MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia australis str. Cutlack chromosome

Total Repeats: 24412

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11502	NC_017058	TAATAT	2	12	613074	613085	50 %	50 %	0 %	0 %	383501516
11503	NC_017058	GTG	2	6	613088	613093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383501516
11504	NC_017058	TAT	2	6	613113	613118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501516
11505	NC_017058	GGC	2	6	613119	613124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383501516
11506	NC_017058	ATA	2	6	613225	613230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501516
11507	NC_017058	TAAT	2	8	613256	613263	50 %	50 %	0 %	0 %	383501516
11508	NC_017058	ATAA	2	8	613273	613280	75 %	25 %	0 %	0 %	383501516
11509	NC_017058	GGT	2	6	613381	613386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383501516
11510	NC_017058	GCAAG	2	10	613399	613408	40 %	0 %	40 %	20 %	383501516
11511	NC_017058	AGA	2	6	613458	613463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501516
11512	NC_017058	TAAA	2	8	613706	613713	75 %	25 %	0 %	0 %	383501516
11513	NC_017058	GATT	2	8	613803	613810	25 %	50 %	25 %	0 %	383501516
11514	NC_017058	TAG	2	6	613989	613994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501516
11515	NC_017058	CATG	2	8	614037	614044	25 %	25 %	25 %	25 %	383501516
11516	NC_017058	TAG	2	6	614075	614080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501516
11517	NC_017058	TAA	2	6	614088	614093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501516
11518	NC_017058	AT	3	6	614215	614220	50 %	50 %	0 %	0 %	383501516
11519	NC_017058	A	8	8	614249	614256	100 %	0 %	0 %	0 %	383501516
11520	NC_017058	TGCGG	2	10	614266	614275	0 %	20 %	60 %	20 %	383501516
11521	NC_017058	CAG	2	6	614479	614484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383501517
11522	NC_017058	TAA	2	6	614492	614497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501517
11523	NC_017058	TTG	2	6	614521	614526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383501517
11524	NC_017058	CAA	2	6	614533	614538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383501517
11525	NC_017058	ATT	2	6	614549	614554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501517
11526	NC_017058	AATCA	2	10	614574	614583	60 %	20 %	0 %	20 %	383501517
11527	NC_017058	A	6	6	614583	614588	100 %	0 %	0 %	0 %	383501517
11528	NC_017058	CCT	2	6	614604	614609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383501517
11529	NC_017058	TGC	2	6	614630	614635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383501517
11530	NC_017058	TAA	2	6	614671	614676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501517
11531	NC_017058	AGA	2	6	614741	614746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501517
11532	NC_017058	ATT	2	6	614782	614787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501517
11533	NC_017058	GAT	2	6	614796	614801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501517
11534	NC_017058	TGA	2	6	614813	614818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501517
11535	NC_017058	A	6	6	614896	614901	100 %	0 %	0 %	0 %	383501518
11536	NC_017058	TTA	2	6	614970	614975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501518
11537	NC_017058	T	6	6	614996	615001	0 %	100 %	0 %	0 %	383501518
11538	NC_017058	TGC	2	6	615014	615019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383501518
11539	NC_017058	AAG	2	6	615022	615027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501518
11540	NC_017058	ATG	2	6	615094	615099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501518
11541	NC_017058	TAG	2	6	615115	615120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501518
11542	NC_017058	CTT	2	6	615151	615156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383501518
11543	NC_017058	CTTTCT	2	12	615168	615179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383501518
11544	NC_017058	GAT	2	6	615180	615185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501518
11545	NC_017058	AGT	2	6	615219	615224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501518
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11547	NC_017058	AT	3	6	615574	615579	50 %	50 %	0 %	0 %	383501519
11548	NC_017058	CTT	3	9	615598	615606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383501519
11549	NC_017058	TTG	2	6	615607	615612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383501519
11550	NC_017058	T	6	6	615626	615631	0 %	100 %	0 %	0 %	383501519
11551	NC_017058	ATA	2	6	615645	615650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501519
11552	NC_017058	TCT	2	6	615712	615717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383501519
11553	NC_017058	TGAAGC	2	12	615779	615790	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383501519
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11555	NC_017058	TAT	2	6	615937	615942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501519
11556	NC_017058	TCA	2	6	615948	615953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501519
11557	NC_017058	T	6	6	616017	616022	0 %	100 %	0 %	0 %	383501519
11558	NC_017058	CTT	3	9	616078	616086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383501519
11559	NC_017058	ATT	2	6	616097	616102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501519
11560	NC_017058	TTA	2	6	616114	616119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501519
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11566	NC_017058	A	7	7	616627	616633	100 %	0 %	0 %	0 %	383501520
11567	NC_017058	GAG	2	6	616694	616699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383501520
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11571	NC_017058	CTTA	2	8	616920	616927	25 %	50 %	0 %	25 %	383501520
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11594	NC_017058	A	6	6	617952	617957	100 %	0 %	0 %	0 %	383501520
11595	NC_017058	TAT	2	6	618004	618009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501520
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11606	NC_017058	TGA	2	6	618487	618492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501520
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