MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella aquatilis HX2 plasmid PRA1

Total Repeats: 9998

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017060	CGG	2	6	321540	321545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527884
5502	NC_017060	CGG	2	6	321600	321605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527884
5503	NC_017060	ATT	2	6	321719	321724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527884
5504	NC_017060	TTA	2	6	321747	321752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527884
5505	NC_017060	GCG	2	6	321761	321766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527884
5506	NC_017060	CGG	2	6	321787	321792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527884
5507	NC_017060	ATT	2	6	321806	321811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527884
5508	NC_017060	CTG	2	6	321830	321835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527884
5509	NC_017060	TG	3	6	321839	321844	0 %	50 %	50 %	0 %	384527884
5510	NC_017060	ATT	2	6	321865	321870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527884
5511	NC_017060	CT	3	6	321920	321925	0 %	50 %	0 %	50 %	384527884
5512	NC_017060	T	7	7	322172	322178	0 %	100 %	0 %	0 %	384527885
5513	NC_017060	CG	3	6	322196	322201	0 %	0 %	50 %	50 %	384527885
5514	NC_017060	TAA	2	6	322223	322228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527885
5515	NC_017060	CGC	2	6	322232	322237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527885
5516	NC_017060	CGG	2	6	322280	322285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527885
5517	NC_017060	TCG	2	6	322292	322297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527885
5518	NC_017060	CAC	2	6	322469	322474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527885
5519	NC_017060	CCTG	2	8	322514	322521	0 %	25 %	25 %	50 %	384527885
5520	NC_017060	GTC	2	6	322569	322574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527885
5521	NC_017060	GGC	2	6	322608	322613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527885
5522	NC_017060	CTT	2	6	322646	322651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527885
5523	NC_017060	CAA	2	6	322652	322657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527885
5524	NC_017060	CGG	2	6	322670	322675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527885
5525	NC_017060	GCC	2	6	322714	322719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527885
5526	NC_017060	CA	3	6	322785	322790	50 %	0 %	0 %	50 %	384527885
5527	NC_017060	TTC	2	6	322792	322797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527885
5528	NC_017060	CAC	2	6	322826	322831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527885
5529	NC_017060	GCAC	2	8	322834	322841	25 %	0 %	25 %	50 %	384527885
5530	NC_017060	CAA	2	6	322862	322867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527885
5531	NC_017060	ATTA	2	8	322911	322918	50 %	50 %	0 %	0 %	384527885
5532	NC_017060	CCGCG	2	10	323039	323048	0 %	0 %	40 %	60 %	384527885
5533	NC_017060	TGG	2	6	323141	323146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527885
5534	NC_017060	GC	4	8	323218	323225	0 %	0 %	50 %	50 %	384527885
5535	NC_017060	GC	3	6	323320	323325	0 %	0 %	50 %	50 %	384527885
5536	NC_017060	TG	3	6	323371	323376	0 %	50 %	50 %	0 %	384527885
5537	NC_017060	TGCG	2	8	323454	323461	0 %	25 %	50 %	25 %	384527885
5538	NC_017060	GCC	3	9	323635	323643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527886
5539	NC_017060	ACA	2	6	323674	323679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527886
5540	NC_017060	ATT	2	6	323715	323720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527886
5541	NC_017060	CAG	2	6	323753	323758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527886
5542	NC_017060	ACA	2	6	323777	323782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527886
5543	NC_017060	GAA	2	6	323803	323808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527886
5544	NC_017060	GC	3	6	323858	323863	0 %	0 %	50 %	50 %	384527886
5545	NC_017060	TGC	2	6	324020	324025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527886
5546	NC_017060	AGA	2	6	324057	324062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527886
5547	NC_017060	AGG	2	6	324110	324115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384527886
5548	NC_017060	TCG	2	6	324159	324164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527886
5549	NC_017060	GAT	2	6	324187	324192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527886
5550	NC_017060	TG	3	6	324247	324252	0 %	50 %	50 %	0 %	384527886
5551	NC_017060	CGG	3	9	324258	324266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527886
5552	NC_017060	GCA	3	9	324308	324316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527886
5553	NC_017060	T	6	6	324351	324356	0 %	100 %	0 %	0 %	384527886
5554	NC_017060	GGC	2	6	324374	324379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527886
5555	NC_017060	GCG	2	6	324380	324385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527886
5556	NC_017060	AAT	2	6	324458	324463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527886
5557	NC_017060	GAA	2	6	325086	325091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527887
5558	NC_017060	ACTG	2	8	325103	325110	25 %	25 %	25 %	25 %	384527887
5559	NC_017060	TTG	2	6	325114	325119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527887
5560	NC_017060	GC	3	6	325143	325148	0 %	0 %	50 %	50 %	384527887
5561	NC_017060	GCA	2	6	325154	325159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527887
5562	NC_017060	CGA	2	6	325169	325174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527887
5563	NC_017060	TGA	2	6	325223	325228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527887
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5565	NC_017060	GAAA	2	8	325250	325257	75 %	0 %	25 %	0 %	384527887
5566	NC_017060	A	7	7	325320	325326	100 %	0 %	0 %	0 %	384527887
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5569	NC_017060	CG	3	6	325406	325411	0 %	0 %	50 %	50 %	384527887
5570	NC_017060	CTGG	2	8	325666	325673	0 %	25 %	50 %	25 %	384527888
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5573	NC_017060	TAT	2	6	325788	325793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527888
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5575	NC_017060	ATGT	2	8	325826	325833	25 %	50 %	25 %	0 %	384527888
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5579	NC_017060	TTA	2	6	325948	325953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527888
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5586	NC_017060	GATA	3	12	326656	326667	50 %	25 %	25 %	0 %	384527889
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5593	NC_017060	CGATTT	2	12	326838	326849	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384527890
5594	NC_017060	AG	3	6	326854	326859	50 %	0 %	50 %	0 %	384527890
5595	NC_017060	TGA	2	6	326904	326909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527890
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5599	NC_017060	CAT	2	6	327340	327345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527891
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5602	NC_017060	AC	3	6	327832	327837	50 %	0 %	0 %	50 %	384527892
5603	NC_017060	CGC	2	6	327849	327854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527892
5604	NC_017060	CAA	2	6	327858	327863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527892
5605	NC_017060	GC	3	6	327889	327894	0 %	0 %	50 %	50 %	384527892
5606	NC_017060	AAT	2	6	327909	327914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527892
5607	NC_017060	CTGCT	2	10	327915	327924	0 %	40 %	20 %	40 %	384527892
5608	NC_017060	CAT	2	6	327942	327947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527892
5609	NC_017060	GGA	2	6	327960	327965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384527892
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5611	NC_017060	GCG	2	6	328018	328023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527892
5612	NC_017060	TGG	2	6	328049	328054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527892
5613	NC_017060	CCCG	2	8	328092	328099	0 %	0 %	25 %	75 %	384527892
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