MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia australis str. Cutlack chromosome

Total Repeats: 24412

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017058	ATACT	2	10	191898	191907	40 %	40 %	0 %	20 %	383501104
3502	NC_017058	AGC	2	6	191933	191938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383501104
3503	NC_017058	T	6	6	191948	191953	0 %	100 %	0 %	0 %	383501104
3504	NC_017058	AGC	2	6	191972	191977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383501104
3505	NC_017058	T	6	6	192050	192055	0 %	100 %	0 %	0 %	383501105
3506	NC_017058	ATA	2	6	192085	192090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501105
3507	NC_017058	TTA	2	6	192113	192118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501105
3508	NC_017058	TAT	2	6	192119	192124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501105
3509	NC_017058	AATT	2	8	192141	192148	50 %	50 %	0 %	0 %	383501105
3510	NC_017058	ATA	2	6	192244	192249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501105
3511	NC_017058	AAATA	2	10	192293	192302	80 %	20 %	0 %	0 %	383501105
3512	NC_017058	GCT	2	6	192330	192335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383501105
3513	NC_017058	TATT	2	8	192368	192375	25 %	75 %	0 %	0 %	383501105
3514	NC_017058	TAT	2	6	192471	192476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501105
3515	NC_017058	TAT	2	6	192494	192499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501105
3516	NC_017058	ATTT	2	8	192512	192519	25 %	75 %	0 %	0 %	383501105
3517	NC_017058	AT	3	6	192564	192569	50 %	50 %	0 %	0 %	383501105
3518	NC_017058	AT	4	8	192580	192587	50 %	50 %	0 %	0 %	383501105
3519	NC_017058	AAAAC	2	10	192609	192618	80 %	0 %	0 %	20 %	383501105
3520	NC_017058	ATT	2	6	192622	192627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501105
3521	NC_017058	A	6	6	192631	192636	100 %	0 %	0 %	0 %	383501105
3522	NC_017058	A	6	6	192710	192715	100 %	0 %	0 %	0 %	383501105
3523	NC_017058	CAT	2	6	192723	192728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501105
3524	NC_017058	TAA	2	6	192750	192755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501106
3525	NC_017058	AT	4	8	192854	192861	50 %	50 %	0 %	0 %	383501106
3526	NC_017058	ATAA	2	8	192932	192939	75 %	25 %	0 %	0 %	383501106
3527	NC_017058	AT	3	6	193037	193042	50 %	50 %	0 %	0 %	383501106
3528	NC_017058	TAA	3	9	193093	193101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501106
3529	NC_017058	GAC	2	6	193116	193121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383501106
3530	NC_017058	T	7	7	193144	193150	0 %	100 %	0 %	0 %	383501106
3531	NC_017058	T	6	6	193184	193189	0 %	100 %	0 %	0 %	383501106
3532	NC_017058	ACA	2	6	193192	193197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383501106
3533	NC_017058	AAATC	2	10	193331	193340	60 %	20 %	0 %	20 %	383501106
3534	NC_017058	ATT	2	6	193402	193407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501106
3535	NC_017058	GTTTA	2	10	193499	193508	20 %	60 %	20 %	0 %	383501106
3536	NC_017058	ATT	2	6	193511	193516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501107
3537	NC_017058	TAC	2	6	193579	193584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501107
3538	NC_017058	ACT	2	6	193592	193597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501107
3539	NC_017058	TAA	2	6	193599	193604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501107
3540	NC_017058	ACT	2	6	193628	193633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501107
3541	NC_017058	AAT	2	6	193649	193654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501107
3542	NC_017058	T	6	6	193678	193683	0 %	100 %	0 %	0 %	383501107
3543	NC_017058	GAA	2	6	193693	193698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501107
3544	NC_017058	AGA	2	6	193715	193720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501107
3545	NC_017058	AGG	2	6	193915	193920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383501107
3546	NC_017058	ATG	2	6	193955	193960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501107
3547	NC_017058	TTA	2	6	194042	194047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501107
3548	NC_017058	TAT	2	6	194113	194118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501107
3549	NC_017058	GGA	2	6	194158	194163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383501107
3550	NC_017058	T	6	6	194165	194170	0 %	100 %	0 %	0 %	383501107
3551	NC_017058	TAA	2	6	194295	194300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501108
3552	NC_017058	A	7	7	194345	194351	100 %	0 %	0 %	0 %	383501108
3553	NC_017058	ATT	2	6	194362	194367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501108
3554	NC_017058	ATA	2	6	194406	194411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501108
3555	NC_017058	GAT	2	6	194468	194473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501108
3556	NC_017058	ATT	2	6	194475	194480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501108
3557	NC_017058	GAT	2	6	194729	194734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501109
3558	NC_017058	GTACTT	2	12	194747	194758	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383501109
3559	NC_017058	ATT	2	6	194797	194802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501109
3560	NC_017058	ATT	2	6	194896	194901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501110
3561	NC_017058	TTA	2	6	194961	194966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501110
3562	NC_017058	AGG	2	6	194998	195003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383501110
3563	NC_017058	GCAATT	2	12	195005	195016	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383501110
3564	NC_017058	ATT	2	6	195032	195037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501110
3565	NC_017058	AAC	2	6	195043	195048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383501110
3566	NC_017058	AG	3	6	195060	195065	50 %	0 %	50 %	0 %	383501110
3567	NC_017058	TTA	2	6	195078	195083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501110
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3571	NC_017058	GTAT	2	8	195682	195689	25 %	50 %	25 %	0 %	383501111
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3574	NC_017058	AGA	2	6	195873	195878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501112
3575	NC_017058	ATT	3	9	195886	195894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501112
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3577	NC_017058	A	7	7	195962	195968	100 %	0 %	0 %	0 %	383501112
3578	NC_017058	TTATA	2	10	195969	195978	40 %	60 %	0 %	0 %	383501113
3579	NC_017058	A	6	6	195984	195989	100 %	0 %	0 %	0 %	383501113
3580	NC_017058	AT	3	6	196049	196054	50 %	50 %	0 %	0 %	383501113
3581	NC_017058	TAT	2	6	196062	196067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501113
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3583	NC_017058	CGT	2	6	196111	196116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383501113
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3585	NC_017058	TTTG	2	8	196174	196181	0 %	75 %	25 %	0 %	383501113
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3588	NC_017058	TAA	2	6	196216	196221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501113
3589	NC_017058	CAT	2	6	196285	196290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501113
3590	NC_017058	TAAAA	2	10	196376	196385	80 %	20 %	0 %	0 %	383501113
3591	NC_017058	GATA	2	8	196391	196398	50 %	25 %	25 %	0 %	383501113
3592	NC_017058	AGA	2	6	196427	196432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501113
3593	NC_017058	AGC	2	6	196508	196513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383501113
3594	NC_017058	GTA	2	6	196533	196538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501113
3595	NC_017058	TTA	2	6	196653	196658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501113
3596	NC_017058	ATT	2	6	196666	196671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501113
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3599	NC_017058	TTTCTT	2	12	196987	196998	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	383501114
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3601	NC_017058	TCA	2	6	197016	197021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501114
3602	NC_017058	ATA	2	6	197055	197060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501114
3603	NC_017058	CAA	2	6	197065	197070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383501114
3604	NC_017058	GCC	2	6	197075	197080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383501114
3605	NC_017058	CTT	2	6	197122	197127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383501114
3606	NC_017058	ATTG	2	8	197142	197149	25 %	50 %	25 %	0 %	383501114
3607	NC_017058	GCTT	2	8	197151	197158	0 %	50 %	25 %	25 %	383501114
3608	NC_017058	AT	3	6	197208	197213	50 %	50 %	0 %	0 %	383501115
3609	NC_017058	T	6	6	197239	197244	0 %	100 %	0 %	0 %	383501115
3610	NC_017058	TGTTC	2	10	197307	197316	0 %	60 %	20 %	20 %	383501115
3611	NC_017058	TTA	2	6	197319	197324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501115
3612	NC_017058	AGC	2	6	197353	197358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383501115
3613	NC_017058	TCT	2	6	197366	197371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383501115
3614	NC_017058	CTTTA	2	10	197380	197389	20 %	60 %	0 %	20 %	383501115
3615	NC_017058	TAT	2	6	197421	197426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501115
3616	NC_017058	ATA	2	6	197464	197469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501115
3617	NC_017058	TA	3	6	197468	197473	50 %	50 %	0 %	0 %	383501115
3618	NC_017058	ATT	2	6	197482	197487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501115
3619	NC_017058	TA	3	6	197490	197495	50 %	50 %	0 %	0 %	383501115
3620	NC_017058	T	9	9	197525	197533	0 %	100 %	0 %	0 %	383501115
3621	NC_017058	ATT	2	6	197566	197571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501115
3622	NC_017058	ATC	2	6	197572	197577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501115
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3624	NC_017058	AT	3	6	197608	197613	50 %	50 %	0 %	0 %	383501115
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