MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia australis str. Cutlack chromosome

Total Repeats: 24412

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_017058	AT	3	6	215535	215540	50 %	50 %	0 %	0 %	383501130
4003	NC_017058	T	6	6	215540	215545	0 %	100 %	0 %	0 %	383501130
4004	NC_017058	ATA	2	6	215568	215573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501130
4005	NC_017058	A	6	6	215573	215578	100 %	0 %	0 %	0 %	383501130
4006	NC_017058	CAA	2	6	215583	215588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383501130
4007	NC_017058	A	6	6	215700	215705	100 %	0 %	0 %	0 %	383501130
4008	NC_017058	TAAAA	2	10	215765	215774	80 %	20 %	0 %	0 %	383501130
4009	NC_017058	AATA	2	8	215784	215791	75 %	25 %	0 %	0 %	383501130
4010	NC_017058	TAG	2	6	215797	215802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501130
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4012	NC_017058	AAT	2	6	215841	215846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501130
4013	NC_017058	AGG	2	6	215861	215866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383501130
4014	NC_017058	AAT	2	6	215889	215894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501130
4015	NC_017058	T	6	6	215927	215932	0 %	100 %	0 %	0 %	383501130
4016	NC_017058	T	6	6	215936	215941	0 %	100 %	0 %	0 %	383501130
4017	NC_017058	CCT	2	6	215973	215978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383501130
4018	NC_017058	GAA	2	6	216012	216017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501130
4019	NC_017058	AT	4	8	216034	216041	50 %	50 %	0 %	0 %	383501130
4020	NC_017058	TTAT	2	8	216070	216077	25 %	75 %	0 %	0 %	383501130
4021	NC_017058	TA	3	6	216091	216096	50 %	50 %	0 %	0 %	383501130
4022	NC_017058	AAAT	2	8	216114	216121	75 %	25 %	0 %	0 %	383501130
4023	NC_017058	AAT	2	6	216132	216137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501131
4024	NC_017058	TAA	2	6	216149	216154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501131
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4026	NC_017058	A	6	6	216174	216179	100 %	0 %	0 %	0 %	383501131
4027	NC_017058	TAA	2	6	216188	216193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501131
4028	NC_017058	AAT	2	6	216201	216206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501131
4029	NC_017058	CTA	2	6	216226	216231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501131
4030	NC_017058	AT	3	6	216293	216298	50 %	50 %	0 %	0 %	383501131
4031	NC_017058	TAA	2	6	216299	216304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501131
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4033	NC_017058	TTA	2	6	216343	216348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501131
4034	NC_017058	ATG	2	6	216349	216354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501131
4035	NC_017058	TAA	2	6	216385	216390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501131
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4037	NC_017058	AAT	2	6	216426	216431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501131
4038	NC_017058	ATA	2	6	216453	216458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501131
4039	NC_017058	A	6	6	216493	216498	100 %	0 %	0 %	0 %	383501131
4040	NC_017058	GAAAAA	2	12	216510	216521	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	383501131
4041	NC_017058	AT	3	6	216529	216534	50 %	50 %	0 %	0 %	383501131
4042	NC_017058	AGA	2	6	216553	216558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501131
4043	NC_017058	ATA	2	6	216570	216575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501131
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4045	NC_017058	TAA	2	6	216590	216595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501131
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4047	NC_017058	GAA	2	6	216629	216634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501131
4048	NC_017058	ATA	3	9	216637	216645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501131
4049	NC_017058	TGA	2	6	216647	216652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501131
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4051	NC_017058	AAGA	2	8	216669	216676	75 %	0 %	25 %	0 %	383501131
4052	NC_017058	TAA	2	6	216680	216685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501131
4053	NC_017058	A	6	6	216715	216720	100 %	0 %	0 %	0 %	383501131
4054	NC_017058	AT	3	6	216724	216729	50 %	50 %	0 %	0 %	383501131
4055	NC_017058	A	6	6	216874	216879	100 %	0 %	0 %	0 %	383501131
4056	NC_017058	ATAATG	2	12	216898	216909	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383501131
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4058	NC_017058	TCT	2	6	216974	216979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383501131
4059	NC_017058	A	8	8	216986	216993	100 %	0 %	0 %	0 %	383501131
4060	NC_017058	A	6	6	216995	217000	100 %	0 %	0 %	0 %	383501131
4061	NC_017058	AAAT	2	8	217033	217040	75 %	25 %	0 %	0 %	383501131
4062	NC_017058	ATAG	2	8	217075	217082	50 %	25 %	25 %	0 %	383501131
4063	NC_017058	A	6	6	217453	217458	100 %	0 %	0 %	0 %	383501132
4064	NC_017058	TAA	2	6	217460	217465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501132
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4067	NC_017058	GCA	2	6	217539	217544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383501132
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4069	NC_017058	TGC	2	6	217593	217598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383501132
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4071	NC_017058	TAT	2	6	217683	217688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501132
4072	NC_017058	TGC	2	6	217749	217754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383501132
4073	NC_017058	CAT	2	6	217758	217763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501132
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4078	NC_017058	TGC	2	6	217904	217909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383501132
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4084	NC_017058	A	6	6	218059	218064	100 %	0 %	0 %	0 %	383501132
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4093	NC_017058	ATG	2	6	218703	218708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501133
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4096	NC_017058	AG	3	6	218801	218806	50 %	0 %	50 %	0 %	383501133
4097	NC_017058	T	9	9	218824	218832	0 %	100 %	0 %	0 %	383501133
4098	NC_017058	A	6	6	218853	218858	100 %	0 %	0 %	0 %	383501133
4099	NC_017058	ATA	2	6	218905	218910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501133
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4102	NC_017058	GTAT	2	8	219199	219206	25 %	50 %	25 %	0 %	383501133
4103	NC_017058	AGA	2	6	219218	219223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501133
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4106	NC_017058	A	6	6	219582	219587	100 %	0 %	0 %	0 %	383501134
4107	NC_017058	TTG	2	6	219591	219596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383501134
4108	NC_017058	GAT	2	6	219612	219617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501134
4109	NC_017058	GA	3	6	219647	219652	50 %	0 %	50 %	0 %	383501134
4110	NC_017058	CAAAA	2	10	219985	219994	80 %	0 %	0 %	20 %	383501135
4111	NC_017058	A	6	6	220101	220106	100 %	0 %	0 %	0 %	383501136
4112	NC_017058	CAA	2	6	220116	220121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383501136
4113	NC_017058	ATT	2	6	220122	220127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501136
4114	NC_017058	AAG	2	6	220274	220279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501136
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4118	NC_017058	GAT	2	6	220443	220448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501136
4119	NC_017058	TTGG	2	8	220480	220487	0 %	50 %	50 %	0 %	383501136
4120	NC_017058	GCA	2	6	220532	220537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383501136
4121	NC_017058	GTC	2	6	220555	220560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383501136
4122	NC_017058	TGA	2	6	220619	220624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501136
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4124	NC_017058	ATG	2	6	220819	220824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501136
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4238	NC_017058	CTTT	2	8	226023	226030	0 %	75 %	0 %	25 %	383501142
4239	NC_017058	AAT	2	6	226053	226058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501142
4240	NC_017058	CTTTC	2	10	226063	226072	0 %	60 %	0 %	40 %	383501142
4241	NC_017058	TCT	2	6	226109	226114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383501142
4242	NC_017058	T	6	6	226142	226147	0 %	100 %	0 %	0 %	383501142
4243	NC_017058	ATC	2	6	226175	226180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501142
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4245	NC_017058	T	7	7	226656	226662	0 %	100 %	0 %	0 %	383501143
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4354	NC_017058	A	6	6	231964	231969	100 %	0 %	0 %	0 %	383501148
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4367	NC_017058	T	7	7	232609	232615	0 %	100 %	0 %	0 %	383501149
4368	NC_017058	TAA	2	6	232623	232628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501149
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4371	NC_017058	TTC	2	6	232749	232754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383501149
4372	NC_017058	T	6	6	232773	232778	0 %	100 %	0 %	0 %	383501149
4373	NC_017058	CTC	2	6	232785	232790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383501149
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4482	NC_017058	A	7	7	239660	239666	100 %	0 %	0 %	0 %	383501155
4483	NC_017058	TTAT	2	8	239675	239682	25 %	75 %	0 %	0 %	383501155
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4485	NC_017058	AT	4	8	239724	239731	50 %	50 %	0 %	0 %	383501155
4486	NC_017058	ATAA	2	8	239774	239781	75 %	25 %	0 %	0 %	383501155
4487	NC_017058	TTCTAT	2	12	239817	239828	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	383501155
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4489	NC_017058	CTTT	2	8	239987	239994	0 %	75 %	0 %	25 %	383501156
4490	NC_017058	CCAAAT	2	12	240020	240031	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	383501156
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4493	NC_017058	TAA	2	6	240111	240116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501156
4494	NC_017058	CATA	2	8	240117	240124	50 %	25 %	0 %	25 %	383501156
4495	NC_017058	AGC	2	6	240127	240132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383501156
4496	NC_017058	AAT	2	6	240247	240252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501156
4497	NC_017058	ATTTG	2	10	240257	240266	20 %	60 %	20 %	0 %	383501156
4498	NC_017058	TTTA	2	8	240277	240284	25 %	75 %	0 %	0 %	383501156
4499	NC_017058	TAA	2	6	240325	240330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501156
4500	NC_017058	AT	3	6	240352	240357	50 %	50 %	0 %	0 %	383501156

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