MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia australis str. Cutlack chromosome

Total Repeats: 24412

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_017058	CCT	3	9	587253	587261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383501492
11002	NC_017058	ATA	2	6	587272	587277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501492
11003	NC_017058	CGC	2	6	587290	587295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383501492
11004	NC_017058	CAC	2	6	587296	587301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383501492
11005	NC_017058	CGC	2	6	587332	587337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383501492
11006	NC_017058	CAC	3	9	587338	587346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383501492
11007	NC_017058	TCCGCC	2	12	587366	587377	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	383501492
11008	NC_017058	ACC	2	6	587378	587383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383501492
11009	NC_017058	TAC	2	6	587432	587437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501492
11010	NC_017058	A	6	6	587442	587447	100 %	0 %	0 %	0 %	383501492
11011	NC_017058	TAA	2	6	587488	587493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501492
11012	NC_017058	A	6	6	587510	587515	100 %	0 %	0 %	0 %	383501492
11013	NC_017058	A	6	6	587530	587535	100 %	0 %	0 %	0 %	383501492
11014	NC_017058	TGC	2	6	587569	587574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383501492
11015	NC_017058	TAA	2	6	587672	587677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501492
11016	NC_017058	TAG	3	9	587732	587740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501492
11017	NC_017058	AGT	2	6	587742	587747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501492
11018	NC_017058	GAG	2	6	587821	587826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383501492
11019	NC_017058	CAT	2	6	587890	587895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501492
11020	NC_017058	CTAA	2	8	588906	588913	50 %	25 %	0 %	25 %	383501493
11021	NC_017058	TATCAA	2	12	588928	588939	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383501493
11022	NC_017058	ACT	2	6	588969	588974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501493
11023	NC_017058	T	6	6	588974	588979	0 %	100 %	0 %	0 %	383501493
11024	NC_017058	TAA	2	6	589007	589012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501493
11025	NC_017058	CCG	2	6	589020	589025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383501493
11026	NC_017058	TAA	2	6	589048	589053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501493
11027	NC_017058	CTC	2	6	589087	589092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383501493
11028	NC_017058	ATC	2	6	589197	589202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501493
11029	NC_017058	ATTA	2	8	589268	589275	50 %	50 %	0 %	0 %	383501493
11030	NC_017058	TCT	3	9	589284	589292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383501493
11031	NC_017058	CATT	2	8	589348	589355	25 %	50 %	0 %	25 %	383501493
11032	NC_017058	TA	3	6	589364	589369	50 %	50 %	0 %	0 %	383501493
11033	NC_017058	CTA	2	6	589524	589529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501494
11034	NC_017058	TCT	2	6	589598	589603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383501494
11035	NC_017058	GCT	2	6	589625	589630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383501494
11036	NC_017058	TAA	2	6	589707	589712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501494
11037	NC_017058	TA	3	6	589744	589749	50 %	50 %	0 %	0 %	383501494
11038	NC_017058	CTT	2	6	589782	589787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383501494
11039	NC_017058	GCT	2	6	589841	589846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383501494
11040	NC_017058	TTG	2	6	589909	589914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383501494
11041	NC_017058	GAA	2	6	589943	589948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501494
11042	NC_017058	T	8	8	589953	589960	0 %	100 %	0 %	0 %	383501494
11043	NC_017058	GAA	3	9	589974	589982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501494
11044	NC_017058	ATT	2	6	590011	590016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501494
11045	NC_017058	AAG	2	6	590050	590055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501494
11046	NC_017058	TTA	2	6	590061	590066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501494
11047	NC_017058	AAG	2	6	590125	590130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501494
11048	NC_017058	AGC	2	6	590140	590145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383501494
11049	NC_017058	TAAA	2	8	590341	590348	75 %	25 %	0 %	0 %	383501495
11050	NC_017058	T	6	6	590372	590377	0 %	100 %	0 %	0 %	383501495
11051	NC_017058	TCA	2	6	590382	590387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501495
11052	NC_017058	TGA	2	6	590414	590419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501495
11053	NC_017058	A	8	8	590445	590452	100 %	0 %	0 %	0 %	383501495
11054	NC_017058	TA	3	6	590460	590465	50 %	50 %	0 %	0 %	383501495
11055	NC_017058	TGC	2	6	590507	590512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383501495
11056	NC_017058	ATTG	2	8	590519	590526	25 %	50 %	25 %	0 %	383501495
11057	NC_017058	GAT	2	6	590544	590549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501495
11058	NC_017058	ATA	2	6	590569	590574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501495
11059	NC_017058	GGTA	2	8	590630	590637	25 %	25 %	50 %	0 %	383501495
11060	NC_017058	AGG	2	6	590648	590653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383501495
11061	NC_017058	GAGCAA	2	12	590659	590670	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	383501495
11062	NC_017058	AATTT	2	10	590674	590683	40 %	60 %	0 %	0 %	383501495
11063	NC_017058	ACA	2	6	590721	590726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383501495
11064	NC_017058	AGAT	2	8	590828	590835	50 %	25 %	25 %	0 %	383501495
11065	NC_017058	AT	3	6	590834	590839	50 %	50 %	0 %	0 %	383501495
11066	NC_017058	TTAT	2	8	590876	590883	25 %	75 %	0 %	0 %	383501495
11067	NC_017058	TAAAGA	2	12	590933	590944	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383501495
11068	NC_017058	AAAAT	2	10	591010	591019	80 %	20 %	0 %	0 %	383501495
11069	NC_017058	ATTT	2	8	591040	591047	25 %	75 %	0 %	0 %	383501495
11070	NC_017058	TATTC	2	10	591058	591067	20 %	60 %	0 %	20 %	383501495
11071	NC_017058	TAA	2	6	591098	591103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501495
11072	NC_017058	TGT	2	6	591200	591205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383501495
11073	NC_017058	ATA	2	6	591208	591213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501495
11074	NC_017058	AT	3	6	591215	591220	50 %	50 %	0 %	0 %	383501495
11075	NC_017058	ATTA	2	8	591231	591238	50 %	50 %	0 %	0 %	383501495
11076	NC_017058	AAAT	2	8	591284	591291	75 %	25 %	0 %	0 %	383501495
11077	NC_017058	GGTTTA	2	12	591312	591323	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	383501495
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11079	NC_017058	AT	3	6	591869	591874	50 %	50 %	0 %	0 %	383501496
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11081	NC_017058	AGTT	2	8	592772	592779	25 %	50 %	25 %	0 %	383501498
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11084	NC_017058	TGA	2	6	592817	592822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501498
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11087	NC_017058	GCTA	2	8	592994	593001	25 %	25 %	25 %	25 %	383501499
11088	NC_017058	TTC	2	6	593021	593026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383501499
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11091	NC_017058	TAT	2	6	593104	593109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501499
11092	NC_017058	AAAAT	2	10	593131	593140	80 %	20 %	0 %	0 %	383501499
11093	NC_017058	ATT	2	6	593141	593146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501499
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11100	NC_017058	ATT	2	6	593340	593345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501499
11101	NC_017058	T	6	6	593361	593366	0 %	100 %	0 %	0 %	383501499
11102	NC_017058	TTA	2	6	593398	593403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501499
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11105	NC_017058	GTG	2	6	593523	593528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383501499
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11108	NC_017058	TAG	2	6	593690	593695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501499
11109	NC_017058	A	6	6	593715	593720	100 %	0 %	0 %	0 %	383501499
11110	NC_017058	AGC	2	6	593726	593731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383501499
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11117	NC_017058	A	6	6	594077	594082	100 %	0 %	0 %	0 %	383501499
11118	NC_017058	TTAC	2	8	594102	594109	25 %	50 %	0 %	25 %	383501499
11119	NC_017058	A	6	6	594134	594139	100 %	0 %	0 %	0 %	383501499
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11250	NC_017058	TGCTTT	2	12	599809	599820	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	383501504
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