 %	384528008
8016	NC_017060	CGGT	2	8	461944	461951	0 %	25 %	50 %	25 %	384528008
8017	NC_017060	TGGCA	2	10	461997	462006	20 %	20 %	40 %	20 %	384528008
8018	NC_017060	CCGT	2	8	462041	462048	0 %	25 %	25 %	50 %	384528008
8019	NC_017060	CGC	2	6	462155	462160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528008
8020	NC_017060	CG	3	6	462291	462296	0 %	0 %	50 %	50 %	384528008
8021	NC_017060	CGG	2	6	462406	462411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528008
8022	NC_017060	G	6	6	462442	462447	0 %	0 %	100 %	0 %	384528008
8023	NC_017060	TGC	2	6	462451	462456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528008
8024	NC_017060	GGT	2	6	462465	462470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384528008
8025	NC_017060	TGG	2	6	462730	462735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384528008
8026	NC_017060	ATT	2	6	462817	462822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384528008
8027	NC_017060	A	6	6	462825	462830	100 %	0 %	0 %	0 %	384528008
8028	NC_017060	CCTG	2	8	462833	462840	0 %	25 %	25 %	50 %	384528008
8029	NC_017060	TG	3	6	463003	463008	0 %	50 %	50 %	0 %	384528009
8030	NC_017060	GCA	2	6	463052	463057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528009
8031	NC_017060	CAGT	2	8	463103	463110	25 %	25 %	25 %	25 %	384528009
8032	NC_017060	TCA	2	6	463138	463143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528009
8033	NC_017060	TCC	2	6	463207	463212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384528009
8034	NC_017060	CGT	2	6	463222	463227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528009
8035	NC_017060	G	6	6	463314	463319	0 %	0 %	100 %	0 %	384528009
8036	NC_017060	AG	3	6	463327	463332	50 %	0 %	50 %	0 %	384528009
8037	NC_017060	TGA	2	6	463358	463363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528009
8038	NC_017060	CCG	2	6	463421	463426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528009
8039	NC_017060	ACCTC	2	10	463566	463575	20 %	20 %	0 %	60 %	384528010
8040	NC_017060	TAA	2	6	463584	463589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384528010
8041	NC_017060	TCT	2	6	463724	463729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384528010
8042	NC_017060	AGA	2	6	463760	463765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384528010
8043	NC_017060	CCA	2	6	463842	463847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384528010
8044	NC_017060	TCA	2	6	463890	463895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528010
8045	NC_017060	TGGC	2	8	463949	463956	0 %	25 %	50 %	25 %	384528010
8046	NC_017060	CTC	2	6	464598	464603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384528011
8047	NC_017060	AGTC	2	8	464610	464617	25 %	25 %	25 %	25 %	384528011
8048	NC_017060	GT	3	6	464838	464843	0 %	50 %	50 %	0 %	384528011
8049	NC_017060	TCAC	2	8	464860	464867	25 %	25 %	0 %	50 %	384528011
8050	NC_017060	CAT	2	6	464868	464873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528011
8051	NC_017060	GTT	2	6	464895	464900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384528011
8052	NC_017060	G	6	6	464936	464941	0 %	0 %	100 %	0 %	384528011
8053	NC_017060	CAT	2	6	464948	464953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528011
8054	NC_017060	GCG	2	6	464983	464988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528011
8055	NC_017060	CCT	2	6	465030	465035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384528011
8056	NC_017060	GAG	2	6	465111	465116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384528011
8057	NC_017060	GCG	2	6	465183	465188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528011
8058	NC_017060	AAT	2	6	465212	465217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384528011
8059	NC_017060	GAAT	2	8	465218	465225	50 %	25 %	25 %	0 %	384528011
8060	NC_017060	TGCCGT	2	12	465274	465285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528011
8061	NC_017060	TCTG	2	8	465343	465350	0 %	50 %	25 %	25 %	384528011
8062	NC_017060	CAGT	2	8	465401	465408	25 %	25 %	25 %	25 %	384528011
8063	NC_017060	TGC	2	6	465669	465674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528012
8064	NC_017060	ACA	2	6	465679	465684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384528012
8065	NC_017060	TGA	2	6	465714	465719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528012
8066	NC_017060	TTAT	2	8	465731	465738	25 %	75 %	0 %	0 %	384528012
8067	NC_017060	T	6	6	465801	465806	0 %	100 %	0 %	0 %	384528012
8068	NC_017060	CG	3	6	465860	465865	0 %	0 %	50 %	50 %	384528012
8069	NC_017060	CGG	2	6	465892	465897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528012
8070	NC_017060	GGT	2	6	465901	465906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384528012
8071	NC_017060	G	6	6	465908	465913	0 %	0 %	100 %	0 %	384528012
8072	NC_017060	CGG	2	6	465928	465933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528012
8073	NC_017060	ATT	2	6	466000	466005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384528012
8074	NC_017060	TTG	2	6	466089	466094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384528012
8075	NC_017060	ATC	2	6	466115	466120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528012
8076	NC_017060	GCCC	2	8	466130	466137	0 %	0 %	25 %	75 %	384528012
8077	NC_017060	GCA	2	6	466164	466169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528012
8078	NC_017060	GAT	2	6	466180	466185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528012
8079	NC_017060	CTG	2	6	466226	466231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528012
8080	NC_017060	GCC	2	6	466292	466297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528012
8081	NC_017060	TGC	2	6	466359	466364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528012
8082	NC_017060	CGA	2	6	466435	466440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528012
8083	NC_017060	TGG	2	6	466449	466454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384528012
8084	NC_017060	GTG	2	6	466505	466510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384528012
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8087	NC_017060	CTT	2	6	466879	466884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384528012
8088	NC_017060	GCCT	2	8	467031	467038	0 %	25 %	25 %	50 %	384528012
8089	NC_017060	ATC	2	6	467147	467152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528012
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8092	NC_017060	GC	3	6	467237	467242	0 %	0 %	50 %	50 %	384528012
8093	NC_017060	GAT	2	6	467249	467254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528012
8094	NC_017060	GAT	2	6	467282	467287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528012
8095	NC_017060	CTGC	2	8	467309	467316	0 %	25 %	25 %	50 %	384528012
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8102	NC_017060	GTT	2	6	467766	467771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384528013
8103	NC_017060	CAG	2	6	467796	467801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528013
8104	NC_017060	CGG	2	6	467808	467813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528013
8105	NC_017060	GTT	2	6	467889	467894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384528013
8106	NC_017060	GGA	2	6	467949	467954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384528013
8107	NC_017060	CTG	3	9	467971	467979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528013
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8109	NC_017060	CAGA	2	8	468080	468087	50 %	0 %	25 %	25 %	384528014
8110	NC_017060	CG	3	6	468115	468120	0 %	0 %	50 %	50 %	384528014
8111	NC_017060	GCG	2	6	468168	468173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528014
8112	NC_017060	CAG	2	6	468235	468240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528014
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8118	NC_017060	TCC	2	6	468437	468442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384528014
8119	NC_017060	CAG	2	6	468466	468471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528014
8120	NC_017060	CAG	2	6	468580	468585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528014
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8488	NC_017060	CGC	2	6	488301	488306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528032
8489	NC_017060	TTC	2	6	488386	488391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384528032
8490	NC_017060	CAG	2	6	488455	488460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528032
8491	NC_017060	AGC	2	6	488630	488635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528032
8492	NC_017060	GTT	2	6	488641	488646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384528032
8493	NC_017060	CAG	2	6	488665	488670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528032
8494	NC_017060	CAG	2	6	488719	488724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528032
8495	NC_017060	AGC	3	9	488738	488746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528032
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8499	NC_017060	AGC	2	6	488882	488887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528032
8500	NC_017060	CCG	2	6	488942	488947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528032

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